| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458787 = | 2 (0.040) | 48 (0.910) | 40/408 | NT | 96.1% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
ACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGC > NC_000913/458562‑459012 | atgacatccccgcggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggg > 2:466997‑M1/224‑226 (MQ=255) gacatgcccccggggccgtaagccagccccagacgtatcagagttgcagcatcgcgaatttcgcggcgggtggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgatagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGaaa > 2:232812‑M1/222‑228 (MQ=255) tCGATGCCATGGACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTTGTTATCGACGAGTAGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTTAATGTGGGGGaaa < 2:528308/227‑1 (MQ=255) ccaccccccggggccgtaagccagcccgagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcgtcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa > 1:35979‑M1/220‑228 (MQ=255) catccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa > 2:207063‑M1/220‑228 (MQ=255) agtccccccggggccggaagccgggcccagacgtaggagagttgcagcatcacgagtttcgcggcggagggttagagccccggcattgcgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACa > 2:162301‑M1/220‑228 (MQ=255) tACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGGGAATAATTAACCATTCCCATACAATAGGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATTTCCCCTTTAATTTTTCTCTTATTCTCGGCGTTGAATGGGGGGAAAACATCC > 1:91605‑M1/1‑228 (MQ=255) ccgggggccgtaagccagccccaggcgtagcagagttgcaacatcccgaatgtcgcggcggggggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATcccc > 2:144797‑M1/214‑227 (MQ=255) 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2:436761‑M1/228‑24 (MQ=255) aCGTCGAAAAAGTGGTTACCGGCGAGGCGGTAATTGGTGGACAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAAGGCAAGGCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccat < 1:112749‑M1/228‑29 (MQ=255) gccgggtttcaacatcacgaatttcgcgggggggggttagggccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCg > 1:614409‑M1/185‑228 (MQ=255) agagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattgcgtgccgaagtatccatttcttcggtcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATTCTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTg > 2:457629‑M1/183‑228 (MQ=255) 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NC_000913/458562‑459012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |