| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458787 = | 5 (0.060) | 90 (1.160) | 57/404 | NT | 94.8% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
GTAGAAGCCGCACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGG > NC_000913/458551‑459020 | gtgacttcacgtaatgacatccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggg < 2:372945‑M1/3‑1 (MQ=255) ttcacgtaatgacatccccccggtgccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaagttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGaaa > 2:487283‑M1/232‑238 (MQ=255) tcctgtaatgacacccccacggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa > 1:515223‑M1/231‑239 (MQ=255) gCCGCACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATCCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACa > 2:551782/1‑239 (MQ=255) cACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAGTGTGGGGGAAACATCCC > 2:340925‑M1/1‑239 (MQ=255) ccatcctgtgtgctatctgtcgttcattgAAGGTGGCGAAAAGGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATTGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcg < 1:340925‑M1/225‑8 (MQ=255) cccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa > 2:171913‑M1/214‑222 (MQ=255) cATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGaaa < 2:20861/220‑1 (MQ=255) tGTACGATCTGCCGTCCATGGAAAACGTCGAAAAAGTGGTTATCGGCGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgct < 2:601045‑M1/233‑10 (MQ=255) gATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggt > 2:906524‑M1/1‑219 (MQ=255) taagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt < 2:359284‑M1/36‑1 (MQ=255) cTGCCGTTCATGGAAGCCGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttga < 2:57188‑M1/239‑24 (MQ=255) cGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGACGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGACGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGATAAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTTTCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTATCGGCGTTGAATGTGGGGGAAAAATCCCcaaagcgcaaaattaagggtggaaaaa > 1:832689‑M1/1‑212 (MQ=255) cagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGa > 2:641408‑M1/199‑237 (MQ=255) ccATGGCAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGGGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCCCGGCGTTGAATGTGGGGGAAAAATCCCaaaaacgcaaaattaaggggtgaaaaa > 1:393226‑M1/1‑209 (MQ=255) ccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGACCATGTTAATAGATGGCg < 2:771721‑M1/44‑1 (MQ=255) gacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccaggtatcgtgagggtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaaaacaacaacccttaagttagagcttatGGGGAAAAATCCCCATATAATGACGACCAAGTTAAAAGaaggcggaaag < 1:907435‑M1/49‑6 (MQ=255) cgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtaaccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGca > 2:541456‑M1/189‑239 (MQ=255) gtagccgagtttcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaaggatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccgtaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGca > 1:147150‑M1/188‑238 (MQ=255) aCGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAACGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataaccgctaacttaagggttgaacctcttgacaaatgc > 2:666140‑M1/1‑200 (MQ=255) agcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa > 2:539398‑M1/186‑194 (MQ=255) cGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgac < 2:589460‑M1/238‑43 (MQ=255) aattgggagcatcccgaattgcgcggcggcgggttagagccccggccttacgtgtcgaagtatccaggtcttcgggcttaccaatatggaccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcagatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGACgt > 2:799879‑M1/182‑239 (MQ=255) ggtttgcggggatgcgggaattgatggtcAAAGCAAACCGTTGCTTATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTGTATCTCCCCTTTAATTTTGCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgc < 1:627108‑M1/225‑53 (MQ=255) tcacgaatttcgcggcggcgggttaaagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgcggaccagttatcgtgggagtcattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccccaacccttaagttagcgcttatTGGGAAACATCCCCCTATACTGACGGACATGTTAATAAATGGCGGGGAGCCAAGTCTGGTCATCTGAtt < 1:565192‑M1/69‑1 (MQ=255) cgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGa < 2:833515‑M1/79‑1 (MQ=255) ggTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgccccggggcctcgttaagacgat > 2:391907‑M1/1‑172 (MQ=255) ggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgcagaccagttattgtgagagtaagtcatcggcacgttaaatcatatcagccgtaataccccaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATACCCATCTCATGACGTACCAGTTAATAGATGGCGGGAAGAAAAGAATTGTACACTGATTACCTGGCGGAAATTaa < 1:404515‑M1/85‑1 (MQ=255) tCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGACGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgccaacttaaggtttgaaccatcggcagaatgcgacccccccggccctcgttaaaacgaatcctcgcgttttt > 1:760558‑M1/1‑160 (MQ=255) cccggcagtacgtgcctaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgggagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGc > 1:601664‑M1/142‑239 (MQ=255) ggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGggaaaaa < 1:769652‑M1/9‑3 (MQ=255) aCCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgt > 2:688622‑M1/1‑151 (MQ=255) tgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTa > 2:850705‑M1/130‑218 (MQ=255) ttttttGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggct < 1:501329‑M1/238‑99 (MQ=255) aTTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggggcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattccgttttttag > 2:1018079‑M1/1‑141 (MQ=255) gCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgtttttcaattgcgttttttaggctgtcagggtt > 2:511099‑M1/1‑130 (MQ=255) cggaaggcaaaacgtgaatcggtgaataattaaccagtcccaTACAATTAATTAACCAAAAGTGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGGTTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggatgaaccatctgaagaattcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata < 1:791951‑M1/216‑109 (MQ=255) ttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAAAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCAtt < 2:406034‑M1/128‑1 (MQ=255) cgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa < 1:580801‑M1/9‑1 (MQ=255) ggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggg > 1:871835‑M1/94‑96 (MQ=255) ggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggg < 2:871835‑M1/3‑1 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATcccc > 2:1000959‑M1/93‑106 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATcccc < 1:1000959‑M1/14‑1 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGCCGAACATGTTAATAGATGGCGTGAGACACAGTCGTGCATTATGTTTACCTGACGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTAAGCGTTCTGAAAGCATTCAAATCCCCGAATTGCcgg < 1:1025620‑M1/147‑2 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttacGGGGAAACATCCCCCTATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGCCGTGTCATCCGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGGAAGCTCTATGAATCCTGCCCGTTCTCACCGCCTTTAAATCACCGAATTGCCg < 1:192667‑M1/146‑1 (MQ=255) ccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACATGGCGGAAATTAAACTAAGAAAGTGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTTAAATCCCCGCATTgca < 2:917248‑M1/145‑2 (MQ=255) aattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTgcgc < 1:126867‑M1/152‑1 (MQ=255) ttAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaa < 2:328154‑M1/181‑83 (MQ=255) aaCCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacg < 1:855967‑M1/161‑65 (MQ=255) aaCCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacg > 2:855967‑M1/1‑97 (MQ=255) aaCCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTAACTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagat < 2:760558‑M1/239‑143 (MQ=255) ttCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgc > 2:766877‑M1/1‑92 (MQ=255) tCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggttactgtcccccgactggccacctgtaagctccagctgaccat > 2:967846‑M1/1‑91 (MQ=255) ttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACg < 2:467471‑M1/25‑1 (MQ=255) tACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtc < 2:220825‑M1/199‑114 (MQ=255) atcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa < 2:819692‑M1/9‑1 (MQ=255) ttAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgacgaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttggaggctgtaagggatacttccccccgaacggccacctgtaaactccacatgacaatatttgttat > 1:463100‑M1/1‑81 (MQ=255) ttAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcgttgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcaggggaactgtcccacgaatggccccctgtaacatccaggtgaccatttttgtttt > 1:710896‑M1/1‑81 (MQ=255) ttAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccccgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttat > 1:96805‑M1/1‑81 (MQ=255) ttAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttat > 2:535312‑M1/1‑81 (MQ=255) aGTTAACCAAAAAGGGGGGCTTTGATCTCCCGTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATACCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttggaggctgtcaaggaggtggtcccacaaaaagccaccgggaagccccaggtgacaatttttgttagtc > 1:837108‑M1/1‑79 (MQ=255) aGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCGCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggct < 1:540510‑M1/177‑99 (MQ=255) agtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCAtata < 1:947736‑M1/19‑1 (MQ=255) agtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGGACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGCTTCCCTGGCGGACATTAAACTAGAAAAGAGCTCTATGAATCCTTGGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTCTTGCCGCTGCGCGCTGTGGGGGTTTATccgcaaat < 1:996244‑M1/175‑4 (MQ=255) agtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcataataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCGGAACGCATTGACATCCCCGTATTGCCGCGCCGCGATTTGGTGGGTAAtccgccaaa < 1:12588‑M1/175‑5 (MQ=255) aaCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggaaactgtcccacgaatggccccctgtaagctccagatgaccatttttgtttttctccca > 1:903922‑M1/1‑75 (MQ=255) ccAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccaca > 2:243119‑M1/1‑73 (MQ=255) catcgtcacgttaaattataccatgcggaattacacattccttaatttagctcttatGTGGAAACCTCCCCATATTCTGCCGTACATGTTAATAGATGGCCTGAAGCCCAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGTGAGCTCTATGAAGCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCTCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATc > 1:917248‑M1/58‑239 (MQ=255) gggTTTTTCTCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTTGCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAGCCCataagcgctaactgaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagtcgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttag < 1:524654‑M1/237‑175 (MQ=255) gggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcc > 1:722263‑M1/1‑63 (MQ=255) gggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcc < 2:722263‑M1/132‑70 (MQ=255) ggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagt > 2:908408‑M1/1‑62 (MQ=255) ttttATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccccaacgagttagttct > 2:25449‑M1/1‑59 (MQ=255) ttccccctttAATTTTTCCTTCATTCCTGGCGTTGAATGTGGGGGAAACCTCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagttcttcttttc < 1:535312‑M1/236‑186 (MQ=255) atcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGACCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGACGATGCGCGAGGTGGGGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTcgggcggg < 2:504139‑M1/201‑1 (MQ=255) atcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCGCTAAGAATCCTGCGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCAGGATTGCCGCGGCGCGATGGGGGGGTTTATCCCCACATGGTCATCCCCTTATTTGTcggggggg < 1:635621‑M1/201‑1 (MQ=255) ggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTAt > 2:579279‑M1/35‑201 (MQ=255) ttAATTTTTCCTTTTTTTCCGGCGTTGAATGTGGGAGAAACATCCCataagcgctaacttaagggtttaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagttcttcttttcggatccgg < 2:961588‑M1/239‑194 (MQ=255) tgaagtttgcctctATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgcgaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagttcttcttttcggatccgg < 2:12681‑M1/234‑194 (MQ=255) gccgggggttgtaaaagacagttaaatttgggggaaacacgCCaaaggcggtagcttaagggttgaaccgttggaagaatgcgacctctcggggcctcgttaagacgattcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggcggtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagttcttctgttcggatccggcac < 1:559166‑M1/219‑197 (MQ=255) ataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGt > 1:574015‑M1/29‑221 (MQ=255) tttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgtacttcaattgcgttttgtaggctgtccgggatcctgtcccacgcatggccacctgttagctcccgctgaccatttttgttattctccacaacaggttagttcttcttttcggaccaggcacc > 1:423995‑M1/1‑40 (MQ=255) ttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata < 1:20952‑M1/147‑109 (MQ=255) tCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggc > 1:599861‑M1/1‑38 (MQ=255) ccacaactcttaatgtagggctttgGGGGAAACATCCCCGTATAAGGGCGATCATGTTAATAGATGGTGTTAAGCATCGTCGTGTCATGTGATTACCTGGCGGAAATCAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTCTTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCAGCTCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCg < 1:310945/216‑1 (MQ=255) cctaTTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagattaccatttttgttattccccacaacgagttagttcttcttttcggatccggcacttctgggg < 2:621838‑M1/238‑205 (MQ=255) ttttgtgacgtggaattGGGGGGAAACATCCCataaacgctaactgaagggttgacccttctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgccgcgcgttcttcaattgcgttgtgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagttcttcttttcggatccggcacttctggggggg < 1:231459‑M1/231‑208 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGa > 2:399236‑M1/17‑128 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGCGGTGGTTTATCCGCACAGGGTCATCCCCTTTTTTGTCTGGCGGGAAAAATATAACCGTTGTctgag < 1:282813‑M1/223‑3 (MQ=255) taagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGa < 2:310945‑M1/223‑1 (MQ=255) agcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGa < 2:126703‑M1/112‑1 (MQ=255) agcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCg > 1:369858‑M1/10‑155 (MQ=255) agcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCg < 2:369858‑M1/146‑1 (MQ=255) agcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTgcg > 1:352771‑M1/10‑160 (MQ=255) gcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGca < 1:936907‑M1/172‑1 (MQ=255) gcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGca > 2:936907‑M1/9‑180 (MQ=255) gcgcttatGGGGAAACATCCACATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGcac > 1:126775‑M1/9‑181 (MQ=255) tgtgGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagttcttcttttcggatccggcacttctgggggggaaatccagcgatgg < 2:830741‑M1/238‑222 (MQ=255) ggtggGGGTAACATCCCctcatcgctaaatgtagggttgaaccgtgtgaagtatgcgccggctcggtgccgcgttaaggcgatgcgtcggtttcttaaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagttcttcttttcggatccggcacttctgggggggaaatccagcgatgg < 1:666140‑M1/237‑222 (MQ=255) ggggAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtagg < 2:350025‑M1/109‑97 (MQ=255) | GTAGAAGCCGCACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGG > NC_000913/458551‑459020 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |