Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,851,692 | T→G | 14.1% | V278G (GTG→GGG) | ansA → | cytoplasmic L‑asparaginase 1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,851,692 | 0 | T | G | 14.1% | 248.4 / 2.1 | 99 | V278G (GTG→GGG) | ansA | cytoplasmic L‑asparaginase 1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/44); new base G (12/5); total (50/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AGGGGAATTAATCGTTCATCCAATCACCCCACAACCAATTGGCGTAGTGACGATTTATCCAGGGATTTCTGCTGACGTCGTGCGCAATTTTCTGCGCCAACCGGTGAAAGCATTGATTCTGCGCTCCTATGGCGTGGGTAATGCGCCACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGACAC‑AATGTATGTCCGGTAAAGTGAACATGGGTGGTTATGCCACCGGTAACGCCCTCGCCCATGCCGGCGTAATTGGCGGTGCAGATATG‑ACTGTAGAAGCCACGCTAACCAAACTGCATTACCTGCTTAGCCAGGAACTGGATACTGAAACCATTCGCAAGGCCATGAGCCAAAACCTGCGCGGCGAACTGACG‑CCGGATGATTAAGGAGACTGTAATGCCCCCTCGCGCCCTGTTACTGGTCGATTTACAAAATGATTT > NC_000913/1851456‑1851930 | aGGGGAATTAATCGTTCATCCAATCACCCCACAACCAATTGGCGTAGTGACGATTTATCCAGGGATTTCTGCTGACGTCGTGCGCAATTTTCTGCGCCAACCGGTGAAAGCATTGATTCTGCGCTCCTATGGCGTGGGTAATGCGCCACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGCATTGTGTGGGTAAACCTGAACC‑AATGTATGTCCGGAAAAGGGa > 2:674227/1‑239 (MQ=255) aTTAATCGTTCATCCAATCACCCCACAACCAAGTGGCGTAGTGACGATTTATCCAGGGATTTCTGCTGACGTCGTGCGCAATTTTCTGCGCCAACCGGTGAAAGCATTGATTCTGCGCTCCTATGGCGTGGGTAATGCGCCACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGACAC‑AATGTATGTCCGGTAAAGTGAACATg < 2:708055/238‑1 (MQ=255) aTTAATCGTTCATACAATCCCCCCACAACGAATGCGCGTAGTTACGATTTATCCAGGGAGTTCTGCTAACGTCGTGCGCAATTTTCTGCGCCAACCGTTGAAAGCATTGATTCTGCGCTCCTATGGCGTGGGTAATGCGCCACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGACAC‑AATGTATGTCCGGTAAAGTGAACATgg < 2:628590/239‑1 (MQ=255) ttAATCGTTCATCCAATCCCCCCACAACCAATTGGCGTAGTGACGATTTATCCAGGGATTTCTGCTGACGTCGTGCGCAATTTTCTGCGCCAACCGGTGAAAGCATTGATTCTGCGCTCCTATGGCGTGGGTAATGCGCCACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGACAC‑AATGTATGTCCGGTAAAGTGAACATggg < 2:259877/239‑1 (MQ=255) ttAATCGTTCATCCAATCACCCCACAACCAATTGGCGTAGTGACGATTTATCCAGGGATTTCTGCTGACGTCGTGCGCAATTTTCTGCGCCAACCGGTGAAAGCATTGATTCTGCGCTCCTATGGCGTGGGTAATGCGCCACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGACAC‑AATGTATGTCCGGTAAAGTGAACATggg > 2:508138/1‑239 (MQ=255) ttAATCGTTCATCCAATCACCCCACAACCAATTGGCGTAGTGACGATTTATCCAGGGATTTCTGCTGACGTCGTGCGCAATTTTCTGCGCCAACCGGTGAAAGCATTGATTCTGCGCTCCTATGGCGTGGGTAATGCGCCACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGTGGTCAACCTGACAC‑AATGTATGTCCGGTAAAGTGAACATggg > 2:549350/1‑239 (MQ=255) ttAATCGTTCATCCAATCACCCCACAACCAATTGGCGTAGTGACGATTTATCCAGGGATTTCTGCTGACGTCGTGCGCAATTTTCTGCGCCAACCGGTGAAAGCATTGATTCTGCGCTCCTATGGCGTGGGTAATGCGCCACAAAACAAAGCCTTCCTGCAGGAATTACAAGAAGCCAGCGATCGCGGTATTGTGGGGGTCAACCTGACAC‑AATGAATGCCCGGTAAAGTGAACATggg > 1:538183/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |