| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,671,664 | A→C | 10.5% | V77G (GTG→GGG) | yhjB ← | putative DNA‑binding transcriptional response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,671,664 | 0 | A | C | 10.5% | 321.1 / 5.0 | 129 | V77G (GTG→GGG) | yhjB | putative DNA‑binding transcriptional response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/56); new base C (2/16); total (57/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.01e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
ACATGGTTAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTC‑CGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCA‑CTATTTACCGCCAACGCAAATGT‑CTCGACGGTTGAATCAC‑GAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTATTGCAATCCGTCGCCGTAATTAACACCTTAACCTCAGGAAATTGCACCACGGTTTTTTGCAGCAACCAGTAGCAAAACTCACCATCCTGATCGCCATCGAGCATAACTAAGGCTTCAGGGTAACTTTCCAGCTTTTGCCATAACTCGTCTGCCTGACTGGCCCCCTGAATACTCACTCCTGGAATACGCTGCTGT‑AAACTGATTTTCATTCCATGAATAAATATTGACTGCCTGTCAAACATGACTATTTGCATAACTGAATC > NC_000913/3671437‑3671902 | tAAAATCTCCCGCTGGCGGGCGCTTAACGATTTGAGATCTTTAATGTCCTTTTC‑CGGCGTCGTCCGCCAGTCTCCAGGCAGAAACATCATCCCCATCGCCGCA‑CTATTTACCGCCAACGCAAATGT‑CTCGACGGTTGAATCAC‑GAGGCACAATGGCCAGCACATTAAAATGGATAACTTCCTGTAACCACCGTTTATTGCAATCCGTCGCCGTAATTAACACCTTAACCTCAGGAAAtt > 2:855944/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |