Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 848,619 | 0 | A | T | 8.4% | 342.0 / 2.5 | 122 | I98N (ATC→AAC) | dps | Fe‑binding and storage protein, stress‑inducible DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/67); new base T (9/2); total (51/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.57e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCACAGGAATTTATCCA‑GGTCGCGAGACGCGGCGGTCAGGATATCTGCGGTGTCGTCATCTTTCGCTTCGCCAATCGCTTTGCGTACGTC‑ATTAGCGACGAT‑TGCGTAACGGTCAGCCAGTTCTTTCAGGTGATCCTGAACGTTGTGGATGTCCAGCGGGTAACTTTTCAGCGGGGTTTTGCTGTTGATAACTTGA‑GTGGT‑‑CCCCAGAGCTACACCGCCCAGC‑TGCACTGCACGTTCTGCCATGGTATCCAGATGATCGATCAGTGCGGTGCGGAAGCCATCCAGCATTTCATGTACGGCAATGAAGTTAGCGCCGCGCATGTTCCAGTGCGCTTGTTTGGTAATCAAAGAAAGATCAATAAACTGGATAACCTGGCGATTCAGCAACTCTACTGTTGCTTTTTTCTCGCTGTCGGAGACATC > NC_000913/848381‑848854 | aaaGTTCTGCCCCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCACAGGAATTTATCCA‑GGTCGCGAGACGCGGCGGTCAGGATATCTGCGGTGTCGTCATCTTTCGCTTCGCCAATCGCTTTGCGTACGTC‑ATTAGCGACGAT‑TGCGTAACGGTCAGCCAGTTCTTTCAGGTGATCCTGAACGTTGTGGATGTCCAGCGGGTAACTTTTCAGCGGGGTTTTGCTGTTGAt < 2:1005090/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |