Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,073,770 | G→A | 3.3% | V11V (GTG→GTA) | yihV → | 6‑deoxy‑6‑sulphofructose kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_000913 | 4,073,770 | 0 | G | A | 3.3% | 404.3 / 3.4 | 120 | V11V (GTG→GTA) | yihV | 6‑deoxy‑6‑sulphofructose kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/60); new base A (2/2); total (58/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.96e-01 |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
AAGACGCGAAGTTGATGCCCTTGCTGCAATAAATTGCTCGCCATTGGCGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACGCGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTTGTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAA‑TGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCATCTATTACGTGGAAGGGTTACCGACGGAGAGCGGTAAATACGTGGCGAGAAATTATACGGAAGTTGGTGGCGGGCCAGCGGCGACGGCAGCGGTTGCGGCGGCAAGGCTGGGGGCGCAGGTCGATTTTATTGGTCGCGTAGGTGATGACGACACGGGCAACAGCCTGCTGGCAGAGCTGGAATCCTGGGGCGTTAACACCCGTTACACCAAACGGTATAACCAGGCGAAATCTTCGCAATCCGCCATCATGGTGGATACCAAAGGCGAGCGGATAATC > NC_000913/4073482‑4074058 | gaacgttaTGCCCTTGCTGCAATAAATTTCTCGCCATTGGCGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACGCGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTTGTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAA‑TGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGAt < 1:54601/281‑1 (MQ=255) gAAGTTGATGCCCTTGCTGCAATAAATTGCTCGCCATTGGCGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACGCGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTTGTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAA‑TGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGAt < 2:66092/288‑1 (MQ=255) gAAGTTGATGCCCTTGCTGCAATAAATTGCTCGCCATTGGCGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACGCGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTTGTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAA‑TGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGAt < 2:194815/288‑1 (MQ=255) ttGATGCCCTTGCTGCAATAAATTGCTCGCCATTGGCGAACCCATTTGTCCTAAACCGATAAACGCGATTGCTGCCATAACCCTCTCCTGAATACAGTTATGTCACTTTTTGTCATTTATGACATGCTTTGCTTGTCTGTTTTTGATCGTATTTGTAATTTATCGTCAAAAAATTGACAGCCGTCACTTTTTAAACAATTGGTGAAATTAAAATGAACGCATCCCAAAATGTTTAAGGAA‑TGACCATGATTCGTGTTGCTTGTGTAGGTATAACCGTGATGGATCGCAt < 1:278349/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |