New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1293032 = | 2 (0.040) | 63 (1.180) | 45/414 | NT | 96.9% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑483) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGAACAGT > NC_000913/1292807‑1293249 | tcggtAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtg < 2:47266/228‑1 (MQ=255) ttAACAACAACTTCTAAGTTTTCCAGCATTTCTTCCAGGGTTTCAAGTGTACAGTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgc < 2:567981/228‑1 (MQ=255) attttctgtgtcttacagggttgaggagcggtgtaagtgaacggctgttgccttgttttacggcagtgagagcagagatcgcgcttatgcccggcggtgcttatgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcgccTTGTgc > 2:315055‑M1/223‑228 (MQ=255) tttgtggggcttaccggtgtgagaagcggtgtaagttaactgcagttgccttgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatttccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccg > 1:16405‑M1/221‑228 (MQ=255) ttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagcccctggagcacatcaaaaacaccatcatacactaaaacagaaaattggcagcctaaccTTGGgcc < 1:357898‑M1/7‑1 (MQ=255) ttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc > 2:532011‑M1/220‑228 (MQ=255) ttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccggcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacataagccactggagcacctcaaaaaacccaacctacactaaatcatacacttcgcagcatcacctaacccaat < 2:444743‑M1/9‑9 (MQ=255) tAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTTAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactcc > 2:541261‑M2/1‑216 (MQ=255) tAATTTTTCCAGAATTTCTCTCAGCTTTTCAAGTGTACATTCTTTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactcc > 1:254144‑M2/1‑216 (MQ=255) cgggtttagaaaggggtttaagtgaacggcatttgccatgttttacggcagtgaggacagagttagcgttgatttccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCt > 1:433479‑M1/208‑228 (MQ=255) aattttccAGCATTTCGTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCCCTTGCCTTCGCACGAAGATTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaa > 2:512144‑M2/3‑214 (MQ=255) ggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggggggacagctgatagaaacagaagccaatggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagatggcagcatccccATGTCCCACCAATAAAAAACtttt < 1:313914‑M1/24‑1 (MQ=255) ggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagggagagcagagatagcgctgatgtccggcggggcttttgccgttacgccccaccccgtcaggagctgaacaggaggggcagctgatagaaacagaagccactggagcacccccaaaacaccaacatccactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAAAAAAAAACttt < 1:360944‑M1/23‑1 (MQ=255) gttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggggggacagctgatagaaacagaagccactggagccccccaaaaaaaccaacataacccaaatcagaaaattggaaacatcaccCtgggcccccaaaaaaaacattttc < 1:258755‑M1/25‑10 (MQ=255) tCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGATGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGTGTTAATAATAAAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATTGCCAGGATTGAAAGGAATTCAAATTTGTCGTTTATTTTTGGCCGggcaatgaccccaccttat < 1:49110‑M2/228‑20 (MQ=255) gCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgat > 2:77880‑M2/1‑205 (MQ=255) tttttctTCCAGGGTTTCAAGTGTATATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgata > 1:418023‑M2/3‑204 (MQ=255) cATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTTTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAACTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgata > 2:320338‑M2/1‑204 (MQ=255) cATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACAATCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgata > 2:235505‑M2/1‑204 (MQ=255) tttCCTCCAGCGTTTCCAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAAGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagt > 2:49110‑M2/1‑202 (MQ=255) gtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgtacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcaccccaaaaaccccaccagaccctaaatccagaagttggaagcacacccCTTTTCCCCCAAAAAAAATCtttt‑ataaaaaaaaac < 1:658189‑M1/36‑7 (MQ=255) tttaatgtaactgcagttccacttttttacggcagtgagggcagagaaagcgttgatgcccggcggtggttttgccgttacgcacaaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagcccttggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGc > 1:423161‑M1/192‑227 (MQ=255) tgtaagtgatcgttagttgccttgttttacggcagtgagaccagagattgcgctgatgtccgggggtgctttggccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacgggagggacagctgatagaaacagaagccacgggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGc > 1:103564‑M1/192‑227 (MQ=255) cttttctAGTTTACATTTCTTTGCTGGCTAACGAAG‑GTATCGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTTCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAATTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAGTTTGTGCCGgggaatgactccaacgtattgatagtgttttaggtt > 1:206837‑M2/3‑192 (MQ=255) ctgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaaccggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctccaaaacaccatactacactaaatcagtaagttggcagcatacccTTGTGCCGCCAATAAACATCTTTTCTTAAAA‑TAAGCccgaaaaaag < 2:395773‑M1/46‑4 (MQ=255) ctgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagcaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttgccagcctcaccTAGGTCCGCCAATCAATATCTTTTCATAAAA‑TTACacagaaacaac < 2:33141‑M1/46‑5 (MQ=255) ggcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGAcg > 2:335053‑M1/181‑227 (MQ=255) gcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtcggggggggcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGAcgcg > 2:302039‑M1/180‑228 (MQ=255) tgtttttacggcggtgagggcagagatggccctgatggccgggggtgctttggccgttacgcccccccccgtcaggagctgaaaaggagggaaagttgatagaaacagaagacactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagaatgttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGc > 1:458124‑M1/171‑228 (MQ=255) atgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaaattggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAAAATCTTTTCATAAAA‑TTACCCAGAAAAAACCCGGcaaataac < 1:192708‑M1/58‑3 (MQ=255) atgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccgccggttcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaaccggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCCATTAATATCATTTCATCAAA‑TTACCCAGAAAAGCCGCGgcatattg < 2:58016‑M1/57‑3 (MQ=255) aggttgtacggaagggagagcaaggatgggtctgatgtccggaggtgcttgtgccgttacgcacccccccgtcagtagctgaacaggagggacatcgtaaagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGc > 2:509216‑M1/171‑228 (MQ=255) ttttttcgggcagggggaggagagatagcggtgaggtccgggggggcttttgccgttacgccacaccccgtcagtggctgaacaggggggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatccccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGc > 1:420412‑M1/170‑228 (MQ=255) acggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagatggcagcatcaccTTGTgccg < 1:390683‑M1/8‑1 (MQ=255) cggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc > 2:390683‑M1/163‑171 (MQ=255) cggcagtgaaaacagagacagcggtgatggccggcggggcttttgccgttacgcccccccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTa > 2:357898‑M1/163‑228 (MQ=255) gtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggaggggcagctgatagaaacagaaaccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagtttgcagcatcaccTTGTGCCGCCACTACATATCTTTTCATAAAA‑TTATCCAGAAAAAAACCGGCATATAgacctatttcaacca < 1:307403‑M1/71‑7 (MQ=255) gcACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttttcatgt < 2:235602‑M2/228‑65 (MQ=255) agatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactcaatcagtaagttggcagcatcaccTTGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAACCAGCAAAGAAGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGAtgatttacc < 2:397153‑M1/81‑4 (MQ=255) agatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAAAATCTTTTCATAAAA‑TTAACCAGACAAGCGGCGGCATATAGCCCAATTTAAACCGAtgatttacc < 2:314778‑M1/81‑4 (MQ=255) agaaagcgcggatgtccggcggtgctttggcctgtacgcaccaccccctcagtagatgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCg > 2:236186‑M1/148‑227 (MQ=255) gatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAAAACCGGCATATAGCCCTCTTTACACCGAAGAtttccca < 1:393009‑M1/82‑4 (MQ=255) taggggtgatgtccgggggtgctttggccgttccgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgcag > 2:159370‑M1/145‑227 (MQ=255) gcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacaccaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCTCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCAAATAgccctatttaaaccgagaattttcaacaag < 1:369372‑M1/86‑15 (MQ=255) gatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACCCGGCATATAACCCTATTTACACCGATAATTTTGCACCACGTGa < 1:138401‑M1/90‑1 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagatactgcccgatgactttttcatgcagttccaccgattttatgaa < 2:616225‑M2/228‑85 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcattcagctccaccgattttgagaa < 2:615249‑M2/228‑85 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGTGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgctagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgac < 2:651997‑M2/227‑89 (MQ=255) ggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGGTAGGTTaaaa < 2:452847‑M1/98‑1 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcaaccgattttgagaacgacacg < 2:236026‑M2/227‑92 (MQ=255) gtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAACCCTATTTACCACGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACtt < 1:550160‑M1/101‑1 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc < 2:10643‑M2/228‑103 (MQ=255) gttaccccccgccccggctgtaactgaacgggagtgacagcggatagaaacagaagccactggagcccctaaaaaacaccatcataaactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATg > 1:58016‑M1/116‑227 (MQ=255) tacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcagaaacaccatcataccctaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTAAACCAATGATTTCCAACCACGTGGTATTAAAACTAACTgattcaaagaa < 1:265250‑M1/115‑6 (MQ=255) gaacccacccgtcagtagctgaacaggaggcacagctgatagaaacagaagccactggagcctctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAt > 2:658189‑M1/111‑228 (MQ=255) aaccagcccgtcagttgaggaacgggagggacagctgatagaaacagaagccacgggagcacctcaaaaacaccatcataaacaaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGAATATAGCCCTATGTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTGCCTGATTCATGTCACAtt > 2:518659‑M1/110‑228 (MQ=255) cccccgcatgtggtgaaacaggagagacagcttatagaaacagagcccacgggagcccctaaaaaaccccaacatacactaaatcggtaagttggcagcaccaacTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTAt > 1:397153‑M1/106‑228 (MQ=255) cgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATgggg < 1:114670‑M1/127‑1 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag < 2:136899‑M2/195‑91 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCCTGTCACATTTTATGGTGAGAtt < 2:238127‑M1/132‑1 (MQ=255) aaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 1:136899‑M2/1‑104 (MQ=255) tgaaaaggagggacagcgtatagaaacaaaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcattaattgggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGt > 1:452847‑M1/92‑228 (MQ=255) gtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggggctgcctccgattcaggtta < 2:149295‑M2/227‑137 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctaaaaaaccccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCa > 2:393009‑M1/73‑226 (MQ=255) ataaaaacgaaagcccctggagccccccaaaaaccccaacattacctaaatcagtaaggtggcagcatccccTTGGGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCa > 1:33141‑M1/73‑226 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattc > 1:650982‑M2/1‑78 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGGTGAATGGCCTGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgaccttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgatcaattcg > 1:236026‑M2/1‑78 (MQ=255) aacagaagcccttggaaccactcaaaaaccccatcataacataaatcaggaatttggcatcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGtcttc > 2:307403‑M1/68‑227 (MQ=255) aacagaagccactggagcccctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGtcttc > 2:138401‑M1/68‑227 (MQ=255) aaatgaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacgataaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGACAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGtcttc > 2:258755‑M1/68‑227 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGCGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGGCTTCTGt < 2:194890‑M1/163‑1 (MQ=255) aataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgccagcgacttccgtcccagccgtgccaggtcctgcctcagattatggttatgccgcccaattccctg < 2:149497‑M2/226‑154 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTAtt < 1:266871‑M1/166‑1 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGAACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGGGATTATCGTAGGCTGAGGACCTTTCAGTCTTCTGTAt < 2:579738‑M1/165‑1 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCAAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGTGATTATCGAAGGCTGACGACCTTTAAGACTTCTGTAtt < 2:227650‑M1/166‑1 (MQ=255) agCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatat < 2:630969‑M2/228‑161 (MQ=255) gCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaaattattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttttagaacgacagcgccttccgtcccagccgtgccaggtgcggcctcagattcaggttattccgctcaattcgaggcgtatatc < 2:596773‑M2/228‑162 (MQ=255) cTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg > 1:253979‑M2/1‑65 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcgccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACgaga > 2:72162‑M1/47‑228 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCCCATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTAt < 2:232505‑M1/191‑1 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTAt < 2:400281‑M1/191‑1 (MQ=255) gCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaatccgctgcgtatatcgcttgcgtattacggacagcttt < 1:98007‑M2/228‑185 (MQ=255) caataaatcagtaagtgggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGaa > 2:192708‑M1/30‑228 (MQ=255) ttaAGGTATTAAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatggtgttttatgttcagataatgcccgatgcctttgtcatgcagctcccccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcagg > 1:615249‑M2/2‑35 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTTTTCTTTTTTTTGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagttttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggc > 1:10643‑M2/1‑34 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgc < 1:181232‑M2/152‑119 (MQ=255) aaGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct > 2:181232‑M2/1‑33 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGCGATTATCGTAGACTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGCGCATTCCCTATTAAGCGAatgatg < 2:286604‑M1/204‑1 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGTTTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAatgatg < 2:74563‑M1/204‑1 (MQ=255) ttCAAAATTGGTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcggga > 2:450989‑M2/1‑27 (MQ=255) gtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTCTAAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCTCTATTAAGCGAATGATGAAAAg < 2:90158‑M1/209‑1 (MQ=255) taagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGt < 2:25772‑M1/210‑1 (MQ=255) ttggcagcatcaccTTGTGCCGACAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGaa > 2:331512‑M1/15‑228 (MQ=255) ttggcagaatcccgTTGTGCCGCCAATAAATATCATTGCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGTCGCGGCATATAGCCCTATTTACACCTATGATTTCGCAGCACGTGAGTTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATAGGGAGATTGTCGTAGGCTGACGACATGTCAGTCATCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGaa > 2:605102‑M1/15‑228 (MQ=255) tGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcggatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcg < 2:594274‑M2/228‑210 (MQ=255) ttttttATTTTGTGCCGggttatgactccaccttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggc > 1:93883‑M2/1‑17 (MQ=255) ttCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcggggatcaaacagcgg < 1:657288‑M2/227‑211 (MQ=255) ttCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactcaaacttattgatagtgttttatgttcagataatgaccg < 1:134119‑M2/66‑50 (MQ=255) tCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 2:134119‑M2/1‑16 (MQ=255) atcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGAACAGt > 2:266871‑M1/7‑224 (MQ=255) | TCGTTAACAACAACTTCTAATTTTTCCAGCATTTCTTCCAGCGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTA‑CGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAA‑TTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTGACGACCTTTCAGTCTTCTGTATTAGTTGTGTTTACGAGAATTCCCTATTAAGCGAATGATGAAAAGTAGAACAGT > NC_000913/1292807‑1293249 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |