| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,196,305 | C→T | 100% | R395C (CGT→TGT) | icd → | isocitrate dehydrogenase, e14 prophage attachment site, tellurite reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,196,305 | 0 | C | T | 97.8% | 133.5 / ‑6.1 | 50 | R395C (CGT→TGT) | icd | isocitrate dehydrogenase, e14 prophage attachment site, tellurite reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (26/19); minor base G (3/1); total (30/20) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑CGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTA > NC_000913/1196089‑1196528 | gCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTgatgga < 2:383775/227‑1 (MQ=255) ggTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGCAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑GGTCTGATGGATAGCGCt > 2:215255/1‑228 (MQ=255) ggTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCt > 2:28285/1‑228 (MQ=255) ggTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAAATGTTAAAGGAATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTTTGACTTCGAG‑GGTCTGATGGATGgcgtc > 2:69546/1‑226 (MQ=255) ggTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTAGGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCt > 1:491275/1‑216 (MQ=255) gTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTa < 2:491275/216‑1 (MQ=255) gAAGGCGCCCTTTTTGAAGCCACCCACGGTCCTGCGCCGAAATAGGTCGGTCAGGACAAAGTAAATCCGGGCTCTATTATTCGCTCCGCTGAGATGATGCTGCGACACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCa < 1:69546/228‑1 (MQ=37) ttttGAAGCCCCCCCCGGTACTGCTCCGAAATAGGCCGGTAAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGa < 1:215255/227‑1 (MQ=255) ttcgagtcacccccGGGTCTGCGCCTAAATCGGCCGGGCAGGCCAAAGGAAATACGTGCTCTATTTGTCGCGCGGCTGGGATGATGCTGAGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAT‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAcg < 1:201709/221‑1 (MQ=18) cccacGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGGTCATCg > 2:456913/1‑228 (MQ=255) cccGGTTCTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCGCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGa < 2:7438/225‑1 (MQ=255) ccggtatagccacgtaaTACGCGGGTCAAGACAGAGTAAACCCGGGCTCTAATATTCCCTCCCCTGATATGATGCTGCGCCACATGGTTAGGACCGAGGCGGGTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGAGCAATCAGCGCGAAAACAGTAACCTATGGCTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGaaa < 1:676697/213‑1 (MQ=255) aaaTATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGGAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGCGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAAAATGAAATAccta > 2:209881/1‑226 (MQ=255) ccGGTTAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTg < 2:642680/227‑1 (MQ=255) ggTAAATCCTGGCTCTATTAATCTCTCCGAGTAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAATCCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAAc < 2:702840/227‑1 (MQ=255) aGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCAACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGAATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGCATTTGGTGACGCGATTATCGAAAACATGTAATGCCGTCGTTTTGTAACGTTATTaa > 2:288271/1‑227 (MQ=255) ggCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGTTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGATCGTaa > 2:639204/1‑228 (MQ=255) gCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTGAATTTGTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTTACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGAGGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATg < 2:33921/188‑1 (MQ=255) ctctATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTACATTTATTAACGGGAGCGTAACg > 2:34564/1‑228 (MQ=255) tctctcCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGGGTAACGCTCCCgttg > 2:511078/1‑228 (MQ=255) tcCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAACACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGttt > 2:332588/1‑227 (MQ=255) tcCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGACGTAGTTTGTTAAATTTATTAAAGGGGGCGAAACGCTCCCGTTGttt > 1:406798/1‑227 (MQ=255) cGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGGTGtttttt > 2:515906/1‑228 (MQ=255) agagtatgCGGGGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑g < 2:617410/223‑1 (MQ=255) atgCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑CGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGAAACGACCCCGTTGTTTTTTGTTA‑Ggctgc > 2:551474/1‑228 (MQ=255) gctgcGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGCCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGATGAAATGTTCAGAGTTTGGTGCCGCGATCATCGAAACCTTGTAATGCCGAAGTTTGTTAATTTTATTAACGGGGACGACACGCTCCCGCTGTTTTTGTTTA‑GGTTGCTa > 1:443784/1‑228 (MQ=255) aaGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCCATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTa < 2:240276/155‑1 (MQ=255) aaGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATAGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTa > 1:240276/1‑155 (MQ=255) aGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGGAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGAAGCGTAACGCACCCGTTGTTTTTTGTTA‑GTCTGCTAAGTGTTATCAAAATTTTATCaaaa > 1:504453/1‑228 (MQ=255) tAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAACAAAAGTTATCAAAACCCCt > 2:170884/1‑228 (MQ=255) tAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCt < 2:39226/228‑1 (MQ=255) tAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGGTATCAAAATTTTATCAAAAAATATTTTCAAAAccccc > 1:416451/1‑227 (MQ=255) tAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GACTGCTAACGGTGATCAAAACTTTATCAATAAAAGTTATCAAAAACCCt > 2:320218/1‑228 (MQ=255) aaGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCg > 2:424841/1‑228 (MQ=255) tggTTTGGGAGGCGGAAGTCACGCTAAAACCGTAACCTAGGGCTTCGAG‑TGTCTGGTGGGTGGCGCTAACCTGCAGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCCATCAGCGAAAACATGTAATGTCTTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCgg < 1:288271/227‑1 (MQ=255) tGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAACCATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGTAGCGTACCGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGATGCTTACGGTTATCAGAATTTTTTCAAAAAAATTTATCAAAAACCCTCgggtgtt > 1:343871/1‑223 (MQ=255) tGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGATCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCG‑TGTTTTTTGGTAGGGCTGCTAACGGTGATCAAAATTTTATCTAAAAAAGTTATCAAACACACTCGTTAg > 2:306395/1‑226 (MQ=255) tGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑GGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGATTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTccag > 2:305950/1‑155 (MQ=255) ggAACGCGCAGTCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCgt < 1:305950/157‑1 (MQ=255) cgcAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGGG‑TGTCTGATGGATGACGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACCCGATCATCGAAAACATGTAATGACGTAGTTTGTTAAATTTGTTAACGAGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACTGTTATCAAAATTTTTTATAAAAAATTTGTAAAAACCCCTCTGGAGTTTGTGGGt > 1:697991/1‑228 (MQ=255) cgcAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTTTCCAAAAAAGTTATCa > 1:5545/1‑205 (MQ=255) cgcAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTGGTTTTGGGGt > 2:232968/1‑228 (MQ=255) cgcAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGt > 2:69216/1‑228 (MQ=255) gcAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCaa < 2:5545/205‑1 (MQ=255) aaaaaCCGTAACCTTTTGCTTCGGGTTGTCT‑ATGGATGGCGCTAAACTGCGTAAATGTTCAGAGTTTGGTGTCGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGt < 1:28427/227‑1 (MQ=255) ccGTAACCTATGACTTCGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGGTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAggt < 2:182604/228‑1 (MQ=255) gTAACCTATGAATTCGAG‑GGTCTGATGGTTGGCGCAAAACTTCTTAAATGTTCAGAGTTTGGTTACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAggtgg < 1:639204/228‑1 (MQ=255) cGAG‑TGTCTTAGGGAAGGCGGTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTATGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTctactacta < 2:443784/228‑1 (MQ=255) cGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGACAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGTTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCCACAAAAGTTTTTAAAACCCCCCGGAATTTTTGGGGTAGGCTGGCAGGGCGAGTGGTGGTTcatctaata > 1:490094/1‑220 (MQ=255) cGAG‑TGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTctactacta > 2:100362/1‑228 (MQ=255) | GCCCCTGGTGCAAACATCGGTGACGAATGCGCCCTGTTTGAAGCCACCCACGGTACTGCGCCGAAATATGCCGGTCAGGACAAAGTAAATCCTGGCTCTATTATTCTCTCCGCTGAGATGATGCTGCGCCACATGGGTTGGACCGAAGCGGCTGACTTAATTGTTAAAGGTATGGAAGGCGCAATCAACGCGAAAACCGTAACCTATGACTTCGAG‑CGTCTGATGGATGGCGCTAAACTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTA‑GGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTA > NC_000913/1196089‑1196528 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |