| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,809,085 | 0 | C | A | 9.5% | 231.5 / 2.9 | 96 | Q183K (CAA→AAA) | waaA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase (KDO transferase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/30); new base A (2/9); total (57/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.36e-03 | |||||||||||
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CGTATGATCTGCCCGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCG‑CCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTA > NC_000913/3808858‑3809306 | cGTATGATCTGCCCGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTgcgc > 2:694343/1‑228 (MQ=255) gaaacaggCCCGATGCAATTATCCGGTTCCTGAATAACGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTAGGGCCTATCCTGATGGCGGCGCTACATAAACGTAAAATCCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCaaa < 1:409208/221‑1 (MQ=255) aTGATCTGCCCGGTGGACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCaaa < 2:683899/228‑1 (MQ=255) tGCCCGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTATGCCCGCTAGGCCGCAGGTTATGCCAACCTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCCTCGTTTTACGCGGATTGCTGCGaaa > 1:683899/1‑221 (MQ=255) cccGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATAGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTACATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGCCGGATAACGCTCATTGCTGCGAaaaacaaaaaa > 1:310881/1‑221 (MQ=255) ccGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCCAAGGTTAGGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCTCCGCTTGCTGGGCCGTATTACGCTGTTTGCGGCGCAAAATgaagaaa > 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cGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGATATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGGGCACGttt > 2:396765/1‑227 (MQ=255) ttCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGCATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCCCGTTTtgtg > 2:482540/1‑228 (MQ=255) tCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATAGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCCCTGCCCGCTCGGCCGCAGGGTATGCCAAACAGGGGAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGGTTTACGCTGCTTTGTGTGCAAAATGAAGCAAATGGGGCACGTTCtgac > 1:240314/1‑225 (MQ=255) aGTCGCCCCTAAACTGGGTTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGgcgc < 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ttACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGATGATGGTGCCTGTGTTGTGGCGATGGGCGCAAAAAATAATCAGGGGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCG‑CCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACAt < 2:504213/227‑1 (MQ=255) aTTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCG‑CCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATGGCCGCACATCAGGCAtt > 2:140307/1‑227 (MQ=255) gctgcGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCG‑CCGCCTGTGGGCACCACACGGCCCGGTATGGATTGCCCCCAGCCACCACGAAGGGGAAGAGAGGCTGGGGAGCGCCGCCCATCAGGCACTGttc > 1:504213/1‑227 (MQ=255) | CGTATGATCTGCCCGATGCACTCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTGTAACGCCGCAGTTGGCTGCTAAAGCCGTGACGCTGCG‑CCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTA > NC_000913/3808858‑3809306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |