Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,532,593 | C→A | 13.8% | intergenic (‑156/‑223) | yhgE ← / → pck | DUF4153 family putative inner membrane protein/phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,532,593 | 0 | C | A | 13.8% | 310.5 / 4.3 | 129 | intergenic (‑156/‑223) | yhgE/pck | DUF4153 family putative inner membrane protein/phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (80/28); new base A (2/19); total (82/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.26e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AGGTAGCAAACCAGACCCTGAAGTAATCCGGTAGCAATCATCCCCCAGCGTGTTGCGGGTGAAAGTTCAACGTTATCCATGTTGGTTATCCAGAATCAAAAGGTGGGTT‑AATTATCGCATCCGGGCAGTAGTATTTTGCTTTTTTCAG‑AAAATAATCAAAAAAAGTTAGCGTGGTGAATCGATACTTTACCGGTTGAAT‑TT‑GCATCAATTTCATTCAGGAATGCGATTCCA‑CTCACAATATTCCCG‑CCATATAAACCAAGATTTAACCTTTTGAGAACATTTTCCACACCTAAAATGCTATTTCTGCGATAATAGCAACCGTTTCGTGACAGGAATCACGGAGTTTTTTGTCAAATATGAATTTCTCCAGATACGTAAATCTATGAGCCTTGTCGCGGTTAACACCCCCAAAAAGACTTTACTATTCAGGCAATACATATTGGCTAAGGAGCAGTGAAATGCGCGTTAAC > NC_000913/3532358‑3532827 | aaaCCAGACCCTGAAGTAATCCGGTAGCAATCATCCCCCAGCGTGTTGCGGGTGAAAGTTCAACGTTATCCATGTTGGTTATCCAGAATCAAAAGGTGGGTT‑AATTATCGCATCCGGGCAGTAGTATTTTGCTTTTTTCAG‑AAAATAATCAAAAAAAGTTAGCGTGGTGAATCGATACTTTACCGGTTGAAT‑TT‑GCATCAATTTCATTCAGGAATGCGATTCAA‑CTCACAATATTccc > 2:8645/1‑238 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |