Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 760,032 | A→C | 17.7% | T443P (ACC→CCC) | sucA → | 2‑oxoglutarate decarboxylase, thiamine triphosphate‑binding |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 760,032 | 0 | A | C | 17.7% | 205.5 / 2.8 | 88 | T443P (ACC→CCC) | sucA | 2‑oxoglutarate decarboxylase, thiamine triphosphate‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/16); new base C (3/17); total (55/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.05e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGTTCAGGAAACCCTGAACATGTCGAAAGCGCGTGGTTATGAAGTTGGCGGTACGGTACGTATCGTTATCAACAACCAGGTTGGTTTCACCACCTCTAATCCGCTGGATGCCCGTTCTACGCCGTACTGTACTGATATCGGTAAGATGGTTCAGGCCCCGATTTTCCACGTTAACGC‑GGACGATCCGGAAGCCGT‑TG‑CCTTTGTGACCCGTCTGG‑CGCTCGATTTCCGTAACACCTTTAAACGTGA‑TGTCTTCATCGACCT‑GGTGT‑GCTACCG‑CCGTCACGGCCACAACGAAGCCGACGAGCCGAGCGCAACCCAGCCGCTGATGTATCAGAAAATCAAAAAACATCCGACACCGCGCAAAATCTACGCTGACAAGCTGGAGCAGGAAAAAGTGGCGACGCTGGAAGATGCCACCGAGATGGTTAACCTGTACCGCGATGCGCTGGATGCTGGCGATTGCGTAGTGGCA > NC_000913/759800‑760268 | ggTTCAGGAAACCCTGAACATGGCGAAAGCGCGTGGTTATGAAGTTGGCGGTACGGTACGTATCGTTATCAACAACCAGGTTGGTTTCACCACCTCTAATCCGCTGGATGCCCGTTCTACGCCGTACTGTACTGATATCGGTAAGATGGTTCAGGCCCCGATTTTCCACGTTAACGC‑GGACGATCCGGAAGCCGT‑TG‑CCTTTGTGACCCGTCTGG‑CGCTCGATTTCCGTAACACCTTTa < 2:107948/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |