| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,545,453 | A→C | 14.8% | V52G (GTG→GGG) | murR ← | repressor for murPQ, MurNAc 6‑P inducible |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,545,453 | 0 | A | C | 14.8% | 238.7 / 2.1 | 97 | V52G (GTG→GGG) | murR | repressor for murPQ, MurNAc 6‑P inducible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/42); new base C (3/14); total (40/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.15e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
ACCTCAATGATTTTTTGCAGCCGCGCGTAATCGAGCAACGCGCAGGTTTGCTCCAGCGCCAGCTCTTTTTCGCGATTCAGTTTGCGCGCGATCACTTCCAGCGAATCATCACTGGTAATCGAACTGTGCAGGTGCAGTGCCGTGGCATTCGTTTTCTCCCGGCTGGCACTGTATTCGCCTATTAACGCCATACGCAATTCAGTAAATCCTTGCGCGCCGAGTTTTTGGGCAAATTTCACTATGCTCGACTGGCTAATGCCGAGCTGTTTCGCCATCTGCCGTGAAGAAACGGATTGCAGCTCACTCACGTTGGCCTGCAGAAAGTCAGCGATTTTTTGCTCGTTTTCGGTGAATTCACTCCCCGCATTGCTTATTTTCGTCAGGTACAACATCTTCCACTCTCCTGGGCTGGCAGCATAAATTCCGCTTAAGTTCTTATGACGCTCTTCACACTCTGCGAGTGTAGA > NC_000913/2545216‑2545682 | gccttattGATTTTTTGCAGCCGCGCGTAAGCGAGCAACGCGCAAGTTTGCCCCGGCGCCAGCTCTTTTTCGCGATTCAGTTGGCGCGCGATCACTTCCAGCGAATCAGCACTGGTAATCGAACTGTGCAGGTGCAGTGCCGTGGCATTCGTTTTCTCCCGGCTGGCACTGTATTCGCCTATTAACGCCATACGCAATTCAGTAAATCCTTGCGCGCCGAGTTTTTGGGCAAATTTCa < 2:409061/231‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |