| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,337,431 | A→G | 2.9% | M167T (ATG→ACG) | adiY ← | adi system transcriptional activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,337,431 | 0 | A | G | 2.9% | 509.4 / 2.0 | 139 | M167T (ATG→ACG) | adiY | adi system transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/68); new base G (2/2); total (69/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
ATATAGCTCTTCGTTAAGGTTAAAAATCAGGCGACAGTGCGTTCTCTGTGCTGACTAACATAATGCAGCGGCGTCATACCGTAGAAGTCTTTAAAGACAGAAATAAAGTACGACGTACTGTTGTAGCCGCAGGACTGTGATACCTGAGAGATATTTTTACCGTCCATCATTAATTCATTTACGGCATAACGCATGCGGCAGGTGGTGATTATTTGGCTATAACTGGTGTTTTCGCTTTTCAACTTTTTCTTTAACAGACTTGGGCTAAGACATAAACAACTGGCTACCATACTAAGATTCCAGTCTTTGTGAATATCGCTTTCAATAATTTGATAAACGCTGTCACTTACACAATTACGTAACATATACATCATTAATGAAACGAATTTTTTACTGTCGAGAAAACGGGATAGCACCGTGAATAATAATGCGCGTGTTCGTTCCTTTTCTGACTCAGTTTCTGCGGGCATCATGCTGTGTTGCGCGGCAACGCGAAAGACGTCTGGCGTCAGGCATGGCAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGA > NC_000913/4337143‑4337710 | atatAGCTCTTCGTTAAGGTTAAAAATCAGGCGACAGTGCGTTCTCTGTGCTGACTAACATAATGCAGCGGCGTCATACCGTAGAAGTCTTTAAAGACAGAAATAAAGTACGACGTACTGTTGTAGCCGCAGGACTGTGATACCTGAGAGATATTTTTACCGTCCATCATTAATTCATTTACGGCATAACGCATGCGGCAGGTGGTGATTATTTGGCTATAACTGGTGTTTTCGCTTTTCAACTTTTTCTTTAACAGACTTGGGCTAAGACATAAACAACTGGCTACCa < 2:887619/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |