| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 348462 | 104 (1.030) | intergenic (‑19/‑220) | prpR/prpB | propionate catabolism operon regulatory protein/2‑methylisocitrate lyase | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CCGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAACCGAATATTGGGTTTAGTCTTGTTTCATAATTGTTGCAATGAAACGCGGTGAAACATTGCCTGAAACGTTAACTGAAACGCATATTTGCGGATTAGTTCATGACTTTATCTCTAACAAATTGAAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTTATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAAAGGATGGGCTATGTCTCTACACTCTCCAGGTAAAGCGTTTCGCGCTGCACTGACTAAAGAAAATCCATTGCAGATTGTT > NC_000913/348175‑348750 | ccGCTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAG > 1:77062‑M2/1‑288 (MQ=255) cTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGaaa > 2:754478/1‑288 (MQ=255) cTCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGaaa > 2:399365/1‑288 (MQ=255) tCGGTTTAATCAAAATAACTGGCACTGACAGGCGGCTTTTCAGGTACGCGCCGTTAGAGCCAGCCGCGATGATGGCGTCACAGCGTTCGTTTGCCAGTTTCTTGCGGATGTAGGTCACTGCTTTTTCAAAGCCAAGCTGAATAGGGGTAATGTTCGCCAGGTGATCAAACTCGAGGCTGATATCGCGAAACAGCTCGAACAGGCGCGTTACAGATACCGTCCAGATAACCGGTTTGTCGTCATTAAGCCGTGGTGGATGTGCCATAGCGCACCGCAAAGTTAAGAAAc < 2:737357/288‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |