| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,326,039 | A→T | 19.7% | M432L (ATG→TTG) | yciQ → | enhancer of membrane protein expression, putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,326,039 | 0 | A | T | 19.7% | 129.9 / 2.4 | 51 | M432L (ATG→TTG) | yciQ | enhancer of membrane protein expression, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (5/35); new base T (9/2); total (14/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.88e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGAAGCGTTATTTCGTAAAGGCGATAAGGTCGTTCTTACGGGGAGACGCAACAGAGTCTTACGCAGGGCATTTTTACGGATGCAGAAATTTTATCTGCCGCGTAAAAAGTCTTCGTTTTACCGGTCTGATACTTTTTTGCAATGGGGTGGACTGGCAATATTGGCGGTCATTCTTTACGGTAACTTGAGTCCTGTAGGCTGGGCA‑GGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTG‑GATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCA > NC_000913/1325803‑1326267 | tGGAAGCGTTATTTCGTAAAGGCGATAAGGTCGTTCTTAAGGGGAGACGCAACAGAGTCTTACGCAGGGCATTTTTACGGATGCAGAAATTTTATCTGCCGCGTAAAAAGTCTTCGTTTTACCGGTCTGATACTTTTTTGCAATGGGGTGGACTGGCAATATTGGCGGTCATTCTTTACGGTAACTTGAGTCCTGTAGGCTGGGCA‑GGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATg < 2:743070/239‑1 (MQ=255) 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TGGAAGCGTTATTTCGTAAAGGCGATAAGGTCGTTCTTACGGGGAGACGCAACAGAGTCTTACGCAGGGCATTTTTACGGATGCAGAAATTTTATCTGCCGCGTAAAAAGTCTTCGTTTTACCGGTCTGATACTTTTTTGCAATGGGGTGGACTGGCAATATTGGCGGTCATTCTTTACGGTAACTTGAGTCCTGTAGGCTGGGCA‑GGAATGAGTCTGGTGGGCGATATGTTTATTATGATCTGCTG‑GATTATTCCTTTTTTATTTTGTTCCCTTGAGCTTTTGTTTGCCCGCGATGATGACAAGCCTTGCGTTAATCGTGTAATCATCACTTTGTTTTTACCACTGATTTGTTCAGGCGTGGCCTTCTATTCTCTCTACATCAATGTCGGAGATGTATTCTTTTACTGGTATATGCCAGCGGGTTATTTTACCGCTGTTTGCCTGACCGGTTATCTCACTGGCA > NC_000913/1325803‑1326267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |