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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,891,532 | 0 | A | C | 9.7% | 337.4 / 3.0 | 130 | intergenic (+50/‑82) | tnaB/mdtL | tryptophan transporter of low affinity/multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (68/46); new base C (3/12); total (71/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-03 | |||||||||||
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Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GTGCGCCACCATCTGGGCGGTCATTATTCCCGCAGTGCTTGCAATCAAAGCTCGCAAGAAGTTTCCCAATCAGATGTTCACGGTCTGGGGCGGCAATCTTATTCCGGCGATTGTCATTCTCTTTGGTATAACCGTGATTTTGTGCTGGTTCGGCAACGTCTTTAACGTGTTACCTAAATTTGGCTAAATCCTTCAAGAAGCCAGCCATTCGCTGGCTTCTTGCCTCTCAGGAAATCACTTATGTCCA‑AATGGCAACTCGCCTGATCCTCCTTCACCACGTATGCTTTGCGTCACCTTACTAT‑CAGGACGCTTTAGCCCATGTCCCGCTTTTTGATTTGTAGTTTTGCCCTGGTTTTACTTTATCCCGCCGGGATTGATATGTACCTCGTTGGTTTACCGCGCATCGCCGCCGATCTCAATGCCAGCGAAGCGCAGTTGCATATTGCGTTCTCCG > NC_000913/3891296‑3891749 | gggcgcCACCAGCTGGGCGGTCATTATTCCCGCAGTGCTTGCAAGCAAAGCTCGCAAGAAGTTTCCCAATCAGATGTTCATGGTCTGGGGCGGCAATCGTATGCCGGCGATTGTCATTCTCTGTGGTATAACCGTGATTTTGTGCTGGTTCGGCAACGTCTTTAACGTGTTACCTAAATTTGGCTAAATCCTTCAAGAAGCCAGCCATTCGCTGGCTTCTTGCCTCTCAGGAAATCACt < 2:278535/237‑1 (MQ=255) tgCGCCACCATCTGGGCGGTCATTATTCCCGCAGTGCTTGCAATCAAAGCTCGCAAGAAGTTTCCCAATCAGATGTTCACGGTCTGGGGCGGCAATCTTATTCCGGCGATTGTCATTCTCTTTGGTATAACCGTGATTTTGTGCTGGTTCGGCAACGTCTTTAACGTGTTACCTAAATTTGGCTAAATCCTTCAAGAAGCCAGCCATTCGCTGGCTTCTTGCCTCTCAGGAAATCACtt > 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NC_000913/3891296‑3891749 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |