| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 458799 | 3 (0.040) | 96 (1.250) | 62/402 | NT | 97.0% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/458561‑458799‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTC < NC_000913/609347‑609112 CACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAG‑TGTGGGGGAAACATCCC > 2:340925/1‑239 CTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTTTCGGCGTTGAA‑TTGTGGGGAAAAATCCCTTAAG > 2:671912/1‑239 ccatcctgtgtgctATCTGTCGTTCATTGAAGGTGGCGAAAAGGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATTGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCG < 1:340925/225‑1 attCCATTTTCGATCTGCCGTTCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT < 1:24887/236‑1 tcCCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT < 2:374139/236‑1 TACCATTGACGGTCTGCCGTCCATGGAAGACGGCGAAAAAGTGGTTATCGACGGGTCGGTAATTGATGGTTAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT < 2:926560/238‑1 TGTACGATCTGCCGTCCATTGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAAAAGGCATCTGAGGAATACTTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACAAAAAATGGTGGATTTTATCTCCCCTTTACTTTTTCCTCTATTCTAGGCGTTGAATTGTGGGGCAAA‑ATCCCTTAAacccaaaatta > 1:961588/1‑228 TGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTA > 2:535914/1‑239 TGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCAAAAGCGCCAACTTA > 2:24887/1‑239 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ACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGT > 2:688622/1‑239 ACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGT > 2:501329/1‑239 TGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCCCGGTGCCTCGTTAATACGATGCCCCGCGTTCTTCAATTCCGTTTGGT > 2:347417/1‑239 tttTTTTTGGCAAGCCGGAAGGGCAACAGGCATTTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGG < 1:866108/236‑1 tTTTTTGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCT < 1:501329/238‑1 ATTTATGGCAAGGCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTTAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGGTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCT < 2:632162/239‑1 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> 2:855967/1‑161 AACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTAGCATATAATTTTTCTTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTATGGGTTGCACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCCCTCGTTCTTCATTTGCGTTTGGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTATGCTCCAcac > 1:652947/1‑236 AACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTAACTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < 2:760558/239‑1 cccTTCCCATTCATTTTGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTAGCTCCCCTTTAATTTTTCCTTCATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGA < 1:551782/236‑1 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TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCCCGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTAT > 1:96805/1‑238 TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTAT > 2:535312/1‑238 AGTTAACCAAAAAGGGGGGCTTTGATCTCCCGTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGGAGGCTGTCAAGGAGGTGGTCCCACAAAAAGCCACCGGGAAGCCCCAGGTGACAATTTTTGTTAGTC > 1:837108/1‑238 AGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCT > 2:540510/1‑177 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GGGTTTTTCTCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTTGCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACAGCCCATAAGCGCTAACTGAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGTCGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAG < 1:524654/237‑1 GGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGCAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTTAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGGGTTCTTCCATTGCGTTTTGTAGGCTGTCCGGGATACTCTCCCACGAATGGCCCCCTGTAATCTACGAATGCCCCTTTTTGTTATTTCCCCCAACCTGTTATTT > 1:12681/1‑239 GGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGGTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACACCAGGTTAGTT > 2:756237/1‑239 GGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCC > 1:722263/1‑132 GGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCC < 2:722263/132‑1 GGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGT > 2:908408/1‑237 TTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCCCAACGAGTTAGTTCT > 2:25449/1‑237 ttcCCCCTTTAATTTTTCCTTCATTCCTGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTC < 1:535312/236‑1 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TTAATTTTTCCTTTTTTTCCGGCGTTGAA‑TGTGGGAGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTTAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGG < 2:961588/239‑1 TTAATTTTTCCTCTTTTTCCGGCGTTGAA‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGG < 1:688622/239‑1 gccgggggttgtaaaagacaGTTAAA‑TTTGGGGGAAACACGCCAAAGGCGGTAGCTTAAGGGTTGAACCGTTGGAAGAATGCGACCTCTCGGGGCCTCGTTAAGACGATTCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCGGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTGTTCGGATCCGGCAC < 1:559166/219‑1 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A‑TGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGGCGCCCCGGTGGCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGG < 2:832689/239‑1 tatgtggggattttcCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGG < 1:434161/224‑1 gGTGGGGGTAACATCCCCTCATCGCTAAATGTAGGGTTGAACCGTGTGAAGTATGCGCCGGCTCGGTGCCGCGTTAAGGCGATGCGTCGGTTTCTTAAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGG < 1:666140/237‑1 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tTCCCATTAGCGTTAACTTAAGGGTTTACCCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCCCGTTAAGACGATGCCTCGCTTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCG < 1:341983/238‑1 ATCCCATAAGCGGTAACTTAAGGGTTGAACCTACTGAAGAAGGGGCACCCTCGGTGCCGTGTTAAGGACATGCCTCGCGTTCTTCAAGTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCG < 1:370066/239‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTTTCCACAACGGGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTTGGGGGGGAGTCCAGGCATGGCTGGATTATGGCGTa > 1:416811/1‑238 CCCATAAGCGATAACTTAAGGGTTGAACCTTCGGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTC < 1:900689/239‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGG > 2:414136/1‑209 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTC < 2:301293/187‑1 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NC_000913/609347‑609112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |