| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 458799 | 2 (0.050) | 48 (1.170) | 40/276 | 0.1 | 96.1% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
TATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAT > NC_000913/458662‑458941 | cctggCAAGGCGGAGGCGCAACAGGCGTCTGGTGCATAATTAATCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataag < 1:322951‑M1/141‑6 (MQ=255) aaGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCGTTAATGTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaa < 1:168696‑M1/143‑12 (MQ=255) ccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtgattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttctGGGGCAAcatccccatatccacacc < 2:702360‑M1/25‑8 (MQ=255) agttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTa > 2:405749‑M1/117‑143 (MQ=255) ggAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaa > 1:681113‑M1/1‑127 (MQ=255) ggAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATGCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaa < 1:179543‑M1/143‑17 (MQ=255) gAAGCGCAACAGGCATCTAGGGAATAAGTAACCATTCCCAGACAATGAGTTAACCAAAAGGGGGGGATTTTATCGGCCATTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaag < 2:23052‑M1/143‑18 (MQ=255) gggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaactcttaagttagcgcttatGGGGAAACATCACCATATACTGACGTACATGTTaa < 2:47359‑M1/35‑1 (MQ=255) gggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaagtcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACAGCCCCAGATACTGACGTACATGTTaa < 2:573162‑M1/35‑1 (MQ=255) cttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaagaccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAg < 2:589930‑M1/38‑1 (MQ=255) aCAGGCATCTGCCCAATCATCAACCCTTCCCATACAATTCGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCCTTAATTCTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaac < 1:66435‑M1/143‑26 (MQ=255) cAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGTGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACACACCaccagctctaacttaagggttgaacc > 1:300056‑M1/1‑117 (MQ=255) accaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaaggtagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACACgttaatcggtg < 2:652688‑M1/41‑6 (MQ=255) tGGTGAATAATTAACCATTCCCATACCATTGGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTCTCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGTATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctatcttaagggttgaaccatctgacg > 2:639158‑M1/1‑109 (MQ=255) tGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGTGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaag > 2:191661‑M1/1‑109 (MQ=255) tGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGCCACATCCCataagcgctaacttatgggttgcaccatctgaag > 1:672010‑M1/1‑109 (MQ=255) tGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaag > 2:571311‑M1/1‑109 (MQ=255) tgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATACCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGaa < 2:34073‑M1/48‑1 (MQ=255) tcggcgagcattgctgaccggttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccactacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGaa > 2:527037‑M1/96‑143 (MQ=255) ggTGAAGGATTGACCATTCCCGTACAAGTAGTTAGCCAAGAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaaga < 2:256981‑M1/143‑36 (MQ=255) ggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcacgcgaaacacggcaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGc < 1:103328‑M1/50‑1 (MQ=255) gAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatg < 1:631601‑M1/143‑39 (MQ=255) gAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTGTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaacgacaacacaaat > 2:625862‑M1/1‑105 (MQ=255) cagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttcaatgatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGcaca > 1:272590‑M1/91‑143 (MQ=255) cagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaagcatatcaggcgtaataccacaacgcttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGATAGTAGATGGCGTGAagcaaa < 1:406774‑M1/53‑3 (MQ=255) ttAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaacgcgacgc > 2:278297‑M1/1‑99 (MQ=255) tgaactATTTCTATACAATGTATTACCTAGAAATGGGGGGTTTTATCTTCCCGTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgc < 2:35459‑M1/141‑45 (MQ=255) ttgctgaccagttatcgtgagagtaattcaccggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccgcaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCgt > 1:367377‑M1/86‑143 (MQ=255) ttcctgcccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcacgcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCgt > 1:101599‑M1/86‑143 (MQ=255) gcaTTCCCAGGCAATGAGTTAACCAAAAAGCGGGGATTTTATCTCCCCGTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATATGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgtaccatctgaagaatgcgacgcctcg < 2:220682‑M1/142‑49 (MQ=255) tgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaaccctgaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCa < 2:183562‑M1/62‑1 (MQ=255) aTTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggt < 1:504811‑M1/143‑51 (MQ=255) accagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGTAAACATCCCTATACACTTACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATc < 1:136110‑M1/64‑1 (MQ=255) cctacAATGAGTTACCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTGTTCCTCTATGCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctc < 2:335699‑M1/141‑56 (MQ=255) catttaattattTAACCAAAGAGTGGTTATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagattgcgacgcctcggtgcctc < 2:131220‑M1/138‑56 (MQ=255) cATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctc < 2:391117‑M1/143‑56 (MQ=255) aTACAATTAGTTAACCAAAACTGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTCGGGGCAACATCCCataagcgctaacttaacgattgaaccatctgaagaatgcgacgccccggtgcctcg > 2:407374‑M1/1‑87 (MQ=255) tACTATTATTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCCCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGCGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgt < 1:49038‑M1/143‑58 (MQ=255) tACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGCGGGAAACATCCCctaagcgctcacttaaggggtgaaccacctgcataatccgacaactcgatgcctcgt > 2:668702‑M1/1‑86 (MQ=255) tACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTATCGGCGTTGAGTGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccctctgaagcatgggacgccgcggtgcccgct > 1:7764‑M1/1‑86 (MQ=255) tcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATGAcc < 1:6812‑M1/72‑1 (MQ=255) aaTTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaa < 1:397475‑M1/143‑61 (MQ=255) aaTTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTCGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctagttaa > 2:42517‑M1/1‑83 (MQ=255) agagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCg > 1:56518‑M1/67‑143 (MQ=255) agtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGa < 2:427439‑M1/79‑1 (MQ=255) gtaattcatcggcacgttaaactatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGaa > 1:508283‑M1/64‑143 (MQ=255) aaCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttacgacgatgc > 1:588496‑M1/1‑75 (MQ=255) catcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTaaa > 1:508803‑M1/58‑143 (MQ=255) cagcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTaaa > 1:622992‑M1/58‑143 (MQ=255) aGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgtt < 1:404844‑M1/143‑77 (MQ=255) ggggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttctt > 2:655210‑M1/1‑64 (MQ=255) aTTTTACCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaat < 1:298903‑M1/143‑84 (MQ=255) gtttaTCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaatt < 1:470259‑M1/142‑85 (MQ=255) tcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGGGTGACGCACAGACGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGctct < 1:724237‑M1/101‑1 (MQ=255) aTCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgt < 2:591513‑M1/143‑89 (MQ=255) gccctTGACTTTTTCCTCTATTCTCGGCGTGGAATGTGGGGGAACCATCCCagaagcgctaactgaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctctcgttcttcaattgcgttttg < 2:721536‑M1/142‑93 (MQ=255) ccccTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCAataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgagttcttcaattgcgttttt > 1:589292‑M1/1‑51 (MQ=255) cTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtag < 1:591661‑M1/143‑96 (MQ=255) gcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCGCTATGAAtccg < 2:490631‑M1/110‑2 (MQ=255) taagtgccacgacccttaggttagcgcttatGGGGAAACACCCCCATATCCTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGa > 1:720067‑M1/32‑143 (MQ=255) aaTTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctg < 1:571311‑M1/143‑100 (MQ=255) ttttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtca > 1:460232‑M1/1‑41 (MQ=255) ccacagcccttatgttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTc > 2:35175‑M1/26‑143 (MQ=255) ctctATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggat > 2:171678‑M1/1‑36 (MQ=255) ctctATTCTCAGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaactcaagggttgaaccatctgcagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaagtgcgcgtggtaggctgtcagggca > 2:18799‑M1/1‑36 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCATGAAGCACAGTCGTGTCCACTGATTACCTGGCGGAACTTAACCTCAGAGAGAGCTCTAGGAATCCTGAgcgttgta < 2:52194‑M1/120‑4 (MQ=255) tctcGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtc < 1:155598‑M1/143‑114 (MQ=255) ttaaggtagcgctgatGGGGAAACCTCCACATAGACTGACGTACATGTTCATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCAt > 1:181016‑M1/17‑143 (MQ=255) ctcGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcc > 1:601798‑M1/1‑29 (MQ=255) gttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGaa < 1:662398‑M1/131‑1 (MQ=255) tGAATGCGGGGGAAAGTTCCCatacgcgctaacttaagggttgaaccagctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatccctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatg < 2:234377‑M1/143‑123 (MQ=255) cttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCg > 1:443441‑M1/6‑143 (MQ=255) tatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAGATTAAACTAAGGGAGTGCTCTCTGGTTCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCgtg < 1:5140‑M1/140‑2 (MQ=255) gggggAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgcagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgatttgtaggctgtcagggacactgtcccaccaatgtcatact > 2:625315‑M1/1‑14 (MQ=255) ggggAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgagccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctg < 2:438363‑M1/143‑131 (MQ=255) gggAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagccgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgcgtggccacctgt > 2:646400‑M1/1‑12 (MQ=255) GGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTCCCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGACCGTTCTGAACGCATTGCAATCCCCGTATTGc < 2:499510‑M1/143‑1 (MQ=255) aaaCATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgccgggttaacatgttgcctcgcgttcttcaattgcgtattttaggctgtcaggtatactgtcccacggttgtccaccttttcg > 2:549166‑M1/1‑9 (MQ=255) aaaCATCCCataagcgctaacttaagggtggaaccatcggaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaag < 2:563036‑M1/143‑135 (MQ=255) tCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCCgcgc > 2:271898/1‑143 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgcagcatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccag < 1:303832‑M1/143‑141 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccag < 1:173860‑M1/143‑141 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgtctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatagtgtcccacgaatggccacctgtaagctccaga < 2:382373‑M1/143‑142 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcgggggtactgtcccacgaatggcttcccgtaagcaccaga > 2:348116‑M1/1‑2 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccaga > 1:479301‑M1/1‑2 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggcggtcagggatactgtcccacgaatggccccctgtaagctccagg > 2:592153‑M1/1‑2 (MQ=255) ccATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGCAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGcgcgcg > 1:694449/1‑141 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgggtggccacctgtcagctccagat > 1:214699‑M1/1‑1 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagat > 1:642609‑M1/1‑1 (MQ=255) | TATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAT > NC_000913/458662‑458941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |