Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 151,821 | A→G | 11.1% | T137T (ACT→ACC) | yadL ← | putative fimbrial‑like adhesin protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 151,821 | 0 | A | G | 11.1% | 327.7 / 4.2 | 134 | T137T (ACT→ACC) | yadL | putative fimbrial‑like adhesin protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/58); new base G (16/3); total (73/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.28e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAATATATACATCACCAAAATCAACAACAGAA > NC_000913/151589‑152058 | gTGGGGTTCCTATTTAGTTCCTGAAACTGTAAGTCTGTTTATTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGGAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACa < 1:898421/239‑1 (MQ=255) gTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGGGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TAACCAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGGGTTACa > 2:357200/1‑239 (MQ=255) gTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGGGGGGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGTGGT‑TTCACAGCTAAAATGGTT‑TGCACTCCCTTTTGCCGGGGTTACa > 1:115259/1‑239 (MQ=255) gTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTAATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGACGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACAAAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACa > 2:790187/1‑239 (MQ=255) atatatAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGGATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGGGT‑TAAACAGCTCAATTGGGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACATTG‑CTCCAg > 2:209121/1‑239 (MQ=255) atatatAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGAAGTGACATTTGTTTCGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCCCTCATCCGCTAATAAACGACCGCATTTGCTGCCGGGGGGGTTTGTACCTTTTGTTATGCTGGGGT‑TACACAGCTCAATTGGGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGGGGTTCAGTG‑CTCCaa > 1:893742/1‑238 (MQ=255) atataGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGGGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGGGT‑TACCCAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTGCCGTA‑GTCCAg > 2:258654/1‑237 (MQ=255) ttCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAAc > 2:432540/1‑239 (MQ=255) ccTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATGATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGGTTGTTACCTCTTGTGGTGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCCGTTGCCGGGGTTAAAGGG‑GTCCAAACTTAAAAgg > 1:783083/1‑239 (MQ=255) ccTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCCGTGGAGATTGTTAACTCTTTGGATGCAGGGGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCAATCCCTTTTCCCGGGGTTAAAGTG‑CTCCAGAAGTCAACgg > 1:255795/1‑239 (MQ=255) ccTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTAACCGCAGAGACATTGTTTAAGGTTTTATTTTTTTCCACGCCCATGCGGGCAATCCTCGGATAATAAAAGACCGCATTGGCTGCAGTGGTGATTGTTACCTCTTGTTAGTCTGGTGT‑TACACAGCAAAATTGTGT‑TGCACTCCCCGTTGCCGGGGTTAAAGTG‑CTCCAAACTTAAACgg > 1:765672/1‑239 (MQ=255) ccTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGAGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCCGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGGTGGTGT‑TACCCAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCCTTTGCCGGAGTTACAGGG‑ATCCAGACTTCAACgg > 2:488251/1‑239 (MQ=255) tttagggacatttttttttggTTATTTTAAATGGTGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTTTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCa < 1:453203/220‑1 (MQ=255) tGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTTCCGGAGTTCCAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGc > 2:87912/1‑238 (MQ=255) tGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGGGCCGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGGTTTATTTTTTTCAACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCCTTGGCTGCAGTGGAGATTGTTAACTCTTGAGGTTCTAGGGT‑TAACAAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCCTTTTCCGGGGGTACAGTG‑ACACAACATTCAACGGCGAccac > 1:676355/1‑235 (MQ=255) ttAAGGCTGTTAGTTATAGTTTATTTGTAATGTGGCTGGTTCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAGTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCGGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCGCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCAc < 1:377368/238‑1 (MQ=255) tAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCAATCCCTGTTTCCGGGGTTACAGGG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCCCt > 2:172246/1‑239 (MQ=255) tAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTAACCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGCTAATAAACGACCGCATTGGATGCAGTGGCGCTTGTTACCTCTTGTTATGCTGGTGT‑TACACAGCTACATTGTGT‑GTAATTTCCTGTTGACGGGGTTAACGCG‑TTCCTGACGTCAACGGGGACAGCACt > 2:439796/1‑239 (MQ=255) ttagttaTAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGGG‑CTCCAGACTTCAAAGGCGACAGCACTTGCTTTAt > 2:740786/1‑239 (MQ=255) ttagttaTAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGGGT‑TTCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACATTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACACCACTTTCTTTAt > 1:830009/1‑239 (MQ=255) ctaGGTTACTGTAAATGTCGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCCTCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGGGATTGTTAACTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTCAATTGTTT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGACGCCAGCACTTGCgttcttcgcgg > 2:867771/2‑231 (MQ=255) ataGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTCCCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCgg < 2:115259/239‑1 (MQ=255) ataGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCCTCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTTGAGATTGTTACCCCTTGTGATGCTGTTTT‑TAAACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCCGAGTTACCATG‑TTCCCAAATTCAACGACGCCAGCCACTGCCTTATCttct > 2:388542/1‑235 (MQ=255) ataGGTTACTGTAAATGTGGCTGGGGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGGGGAGATTGTTACCTCTTTTGAAGCTGTGGT‑TACCCACCCAAATTTGGT‑TGCACTACCTTTTGCCGGAGTTACAGGG‑CTCCCGACTTCAACGGGGACAGCCCTTGCTTTATTTTCgg > 1:723985/1‑239 (MQ=255) gTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGTAAACTTACCCGCCGTGACATTGTTTAAGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCAATCATCGGCTAATAAACGACCGCATTGGCTGCCGTTGGGATTTTTACCCCTTGTGTGGCTGGGGT‑TACAAAGACAAATTGGGT‑TTCCCACCCTTTTGCGCGGTTTACACTG‑TCCCAGATTTCACTGGGGACAACACCTGCTTTAttcttggctgt > 1:680269/1‑229 (MQ=255) gTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAAAGACCGCATTGGCTGCAGTGGCGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGCGT‑TACACAACTAAATTGTGT‑TGAACTCCCTGTTGCCGGAGTTCAAGTG‑CTCCCGACTTTAACGGCGACACAACTTGCTTTACTTTCGGCtgg > 2:860424/1‑238 (MQ=255) aCTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAATG‑CTCCAGACTTCAACGGCGCAACAACTTACTTTAACTGCggacgggga > 1:207232/1‑232 (MQ=255) aCTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCCGACAATAAAAGACCGCATTGGGTGCAGGGGAGCTTGTTACCTCTTTTGATGCTTGGGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCAACCCCCGTTTCCCGCGTTACAGGGCCTCCA‑AATTCAACGGCCACACCACTTCTTTTTTCTTTCGCTGTggg > 1:129869/1‑238 (MQ=255) cTGTAAATGTGGCTGGTGCCGAAAACTTACCCGCAGTGACCTTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCCCGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTTTGTTGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCGGTTGCCGTGGTTTCAGTT‑CTCCCGACTTCCCAGGCGACACCCCTTGCTTTTTCTTCGCCTGTggg > 1:719324/1‑237 (MQ=255) tGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAAc < 2:821863/239‑1 (MQ=255) tAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAAc > 2:103992/1‑237 (MQ=255) gCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATTCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACATTG‑CTCCAGACTTTAACGGGGCAAGCACTTTCTTTATTTGCGGCGGGGGAACCATTTGaaaa > 1:552564/1‑239 (MQ=255) gCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TCAACAGCTAAATTGGGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTCCAGGG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCAATTGCCTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGcca > 2:32790/1‑236 (MQ=255) gCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGCCAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCaa > 2:750708/1‑238 (MQ=255) gCTGGGGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGGGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TAAACAGCTAAATTGGGT‑TGCACTCCCCGTTGCCGGAGGTACATAG‑CTTCCGACTTCCACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTCCGGCTGGGGGACCATTTGGaa > 1:141870/1‑238 (MQ=255) gCTGGGGCAGAAAACTTAACCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTAATTTTTTCCACGACCAGGCGTGGCCCCATCGGACAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGTGTGTTACCTCTTATGTTGCTCGGGT‑TACACAGCTCACTTGGGT‑TGTACTCCCTGTTGCCGGAGCTACAGAG‑CTACGGACTTCAACGGCGCCAGCACTTTCTTTATCTGCGGGCGTTGGACCAttgcgaa > 1:379129/1‑233 (MQ=255) cAGAAAACTTTCCCGCAGGTGCATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCa < 2:179537/239‑1 (MQ=255) aGAAACCTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCa < 2:723985/238‑1 (MQ=255) aGAAAACTTACCCGCTGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCCCGACCAGGGGTGCCCTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCa < 2:858492/238‑1 (MQ=255) ttACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGGGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGGGGCAGCCCTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGGACCATTTGCAACCCCCGCAACgcgct > 1:452327/1‑234 (MQ=255) ccGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATGATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCa < 2:783083/239‑1 (MQ=255) aGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTCAAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACCGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTTCAAACCCCGAACCGGCATTACCAGtt > 1:215855/1‑238 (MQ=255) tccATTGTTTACGGTTTTGTTTTTTTCCACGACCATGCTTGCGCTCATCGGATAAGTAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTCTTTCCTCTTGTGATGCTGATGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGATCCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCt < 1:619896/237‑1 (MQ=255) aCATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑TTCCAGACTTCAACGGCGACCGCCCTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCCCCCCGCCCTTCCCCGTTCCCt > 2:279139/1‑238 (MQ=255) tttACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATTTCCGCGTGTGGAAACATTTGAAAAACCCCCACCGACATATGCAGTTCCCTCGCAtgg > 1:493626/1‑238 (MQ=255) ttATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGGACCCTTTGCAAACCACGCACCGGCCTTACCAGTTCCCTCGCCTGGGGcgcc > 1:481497/1‑233 (MQ=255) ttATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCtt > 2:596674/1‑239 (MQ=255) tATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGGTTGTTACCTCTTGGGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACAGCGACAGCACTGGCTTTATCTGGGGCGATGGAACAATTTGACAACCCGCCACCGCCATTAGCAGTTcccccccaagtaggcaggcag > 1:747565/1‑221 (MQ=255) tATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCCCCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTg > 2:257001/1‑239 (MQ=255) ttCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCCCACCGCAATTAGAAGTTCCCCCGCaatggacccgccgggttaaat > 1:244316/1‑219 (MQ=255) ccAGGCGTGCACTCTTCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTg < 2:255795/238‑1 (MQ=255) cccTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGTTGCAGTTGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGG‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTa < 1:368102/237‑1 (MQ=255) cACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCCTTTGCAAACCCCGCACCGTCATTACCAGTTACCTCGCATTTGGCTGGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTTTCCttttttt > 2:285232/1‑238 (MQ=255) cACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGATGTGGAACCAATTGCAAACCCCGCAACGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATTTGGCCCCTTTGTGTA‑AAATTTATTTTCGCttttta > 1:215360/1‑238 (MQ=255) ttCGGTTATTAACCGTCCGCTTTTGCTGTAGTTGTGTTTGTTTCCCGTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCT‑AAGTGTGTGTGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTCATTTGCGCTTTTTTATTggg < 1:258654/238‑1 (MQ=255) tacGGATAATAAACGGCCGTATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑CACACAGCTAAATTGTGT‑ATCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTggg < 2:57572/237‑1 (MQ=255) aTCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTTGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTggg > 2:355812/1‑239 (MQ=255) aTCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGGCATTAGCAGTTCCCTCCCATGTGGACGGCTTG‑GTTAAATTTTATTTG‑GGTTTTTTTTTggg > 1:362288/1‑239 (MQ=255) cGGATAATAAACGAACGCATTGGCTGCAGTTGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTGTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGa < 2:828093/239‑1 (MQ=255) aaaaacgccctacttGGCTGCAGTGTGGGTTGTTCCCTCTTGTGATG‑TGGTGTGTCCACAGTTTAATTTGGT‑TGCACTCCTTTTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCATCGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGGCAGTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCg < 1:530023/226‑1 (MQ=255) aaaCGTCCGCATTGGCTGCAGTTGAGTTTGTTTCCTCTTGTCATGCTGGTGT‑TACACCGCTAAATTGGGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑ca < 1:87912/239‑1 (MQ=255) aaaCGGCCGCATTGGCTGCAGTTGAGATTGTTACCGCTTGGGATGCTGGTGT‑TACCCAGCTAAATTGTGT‑GGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CGCCAGACGTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑ca < 2:206727/239‑1 (MQ=255) aaaCGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACCCAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑ca < 2:888423/239‑1 (MQ=255) aaaCGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCCCTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCCTTTGCAACCCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTTCCCTTTTTTTTTggggtacaccgcc > 1:684807/1‑230 (MQ=255) aaaCGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑ca < 2:318452/239‑1 (MQ=255) aaaCGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑ca < 1:103992/239‑1 (MQ=255) aaCGGCCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTAGCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑cac < 2:662455/239‑1 (MQ=255) aCGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTGGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑caca < 2:481497/239‑1 (MQ=255) ccATTGGGTGCGGGGGAGATTGTTTCCTTTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCttt < 2:452327/238‑1 (MQ=255) aGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTTCGCTTTTTTATTTGGGGTACCCG‑CACAGGCTTTTAATTTGGGtt > 2:884893/1‑239 (MQ=255) ggAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTg < 2:830009/238‑1 (MQ=255) ggAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CGCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTg < 2:93567/238‑1 (MQ=255) aTTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTTCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGaaagg > 2:697281/1‑236 (MQ=255) tgtttccctttGTGATGCTGGTGT‑TACCCAGCTAAATTGGGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGttt < 1:596674/230‑1 (MQ=255) tGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGGGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTC‑TATTTTATTTGCGCTTTTTTTTTAGGGATCACAG‑CACCAGATTTAAAATTTAGTTTGAAGGttt > 1:346646/1‑239 (MQ=255) tACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTTGGGATACCCG‑CCCCGGTTTTGAATTTTGGTTTTAATGTTTTTa > 1:785722/1‑239 (MQ=255) tgtgATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATCTGGCTCCCTTG‑GTT‑ACTTTTCTTTGGGCTTTTTTATTGGGGTTACCCC‑CACAGGCTTTGAATTTTTGTTTGATTGTTTTTATTTTgtt > 1:116154/1‑237 (MQ=255) ggTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑ACTTTTATTTTCGCTTTTTTATTGGGGGTCCCCGCCACGGTTTTTG‑ATTTGTGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGAAtt > 1:249674/1‑239 (MQ=255) tgt‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGa > 2:403716/1‑239 (MQ=255) ttccaggttAAATTTTGT‑TGCATTCGCTGGTGCACGAGTTACAGTG‑CGTCAGATTTCAACGGCGACAGATCTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCATCGTCATTAGCATTTCCCTCGCATGGGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGTGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGAttt < 1:488251/231‑1 (MQ=255) tACACAGGTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGAttt < 2:666346/239‑1 (MQ=255) cacaGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCa < 2:141870/239‑1 (MQ=255) cacaGCTAAATTGGGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCa < 2:481577/239‑1 (MQ=255) acaTCTAAATTGGGC‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGGT‑CCCCAGGCTTCAACGGCGACAGCACTTGCGTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTGTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAg < 2:379129/239‑1 (MQ=255) cTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGGGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAat > 2:104841/1‑239 (MQ=255) cTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GGT‑AATTTTATTTTCGCTTTTTTATTTGGGGAACCCG‑CCCAGTCTTTGATTTTGAGTTTGAAGTTTTTTTCTTTTTGCTTGGCAttttttttacaaaa > 1:889660/1‑227 (MQ=255) cTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGCTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATATGGCTCGCTTA‑GGT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTCGGCATTCCCG‑CACAGCCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGCAat > 2:843474/1‑239 (MQ=255) tAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGATTTACAGTG‑CGTCAAACTTCAACGGGGTCAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGGGGAACCATTTGCAAACCCCGCTCCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAata < 1:32790/239‑1 (MQ=255) tAAATTGTGT‑GGCACTACCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGaa < 2:789000/236‑1 (MQ=255) tAAATTGTGG‑TGCACTCCCTTGTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGaa < 2:893742/236‑1 (MQ=255) gggt‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAATATATACa < 2:299412/237‑1 (MQ=255) cACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAATATATACATCACCa < 2:362288/239‑1 (MQ=255) cACTCCCTGTTGACGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACGTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAATATATACATCACCa < 2:676355/239‑1 (MQ=255) cccaccTGTTGCCGGAATTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACATCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATGTCAGAAATATATACATCACCa < 2:696384/234‑1 (MQ=255) cTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAATATATACATCACCaaa < 2:552564/239‑1 (MQ=255) ctgtttGCCGGGTTTACAGTG‑CCCGAGAATGCAACCGGCACAGCACTGGCTTTATCGGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCTCCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTGTATTTGCGCTTTTTTATTGGGTATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTTATTTCAGAAATATATACATCTCCAAAATc < 1:285232/235‑1 (MQ=255) ccTGTTGCCGGAGTTACCGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAATATATACATCACCAAAATc < 2:765672/239‑1 (MQ=255) tGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCTGAAATATATACATTACCAAAATcaacaa > 2:195397/1‑239 (MQ=255) gAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGttt < 1:368857/180‑1 (MQ=255) aGTTACAGTG‑CCCCATACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAATATATACATCACCAAAATCAACAACAGaa < 2:704309/238‑1 (MQ=255) | GTGGGATGCATATATAGTTCCTGAATCTGTAAGTCTGTTAGTTATAGGTTACTGTAAATGTGGCTGGTGCAGAAAACTTACCCGCAGTGACATTGTTTACGGTTTTATTTTTTTCCACGACCAGGCGTGCACTCATCGGATAATAAACGACCGCATTGGCTGCAGTGGAGATTGTTACCTCTTGTGATGCTGGTGT‑TACACAGCTAAATTGTGT‑TGCACTCCCTGTTGCCGGAGTTACAGTG‑CTCCAGACTTCAACGGCGACAGCACTTGCTTTATCTGCGGCTGTGGAACCATTTGCAAACCCCGCACCGTCATTAGCAGTTCCCTCGCATGTGGCTCGCTTG‑GTT‑AATTTTATTTGCGCTTTTTTATTGGGGATACCCG‑CACAGTCTTTGAATTTGAGTTTGAATGTTTTTACTTTGGTCTTGGCATTGATTTCAGAAATATATACATCACCAAAATCAACAACAGAA > NC_000913/151589‑152058 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |