New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2438760 = | 104 (1.030) | 3 (0.030) | 3/510 | NT | 2.6% | coding (813/996 nt) | flk | putative flagella assembly protein |
? | NC_000913 | 2439230 = | 118 (1.180) | coding (889/1179 nt) | yfcJ | putative arabinose efflux transporter |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GACCAAACTTGCGGCGGCAACGGGGGAACCCAGCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGAAAGATGGCGAGTTAATTCCAGCGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAATACGCCGACGCTGGAATCACTACAGATGACGCTAAAACAACCTTTAGATGCCAGTGAACTGGCGGCGTTATCGGCATATATCCAGCAAAAATATGGTCTTTCTGCGCAATCATCGCTTTCTTCTGCCCAGGCCGAGGATATTCTTAATCAGCTTTATCAACGGCGGGTTAAAGGGATTGATCCGCGTGTTATGCAACCGCTGCTTAATCCTTTTCCACCGATGATGGACACGTTGCAAAATATGGCAACGCGTCCCGCGCTGTGGATACTGTTAGTCGCGATTATCCTGATGCTGGTCTGGCTGGTTCGTTAACCCCGACGAAATGACAGTATCGTGACAATAATACCCAGCACCGCAGAGATCGCCCCGGCAAGAAATACCGAAGAGTAACCAAACGTGGTCGCCAGCATTC > NC_000913/2438475‑2439043 | gACCACACTGGCAGCGGAAACGGGGGAACCCAGTAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGAAAGATGGCGAGTTAATTCCAGCGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAATACGCCGACGCTGGAATCACTACAGATGACGCTAAAACAACCTTTAGATGCCAGTGAACTGGCGGCGTTATCGGCATATATCCAGCAAAAATATGGTCTTTCTGCGCAATCATCGCTTTCTTCTGCCCAGGcc < 1:850120/289‑1 (MQ=255) 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aaCTTGCGGCGGCAACGGGGGAACCCAGCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGAAAGATGGCGAGTTAATTCCAGCGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAATACGCCGACGCTGGAATCACTACAGATGACGCTAAAACAACCTTTAGATGCCAGTGAACTGGCGGCGTTATCGGCATATATCCAGCAAAAATATGGTCTTTCTGCGCAATCATCGCTTTCTTCTGCCCAGGCCGAGGa < 2:437100/289‑1 (MQ=255) aaCGTGCGGCGGCAACGGGGGAACCCAGCAAACCTGTCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGAAAGATTGCGAGTTAATTCCAGCGAAACTGTTTCACCATCTGGTTACCTGGCTACAGGAGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAATACGCCGACGCTGGAATCACTACAGATGACGCTAAAACAACCTTTAGATGCCAGTGAACTGGCGGCGTTATCGGCATATATCCAGCAAAAATATGGTCTTTCTGCGCAATCATCGCTTTCTTCTGCCCAGGCCGAGGa < 1:891060/289‑1 (MQ=255) ggcAACGGGGGAACCCAGCAAACAGATCTGGCAATCGATGCTGGAACTTTCCGGGGTGAAAGATGGCGAGTTAATTCCAGCGAAACTGTTTAACCATCTGGTGACCTGGCTACAGGCGCGTCAGACGCTAAGCCAGCAAAATACGCCGACGCTGGAATCACTACAGATGACGCTAAAACAACCTTTAGATGCCAGTGAACTGGCGGCGTTATCGGCATATATCCAGCAAAAATATGGTCTTTCTGCGCAATCATCGCTTTCTTCTGCCCAGGCCGAGGATATTCTTAAt < 2:258045/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |