New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4606079 = | 76 (1.060) | 8 (0.140) +AAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGG |
3/230 | 9.7 | 11.1% | intergenic (+38/+1) | yjjZ/leuV | uncharacterized protein/tRNA‑Leu |
? | NC_000913 | = 4606402 | 83 (1.160) | noncoding (1/87 nt) | leuQ | tRNA‑Leu | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGC > NC_000913/4606267‑4606544 | tACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCAt > 2:683208/1‑143 (MQ=255) tACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCAt > 2:126841/1‑143 (MQ=255) tACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCAACGTCCGTAAGGCCGCTAACAGCTGAAGCGAGCGCGTCTACCAATGCCGCCACCTTCGCATACCAt > 2:852635/1‑143 (MQ=21) tACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTGTAACACCAACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCAt > 1:944641/1‑143 (MQ=255) aCCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATc > 2:774759/1‑143 (MQ=255) ccAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCa > 2:1043826/1‑143 (MQ=255) cAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGGCTACCACTTCCGCGACCGTCGCATCCCATGaa > 2:860271/1‑143 (MQ=21) aTTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACTTGAAGCTAGCGAGTTAAGCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAAtt > 1:11842/1‑143 (MQ=21) aTTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTCAGCCCAGCGCGTCTACCAATCCCGCCACCTTCGCATCCCATCCAtt > 2:571337/1‑143 (MQ=21) tCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCt > 2:1065280/1‑143 (MQ=255) tCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCt > 2:1062627/1‑143 (MQ=255) cGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCCTCAATGCTTa > 2:13424/1‑143 (MQ=255) cGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTCTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTGCAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAAtcccca > 1:433745/1‑138 (MQ=255) gCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGCCTTGAACCCCCACGTCTGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCCTCGCATACCCTCAATTCTTac > 1:454042/1‑142 (MQ=255) gCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTCACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCACCAATTCTTac > 1:783885/1‑142 (MQ=255) gCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACCCCTGAAGCTAGCCCGTCTACCAATCCCGCCCCCCCCGCATACCATccacccttac > 1:783884/1‑134 (MQ=21) ccTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCGCACGTCCGTAAGGACCCTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCCCCTTCGCATACCATCAATTCTTAAACAg > 2:343654/1‑143 (MQ=255) ccTTCGCCCAGCGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAg < 2:805162/143‑1 (MQ=255) gCCCAGTGCGAGCCATATCAACGTGGTTGTTGGTGCGAGGGGGGGCACGTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTg < 2:532301/143‑1 (MQ=255) ccAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACAATAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCt > 1:806790/1‑143 (MQ=255) cGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCAacgacg > 1:1023447/1‑143 (MQ=255) tttctCAACGTTGCTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTGGAACCCCCACGTCCGTAATAACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGgc < 1:162810/139‑1 (MQ=18) tatCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATGCCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGgcgc > 2:389630/1‑143 (MQ=255) tCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAACAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCAt > 1:578837/1‑143 (MQ=255) cAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGCGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCCTACCATCAATTCTTAAACAGAATTGCTACCACGGAGgcgcgtc > 1:294256/1‑140 (MQ=255) agagaggTTTGTGGTGCGCGGGGGGGGACTTGACCCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTc < 1:622681/138‑1 (MQ=255) tcgcctcgtttGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGAACACTAACACATGCCGATAGCGGGTCTACCAATTCCGCCACCTTCACATAACATGAACTGTTCTATAGAGTTGCTACCCCGGAGGCACAtgca > 2:227808/9‑140 (MQ=2) aCGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATGCCATCAATTCTTACAACGAATTGCTACAACGGAAGCGCTTTcg > 1:999641/1‑142 (MQ=18) cGTGGTGTTCGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTa < 2:23668/143‑1 (MQ=255) gggtggtGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTg < 1:780524/137‑1 (MQ=255) gTTTCTGGTGCTCCGGGCGCGACTTGCTCCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTgg < 1:924060/143‑1 (MQ=21) tttttGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCGCTCGGCCGGAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGt > 1:92409/1‑143 (MQ=255) tgtttGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGt < 2:560220/141‑1 (MQ=255) ttttGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTTACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGtt < 1:11748/143‑1 (MQ=255) tGGTGCGAGGGGGGGCGCTTGGACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAACTGCTACCACGGCGGCGCATTCTAGTGGTTTTc < 1:651709/143‑1 (MQ=21) gTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAg < 1:126841/143‑1 (MQ=255) gTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAg > 2:877701/1‑143 (MQ=255) ggggggggACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACTTCTTTCCTTTTTACCACCACCAATTCCGGCGACTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTc < 1:263683/143‑1 (MQ=21) gggggagtttccaCCCCCACCTCCGCAAGGACCCTACCACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGt < 1:164669/131‑1 (MQ=25) caggggACGTGACCCCCCACGTCCGTAAGGACACTAGCACCTGAAGCTAGCGCGTCGACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGt < 1:1082366/141‑1 (MQ=255) ggggACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGCGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTcg > 2:42455/1‑142 (MQ=255) gcgACCTGCACCCCCCCGCCCGTAAGGACACTAACCCCTGATGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCaa < 1:83772/141‑1 (MQ=37) ggACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAAt < 2:759814/143‑1 (MQ=255) aCTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCGTTTCGTCAATAg > 2:1030978/1‑143 (MQ=255) ttGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGCCGCATTCTAGTGGTCTTCAGCTTTTCGTCCATAGtt > 1:1100031/1‑143 (MQ=255) cccccACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATACCCCCACCTTCCCCTCCCATCAATTTTTAAAAAACACCCCCCCCACGGCGGCGCATCCTCGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCCATAGTTAAttc > 2:1242025/1‑142 (MQ=18) ccccACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTAt > 2:387133/1‑143 (MQ=255) ccGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCTTCCACCAAGTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACagag < 2:1178143/143‑1 (MQ=255) ccGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACagag < 2:173892/143‑1 (MQ=255) ccGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTAGAATACCAGCAATTCTGAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACagag > 1:888586/1‑143 (MQ=255) ccGTAAGGACACTAACACCTGAAGCGAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACagag < 2:1038664/143‑1 (MQ=255) ggACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTaa < 2:726214/143‑1 (MQ=255) ggACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCACATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTaa < 1:15468/143‑1 (MQ=255) acTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTCTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAAtttc > 1:396186/1‑141 (MQ=255) ctgcccccTGAAGCGAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCt < 1:1065280/137‑1 (MQ=255) cTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCt < 1:1062627/143‑1 (MQ=255) tAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTg < 2:92409/143‑1 (MQ=255) ccTGAAGCGAGAGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTTGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGaaaa < 2:141623/143‑1 (MQ=255) cTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGaaaaa > 2:205295/1‑143 (MQ=255) cTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGaaaaa > 1:503234/1‑143 (MQ=255) tGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAATAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTTGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAAt < 2:1151337/143‑1 (MQ=255) tGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAAt < 2:707425/143‑1 (MQ=255) aaGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGt > 2:849063/1‑143 (MQ=255) aaGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTACAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGt < 2:412330/143‑1 (MQ=255) gcgcGTGTACCAATTCCGCGACATTGGCATACCATCAAGTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTCGAAAAATGTCCATCa < 1:1056115/143‑1 (MQ=255) tCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGaaa < 2:73500/143‑1 (MQ=255) ccAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAg > 1:1044399/1‑143 (MQ=255) cAATTCCGCCACGTTCGCAGACCACCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGc < 1:227808/143‑1 (MQ=255) cAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGc < 1:1043826/143‑1 (MQ=255) cAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCATTCAGGAAACTAGc > 2:82704/1‑143 (MQ=255) aaTTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATCGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCg > 2:616820/1‑143 (MQ=255) aTTCCGCCACCTTCGGATACCATCGATTCTTAAAAAGACTTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGGGGTTTTCAGCTGTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCGGGAAAGAGGGGCATCAGGAAACGAGCGt > 1:1252526/1‑143 (MQ=255) aTTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGt > 1:455066/1‑143 (MQ=255) cGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGACTTGCTACCACGGCGGCGCATTCGAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCTACAGAGGTGTAGTTGCTGGAAAAATGTCCCTCAGGAAAccgccgggcag > 2:420478/1‑133 (MQ=255) cGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAg > 2:232746/1‑143 (MQ=255) cACCTTCGCAGACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGtt > 2:271571/1‑143 (MQ=255) ccTTCGCATCCCACCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGtgtg < 2:422339/143‑1 (MQ=255) ccTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCCATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTg > 2:30116/1‑143 (MQ=255) ccTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTg < 2:11842/143‑1 (MQ=255) ttCGAATACCATGCGTTTTTAATAAGGATTGCTACCACGTAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCACTAGTTGATTATAGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAATCTAGCGTGCAGGTTTGGt < 1:1157992/143‑1 (MQ=255) cGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTat < 2:944641/143‑1 (MQ=255) gCATCCCATCAGTTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTatg < 1:912315/143‑1 (MQ=255) cATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTatgc < 1:1242025/143‑1 (MQ=255) | TACCAATTCCGCCACCTTCGCCCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTTTGGTGCGAGGGGGGGGACTTGAACCCCCACGTCCGTAAGGACACTAACACCTGAAGCTAGCGCGTCTACCAATTCCGCCACCTTCGCATACCATCAATTCTTAAAAAGAATTGCTACCACGGAGGCGCATTCTAGTGGTTTTCAGCTTTTCGTCAATAGTTAATTATCGACAGAGGTGTAATTGCTGGAAAAATGTCCATCAGGAAACTAGCGTGCAGGTTTGGTATGC > NC_000913/4606267‑4606544 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |