Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 384786 | 385052 | 267 | 20 [19] | [18] 20 | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine ABC transporter periplasmic binding protein |
CGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATA > NC_000913/384547‑384952 | cgcCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTc > 2:223715/1‑239 (MQ=255) tttttATTTTCCGAAGAAAGGGGGGCTTAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGttt < 1:223715/238‑1 (MQ=255) ttttttGCCGAAGAAAGGGGGGTTTAATTTAAAACCTTATCCCCTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgt < 1:358624/236‑1 (MQ=255) ttAATTGCCGAAGAAAGGAGGGATGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGGCACTCCATGTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgt < 2:262477/239‑1 (MQ=255) tCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGtt < 2:619255/166‑1 (MQ=255) tCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGtt > 1:619255/1‑166 (MQ=255) tCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgta < 2:738573/190‑1 (MQ=255) tCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgta > 1:738573/1‑190 (MQ=255) attatACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTTTGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGt > 1:439779/1‑168 (MQ=255) attatACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGt < 2:439779/168‑1 (MQ=255) cAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCa < 2:817023/139‑1 (MQ=255) cAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCa > 1:817023/1‑139 (MQ=255) agagACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCa > 2:15137/1‑120 (MQ=255) agagACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCa < 1:15137/120‑1 (MQ=255) atttttgttataaCTTAAAAGTAAGGGTTTTCATACCCGTTGGTTCGACTGGGGAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTAATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATGTACATTATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATa < 1:364854/230‑1 (MQ=255) attttgtttattaCTGAAAAGCTATGTTTTTCAGTCCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATa < 1:269090/227‑1 (MQ=255) ccGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGt < 2:563344/157‑1 (MQ=255) ccGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAAAAAGCATTGt > 1:563344/1‑157 (MQ=255) cTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatg < 1:57569/53‑1 (MQ=255) cTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatg > 2:57569/1‑53 (MQ=255) | CGCCAATAGCAAGGATACCCTTTCTTTTATTTGCCGAAGAAAGGAGGGCTGAATCTAAAACCTTATCCACTTAATGACACTCCATTTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGTAATATGCGAGTGATTGAGAATGATA > NC_000913/384547‑384952 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |