| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,308,356 | G→T | 21.7% | L42M (CTG→ATG) | alsE ← | allulose‑6‑phosphate 3‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,308,356 | 0 | G | T | 21.7% | 143.2 / 34.3 | 60 | L42M (CTG→ATG) | alsE | allulose‑6‑phosphate 3‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (22/25); new base T (8/5); total (30/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.22e-01 | |||||||||||
CATGACCGTAATTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACCACAGAGAAAATGC > NC_000913/4308075‑4308638 | cagtaacGTAATTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTTGCGTCTCCGTGTTAAGGATCAGCCTCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTggg < 1:534349/282‑1 (MQ=255)cATGACCGTAATTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTggg < 1:440503/288‑1 (MQ=255) aCCGTAATTTTTTCTGCCTTTTGGATATAGTATTTCCTGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACaa < 2:333798/289‑1 (MQ=255) aaTTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGa < 1:301564/289‑1 (MQ=255) ttttACGGGCCCTATGACTATATTATGTCTTGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAAGATCGGCCCCACTATCATGTCCTGACGGCGGATTTGATCAATCAGGCGGACCGCCTGGCCGTTGATGGTACCCGGATGGAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCCGTTGGGCAATGTAAGCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGGCAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGAAAAAGTGAcc < 2:374235/289‑1 (MQ=255) tATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTc < 1:248544/289‑1 (MQ=255) ataGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTgg > 1:256602/1‑289 (MQ=255) ataGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTgg > 1:97635/1‑289 (MQ=255) ataGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTgg > 2:405144/1‑289 (MQ=255) aGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGaa > 2:342419/1‑289 (MQ=255) tATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGACATCGATGTGGAAGt > 1:69876/1‑289 (MQ=255) ttCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTaa > 2:287469/1‑288 (MQ=255) tCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATc > 1:525175/1‑289 (MQ=255) aaCTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATg > 1:150045/1‑285 (MQ=255) aGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTaa > 1:233020/1‑289 (MQ=255) aGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTCACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGAACGTCCATGATATCGATGTGGACGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTaa > 1:155711/1‑289 (MQ=255) gCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATATGTTCTTTaaa > 2:84675/1‑289 (MQ=255) atgacgtcggtttttcacacctaGGCGGCACGGCTGGCCGGCGATGGTGTCCGGATGCATAGTGTTGAAAGCTTCTCCCGACCGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGGCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGATGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATa < 2:535735/267‑1 (MQ=255) atgACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATa < 2:150045/289‑1 (MQ=255) tgACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATac < 1:287469/289‑1 (MQ=255) ggcggATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATAcaca < 2:256602/288‑1 (MQ=255) cggATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGCTAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTa > 1:293446/1‑289 (MQ=255) aTTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAAc < 1:342419/288‑1 (MQ=255) tttCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACg < 1:143190/288‑1 (MQ=255) ttatctcaagcaGGCGGAGCGCCTGGCGGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAATTCTGCTCCCGCACGGGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGGGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACg < 2:69876/283‑1 (MQ=255) tcaatcaGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAggggg < 2:233020/289‑1 (MQ=255) cGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTc < 1:405144/288‑1 (MQ=255) tggtGGTTTCCGGATGCATATTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttact < 2:320287/286‑1 (MQ=255) tGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttact < 1:196504/289‑1 (MQ=255) tGATGCATTCCGGATGCAGAGTGATAAAAGCTTCACCCGAACGCGCCATTTGGGCAAAGTAATACTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGGGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGAGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTTTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttact < 2:293446/289‑1 (MQ=255) atgaAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCg > 2:359725/1‑289 (MQ=255) tCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGcc > 1:152886/1‑289 (MQ=255) tCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGcc > 2:361218/1‑289 (MQ=255) tGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTAATGTTCAATTCATTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGcag > 2:332033/1‑286 (MQ=255) cgcCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATc > 2:218424/1‑288 (MQ=255) tGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGccc < 1:359725/286‑1 (MQ=255) gCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATcacc > 2:282344/1‑289 (MQ=255) cGGCCGCGTCACCATCGAAGGCAAGTGGGGAGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCGGACTTACGAGGAACAGTGAGAGTGGCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAAt < 2:152886/288‑1 (MQ=255) cGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTcagca < 1:289857/173‑1 (MQ=255) cGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTcagca > 2:289857/1‑173 (MQ=255) cGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATa > 1:234375/1‑289 (MQ=255) aGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttactt < 1:70197/200‑1 (MQ=255) aGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCcttactt > 2:70197/1‑200 (MQ=255) tCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAg > 1:238736/1‑288 (MQ=255) aGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCg > 1:3480/1‑289 (MQ=255) tttAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCgttgtt > 2:259084/1‑289 (MQ=255) tAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTcagca > 2:131992/1‑138 (MQ=255) tAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTcagca < 1:131992/138‑1 (MQ=255) gaGTTGCCAGGTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGa < 2:3480/288‑1 (MQ=255) tGCCAGTTTTGTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAATGGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATg < 2:487023/287‑1 (MQ=255) aGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACgg > 1:527656/1‑193 (MQ=255) aGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACgg < 2:527656/193‑1 (MQ=255) tttttAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCg < 1:282344/286‑1 (MQ=255) ccTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAAcc < 1:361218/289‑1 (MQ=255) aCTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAAt < 2:162723/231‑1 (MQ=255) aCTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCATATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAAt > 1:162723/1‑231 (MQ=255) cTTACGAGGAACGGGGAGAGTGTAAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGAGTTCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGGTCGATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGcc < 2:297225/288‑1 (MQ=255) aaCGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACcaca > 2:379557/1‑289 (MQ=255) cGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACCACaga > 2:547895/1‑289 (MQ=255) gtgtCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACCACAGAGAAAATgc > 1:106778/1‑289 (MQ=255) | CATGACCGTAATTTTATCGGCCTTATGGATATAGTATTTCATGGCCTCAACTGGCGTCTCCGGGTTAAGGATCAGCCCCACTTTCATGTCATGACGGCGGATTTCATCAATCAGGCGGAACGCCTGGCCGTTGATGGTTTCCGGATGCAGAGTGATGAAATCTGCTCCCGCACGCGCCAGTTGAGCAATGTAATCCTGCGGCCGCGTCACCATCAGATGACAGTCGAGCGGTTTAGTTGCCAGTTTTTTAACCTGACTTACGAAGAACGGTGAGAGTGTCAGATTGGGGACAAAGTGACCGTCCATGATATCGATGTGGAAGTAATCGGCATGGCTGTCGATAAATTCGATCTGTTCTTTAAATTTCAGCAGATCCATACACATTAACGAGGGGGAGATTTTCATGTTCAATTCCTTACTTACTGATAAGACGGTCAAGGGCGACAGCCGCGATAATTAATCCGCCCATCACCACCAGTTGGTAATAGGTTTGTACCTGCAAAATATTCAGACCGTTGTTGATGGTGCCGATGATCAACCCGCCAATCACCACAGAGAAAATGC > NC_000913/4308075‑4308638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |