| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 3 (0.070) | 47 (1.160) | 36/284 | 0.1 | 94.0% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑483) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGC > NC_000913/1292891‑1293172 | cgctgatgtccggcgctgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacctt > 1:447851‑M1/142‑143 (MQ=255)aTGTTGTTCATAATTTTAATTGCTTCGCTCATTGTAGTAAACACAAACTTAAATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAAGAATAGAGCCTGAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAtttt < 2:114716/143‑1 (MQ=255)aTGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTAAgttt > 1:637941/1‑143 (MQ=255) ctgatttgcggcggtgctgttgctgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactatttctgtaagttggcagcatcaccTtgt > 1:359656‑M1/140‑143 (MQ=255) ctgatgtgcggcggtgcttttgccgttacgctgcaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccaatggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTtgt > 2:170839‑M1/140‑143 (MQ=255) ttCAGAATTTTTAGTTGTTCGCTTATTGTAGTAATCTCAAACATATAATGGGGTGGTATGGGGAGGTAATAATAGAGCCGTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccg < 2:34940/143‑1 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTCTTTTGTGCCGgg < 2:498025‑M2/143‑3 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGACGggt < 1:103801‑M2/143‑4 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCAGTGTAGTAATCTCAAACGTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTTTGCCGggta < 2:153532‑M2/143‑5 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGATCTTTATTTTGTGCCGggtaa < 2:410380‑M2/143‑6 (MQ=255) cggtgcttttgccgttaagcaacacgccgtcagtagatgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataa > 2:445388‑M1/129‑143 (MQ=255) cggtgagatagccgcaacgcaccacccgggcaggagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataa > 2:302936‑M1/129‑143 (MQ=255) tttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatga > 2:67708‑M2/1‑135 (MQ=255) ttactttcttcgctcATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTTGTTTGTTGAAGTAATAATAGAGCCTTACATTCAGTTGTGCAATAGCTATAAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgac > 1:85686‑M2/8‑134 (MQ=255) ttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgac < 2:677579‑M2/143‑10 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggcgcacctcaaaaacaccctcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacaTTATGCAGCCAAAAAATATCt < 2:356204‑M1/21‑1 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCt < 2:356134‑M1/21‑1 (MQ=255) gtgccggtgcgcacagccgcgtcagtagctgaagaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactagatcagtaagttggcagcatcaccTTGTTCCGCCAATAAATATCttt > 1:177793‑M1/121‑143 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCATTATCCAGTAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactacaact < 2:163425‑M2/143‑17 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaaatt < 1:519508‑M2/143‑18 (MQ=255) gccgtgacgctccaccccgtcagtagctgaacatgaggtacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTc > 1:509592‑M1/119‑143 (MQ=255) gttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaacaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcatcatcaccTTGTAACACCAAAAAAaatcttttaaaa < 2:505427‑M1/28‑5 (MQ=255) acgcaccaccccgtcagtagctgaacagtagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaaa > 1:266509‑M1/113‑143 (MQ=255) gcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccgtcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAtt < 2:630478‑M1/33‑1 (MQ=255) gcaccaccccgcgagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAtt > 1:260706‑M1/111‑143 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAg < 1:569091‑M1/35‑1 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcaccacaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTCCCCCCAATCAATATCTcttcataacctcag < 1:349450‑M1/35‑7 (MQ=255) taATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 2:355185‑M2/1‑112 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTTAGGTAATAATATATCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt > 2:67675‑M2/1‑107 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 2:697516‑M2/143‑37 (MQ=255) cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTCTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGa > 1:724623‑M1/99‑143 (MQ=255) agcttATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcag > 1:327511‑M2/3‑104 (MQ=255) tgatattgGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGATTTTTAAATTTAGTTGTGAAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAGGTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata > 2:396854‑M2/3‑101 (MQ=255) ctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCAGCCAAAAAATATATTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGc < 2:143836‑M1/51‑1 (MQ=255) tgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCa < 2:593328‑M1/52‑1 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCat < 2:433609‑M1/53‑1 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTATGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCatat < 2:55883‑M1/55‑1 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACACGGCAaata < 2:506327‑M1/56‑1 (MQ=255) ggttgctgtttgaggtaataaTAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat > 1:426751‑M2/10‑92 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGcc < 1:275005‑M1/59‑1 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGAATATAGcc > 1:227356‑M1/85‑143 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga > 1:167954‑M2/1‑90 (MQ=255) ggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTTAGTTGTGCAATTGGTAGGAGTGTAAGGAATTCAAAATTGTGCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgac > 2:609313‑M2/1‑89 (MQ=255) gtTTGTTGATGTAATAATAGTGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgact > 2:618938‑M2/1‑88 (MQ=255) ttttgagGTAATAATAGAGCCTTAATTTCAGTTTTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttg > 1:498025‑M2/3‑85 (MQ=255) tgttgAGGTAATGATAGCGCTTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttg > 1:340109‑M2/1‑85 (MQ=255) gttgACGTAATAATAAAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttatatgttcagataatgcccgatgactttgt > 1:291249‑M2/1‑84 (MQ=255) ttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 2:423958‑M2/143‑61 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAGATAGCCCTATTTaca < 1:722832‑M1/68‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTCCCGCCCACACATATCTTTTCATAAAATTCGCCATAAAAGACGCAGCATATAGCCCTCTTTaca < 2:198123‑M1/68‑1 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtcagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 2:620965‑M1/69‑1 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac > 2:578769‑M1/75‑143 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAACTTGTTCTTTATTTTGTGCCAggtaataactccaaataatagatagagttttatgttaagataataccggatgactttgtcat < 2:624234‑M2/143‑63 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgacgccaacatattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 2:162179‑M2/143‑63 (MQ=255) aGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgctagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatt < 2:50724‑M2/143‑64 (MQ=255) tagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGTCAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCga > 1:255302‑M1/72‑143 (MQ=255) ggTAATAATATAGTCTTATATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc > 1:732529‑M2/1‑79 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgat > 2:571347‑M1/71‑143 (MQ=255) taataaTAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAACGTAAGGAATTCAAAATTGCTCTTTAATTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgacgactttgccctgcag < 1:126580‑M2/143‑67 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTTTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTACCCAGAAAAGACGCCGCATATACCCCTATTTACaccgaaga < 2:149536‑M1/75‑4 (MQ=255) ataataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagct > 1:677579‑M2/1‑75 (MQ=255) ataGAGACCAAAACCCAGTTGTGCCATAGCCAGGAATGTAACGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttatcgataccgttttacgttccgctcatgcccgatgactttgtcatgcagctcca > 2:537911‑M2/1‑72 (MQ=255) gCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatccagctccatcgac < 1:263586‑M2/143‑77 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttcttgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcgtgccgctccacccatt < 1:358125‑M2/143‑78 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttgtatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccggtt < 2:659445‑M2/143‑78 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt > 1:163425‑M2/1‑64 (MQ=255) tAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGagtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaaccattttg < 1:690979‑M2/143‑81 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGGGGgaaaaaaactctgtcttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatagctttgtcatgcagctccaccgattataccaa < 1:151314‑M2/143‑85 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 2:260877‑M1/96‑1 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCACAATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 2:174819‑M1/96‑1 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAAACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGAGAGGTTaa < 1:176999‑M1/96‑1 (MQ=255) ttttGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATACAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgacttcaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca > 1:587287‑M2/1‑54 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGATaaa < 1:256747‑M1/97‑1 (MQ=255) aatatatacacttctacactcacttagtaagtttgcagtctcactTTGTGACGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCATAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaaa > 1:55614‑M1/46‑143 (MQ=255) gtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgctcgaaatcgttgacattcagctccaccgattttgagaacgacagc < 2:689782‑M2/143‑92 (MQ=255) gCAAAAGCCAGTAATGTAAGGAATTCGAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcga > 1:426152‑M2/1‑50 (MQ=255) caccatcatacactaagtcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCt > 1:336048‑M1/40‑143 (MQ=255) aTAGCCAGGAATTTAAGTAATTCAATATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgacaccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 2:609343‑M2/1‑47 (MQ=255) aTAGCCAGGAATGGAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 2:721554‑M2/1‑47 (MQ=255) tAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTTTTCTTTATTTTTATCCGtgtaatgactccaacttattgatagtgtttgatgtgcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactta > 2:689413‑M2/1‑46 (MQ=255) aGCCAGGAAGGTAATGAATTCAAAGTTGTTCTTTATTTTGTGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc > 1:240099‑M2/1‑45 (MQ=255) catacactaagtcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTCAAACTTCCTGATTCa < 1:248874‑M1/110‑1 (MQ=255) tacactaaatctgtaagttggcagcatcatcTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATg > 2:364558‑M1/32‑143 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCCGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTAAAACCGATGATTAAGCAGCACATGAGGTTAAAACTTCCTGAGTCATGt < 2:344123‑M1/113‑1 (MQ=255) taaagcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAAAAGGAATATAGCACTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGGTAAAAATTCCTGATTCATGTaaca < 1:225619‑M1/117‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTTCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggt > 1:330625‑M2/1‑27 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaccttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatacaactccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggt < 2:172047‑M2/143‑117 (MQ=255) aagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATggg < 1:109682‑M1/126‑1 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgtcaggtgct > 1:423958‑M2/1‑24 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct < 2:513068‑M2/143‑120 (MQ=255) aaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgc < 1:43158‑M2/143‑122 (MQ=255) tGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattcatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctgcaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctc > 1:697516‑M2/1‑19 (MQ=255) cagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCTCTATTTACACCGCTGCTTTCGCAGCATGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACACTTTATGGGGAgatga < 1:504541‑M1/133‑3 (MQ=255) gcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATc > 1:593328‑M1/9‑143 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttattttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagatt < 2:498748‑M2/143‑130 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgaatttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccgggtgctgcctcagatt < 1:101908‑M2/143‑130 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtgttatgttcagataatgcccgatgactttgtcaagcagctacaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcgaggtgctgcctgagaat < 2:385124‑M2/143‑130 (MQ=255) tcagcttGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACGCCGATGATTTCGCAGAACGTGCGGTTAAAACTTCCTGATTCAGGTCACAGTTTATTGGAGGAGTCTCGTa > 1:381964/6‑143 (MQ=255) caccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAg > 1:356204‑M1/5‑143 (MQ=255) ttttGGGCCGggtaatgactccaacttatggatagtgttttatgtgcagataaggcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcagg > 2:263586‑M2/1‑10 (MQ=255) | ATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGC > NC_000913/1292891‑1293172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |