| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,158,652 | T→G | 15.6% | V55G (GTG→GGG) | oxyR → | oxidative and nitrosative stress transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,158,652 | 0 | T | G | 15.6% | 170.5 / 2.1 | 93 | V55G (GTG→GGG) | oxyR | oxidative and nitrosative stress transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/46); new base G (14/3); total (44/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.28e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
ATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGAC > NC_000913/4158428‑4158874 | aTAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGCCCCGCCGTAAA‑Gggtt > 2:281099/1‑228 (MQ=255)aTAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑gtgct > 2:315384/1‑226 (MQ=255) aTCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCAATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATACTGAATATT‑CGTGTTCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGCACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGAGTCGTGCCCCGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGC‑AATTAGTAAACATGTAAGCTGAGCTGGGCGTGATGTTGGGGGAGCGGCACAGGCGGAAA‑GTgtggtt > 1:481022/1‑228 (MQ=255) ttaTTGCTATTCTAGCTATCGCCGTGAGCTATCGTGGCGATGGTGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAAAACCTCCATTTTCGGCGTGCGGCGGATTCCTGCAACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGTAAATTCGTAAGC‑AGGAAGTAGAGCTGCGCGAAAGGTTGGGGGAGCGGACCAGCCGTCAA‑TGGTGGTTccac > 1:481389/3‑224 (MQ=255) tCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTGGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCAccc > 2:230743/1‑228 (MQ=255) tCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATATTCGGCGTCCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGCCGCTTATCGGGGACATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTGGCGGGAGCGGAACCGCGCTAAATGTTTTGTTcccc > 1:510971/1‑228 (MQ=255) cATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCGTATCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGCAGATGAGCTGGGCGTGCTGTTGCTGGAGCGGACCACCCGTAAA‑GGGTTGTTACCCCa > 1:205467/1‑228 (MQ=255) ttCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGCCCCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTAACCCAGGCGGGaa > 2:495669/1‑228 (MQ=255) ccTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGCTGAGCGTGGCGTGATGTTGCTGGGGCGGACCACCCGTAAA‑GGGTAGTTCACCCCGGGGGGATtggtg > 1:559386/1‑228 (MQ=255) ccTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GGGTTGTTAACCCAGGGGGGAAtgctg > 2:521038/1‑228 (MQ=255) ccTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAACC‑TGGAAGATTAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAACGGCCCAGCCGGGAA‑GGGTTGTT‑ACCCCCGCGGGaaaagatg > 1:457974/1‑222 (MQ=255) tATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCAACCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATgctgct > 2:97644/1‑228 (MQ=255) aTCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGGGATGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGTACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGGGGGAAAGcggctg > 1:160495/1‑228 (MQ=255) aTCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAGTGttgctg > 2:588696/1‑228 (MQ=255) aTCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACCCTTAGCGGGCCAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGGGCTGTTGCTGTGTCGGGCCAGCCCTAAA‑GTGGTTTCCACACAGGCGGGAATGctgctg > 1:562265/1‑228 (MQ=255) cGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGGGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GGGTTGTTCAACCAGGCGGGAAAGGtggtggg > 1:439939/1‑227 (MQ=255) cGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTAACCCAGGCGGGACTGCTGCtggt > 2:274445/1‑228 (MQ=255) cGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCGGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGCTGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCGGCCGTAAA‑GCGTGTTTCACCAGGGCGGGGATGTTGCtggg > 1:407064/1‑227 (MQ=255) cATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTACA‑GGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCtggtggtgg > 1:573263/1‑227 (MQ=255) gaccttgcGTGGGGATGGAGGATGGATAATGAAATTT‑CGTGATCTGGAGTACCGGGTGGCATTGGCTGACCACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGAt < 2:371592/219‑1 (MQ=255) ctttCGGGGCGATGGAGGATGATTAATGAATATT‑CGTGCTTTTGGTTCCTTGGTGGCATTGGCTGACCACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGgc < 2:439939/225‑1 (MQ=255) tCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGGCCACCCGTAAA‑GGGGTGTTCACCCAGGCGGGAAGTGTGCTGGGGGACAAGgcggg > 1:371592/1‑226 (MQ=255) gggggaatgggcgatggttAATG‑ATATTGCGTGGCTTTGAGTCCTGGGTGGCTTTGGCTTAACACCGCCATTTTCGGCGTTCGGCAGATTCCTGCCACATTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTa < 2:160555/216‑1 (MQ=255) gCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTACTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGGGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGCAAA‑GGGGAGTTACCCCAGGCGGGAATCTTGGTGTTGGGTCAGTCGGGTACCg > 2:256206/1‑228 (MQ=255) aTGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGTTAAGCTGGCCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCACCCGTAAA‑GTGTTTTTCACCAAGGCGGGAATGCTCCTGGGGGGTCAGGCGCTAACCggtc > 2:121824/1‑225 (MQ=255) tGGAGGATGGATAAGGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCGGGTGGCATGGGCTGAACCCCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGtgct < 2:443496/228‑1 (MQ=255) ggaggaTGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGGCTACCctgctg > 2:390439/1‑228 (MQ=255) gggatAATGAATGTT‑GTGGACCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTAACCACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGa < 2:513950/226‑1 (MQ=255) atAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGAGCAGgccgggaccgggcgcggtgagggg > 1:116499/1‑206 (MQ=255) atAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGGAAA‑GGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGGGCTT‑CGGGAgggg > 2:319361/1‑226 (MQ=255) agtGAATATG‑CGGGATCGTGAGTACCGGGGGGCATTGGCTAAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGaa < 2:59090/226‑1 (MQ=255) aTGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGGATGCGGCTGGTGGATCAGGCGGGTCCCGGGCTG‑Cgggggggggaa > 1:436357/1‑218 (MQ=255) taaaaggaacgggATGTTGGGTCCCGGGGGGCAGGGGTTCAACCCCGCCATTTTCGGCGGGGGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGaa < 1:434568/215‑1 (MQ=255) agAATTTT‑CGTTATCTTGAGTACTGGGGGGAATGGGCTGAACCCCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGaa < 2:436357/225‑1 (MQ=255) tgaatttgggTGATGTTGAGTACCTGGTGCCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGaaa < 2:391970/218‑1 (MQ=255) gAATATT‑CGTGATCTTGAGTCCCTGGTGGCAGTGGATGACTACCGTCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCGAGTTAGCCAGCCGACGCGTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAg < 2:347282/227‑1 (MQ=255) aaTATT‑CGTGATTTTGAGTACCTGGTGTCATGGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGGTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAg < 2:611712/226‑1 (MQ=255) tt‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATTTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GGGTGGTTCACCCAGGGGGGAATGCTCCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGGGCGG‑CGTGGGGGGAAAGACCTTa > 1:611712/1‑228 (MQ=255) aTCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGCTGTTCCTGGGGCGGACCAGCCGTAAA‑GGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCCGGTGAGTCAGGCGCGGACCCTGTCG‑GGGGAGGGGAAAGGCCTTAAAgaga > 1:310709/1‑228 (MQ=255) aTCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGAGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAAGGCTGGTGGGGGAGCAGTGGGGGACCGCGGTG‑CGGGGGGGGaaaagccatcaaaaaa > 1:516872/1‑215 (MQ=255) ccTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGGGCTG‑CGTGGGGGGAAAGGCCTTAAagccgtctctttta > 2:434568/1‑215 (MQ=255) ccTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTTCCTGGAGCGGACCAGCCGGAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAACGGTGCTGGGGGTGCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGGGGGGGGAAGAGCCTTAAagagcagggaaaccc > 1:525658/1‑217 (MQ=255) cTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGGATGCTGCTGGTGGACCAGGCGCGTACCGTGCCG‑CGTGGGGTGACAGTCCTTCAAGAGATGGCAAGcccg > 2:484983/1‑226 (MQ=255) cTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGGTCAGGGGCGGACCGTGCTGCCGTG‑GGGGAAAGTCCTTAAAGGGAGGGAAAGCcag > 1:245131/1‑228 (MQ=255) ggtggCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGGGAAAGGCCTTAAAGAGATGGCAAGCcagca > 2:336317/1‑228 (MQ=255) ggtggCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTAACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGCGGTGAAAGGCCTTAAAGAGAGGGCAAGccacca > 2:200054/1‑228 (MQ=255) ggtggCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGCCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GGGTAGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGCGTACCATGCTG‑CGAGAGGTGGAAGTCCTTAAAACGATGGAAAGCccgca > 1:322926/1‑228 (MQ=255) ggCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGGTGCCGGGGGGTCAGGGCCGTACCGTGCGG‑GCGGAGGGGAAAGCCCTTAAAAAAAGGGCAAGCCAGCAggg > 1:250903/1‑228 (MQ=255) ggcgaacccccGCCTTTTTGGGGGGGCGGCAGTTTCCTGCCAGGTTAGGCAGCCGGCGCTTGGGGGGCAAATTCGGAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGAc < 1:336317/219‑1 (MQ=255) gtgaaaacccGCCATTGTGGGGGTCGGGCAGATTCCTGCAACGTTGGCCGGCCGACGCTTAGGGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGAGGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGCGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACg < 1:258177/220‑1 (MQ=255) cccctttttGGGGGTGCGGCAGATCCCGGCCAGGTTAGCCGGGCGACGTTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGa < 1:95075/223‑1 (MQ=255) cGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGGTGTCCGGa > 2:534144/1‑228 (MQ=255) ggCGTGCGGTAGCTTCCTGCTAGGTTTGCCGGCCGACGCTTAGGGGGCAAATTAGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGcaca < 2:205467/228‑1 (MQ=255) gCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCCTAAA‑GGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCATGCGCGTACCTAGCTT‑CGTGGGGGAAAAGGCCTTCAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGGAACGAGGTCCCGACCGCTGCACCTTGGt > 1:175398/1‑228 (MQ=255) cGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGGGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCAACTTGGtt > 2:12015/1‑228 (MQ=255) tCCTGGCAGGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTcc < 2:457974/227‑1 (MQ=255) ctgcagggTTAGCCAGGCGACGCTTGGCGGGCAAATTCGGAAGC‑TGGAAGGTGGGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGGGGGCCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCca < 2:322926/220‑1 (MQ=255) gccgtgttcggcaggcGGCGGTTAGCGGGCAAGTGCGTAAGC‑TGGAAGATGGGCTGGGCGGGGTGGTGGTGGTGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAg < 1:495669/217‑1 (MQ=255) cGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTg < 2:245131/227‑1 (MQ=255) tttAGCCAGCCGGAGTTTGGGGGGAAAATTCGGAAGC‑GGGAAGTAGGGCTGGGCGGGAGTGGGAGGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGa < 1:274445/227‑1 (MQ=255) ttgcccggcgggcggttggCGGGAAAATTCGTAAGC‑TGGAAGGTGGGGGGGGCGGAGGGGTGCGGGCGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGa < 1:376227/209‑1 (MQ=255) tggccagccGAGGTTTGGCGGGAAAATTCGGAAGC‑TGGAAGATGGGCTGGGGGGGTTGTTGCTGGGGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGAcc < 1:534144/226‑1 (MQ=255) gccGACGGTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGGGCGGACCAGCCGTAAA‑GGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTAcc < 2:328450/227‑1 (MQ=255) cggtcgtttgggggggAAATTGGTAAGG‑TGGAAGGTGGGCTGGGGGGGATGGTGCGGGGGGGGGCCAGGCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTg < 1:315384/216‑1 (MQ=255) cGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCAACCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGGACAGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTACAGAGATGGCAAGCACGCAGGGCGAGACGATGTCCGAGACGCTGCCCATTGGATTGATTCCcacacgggaagcggaccctc > 1:247757/1‑212 (MQ=255) gttAGCGGGCAAATTGGTAAGC‑TGGAAGATGAGCGGGGGGGGAGGTTGCGGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 2:460736/227‑1 (MQ=255) gCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCat > 2:8052/1‑227 (MQ=255) ggggAAAATTCGTAGGC‑TGGAAGATGAGGGGGGTGTTGTTGTGCTGGGGGGGCCCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCatat < 1:588696/227‑1 (MQ=255) gggCAAATTCGTAAGG‑TGGAAGATTAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGATCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCatat < 2:160495/227‑1 (MQ=255) gggCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATAAGCGGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCatat < 2:472698/227‑1 (MQ=255) aattttgTAAGG‑TGGAAGGTTGGGTGGGGGTGATTTTGGGGGGGGGGACCAGCCGTAAA‑GGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGGGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc < 1:97644/222‑1 (MQ=255) aaaTTGGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc < 2:573263/228‑1 (MQ=255) aaaTTCGTAAGC‑TGAAAGATGGGCGGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc < 2:250903/228‑1 (MQ=255) tgcggaaGC‑TGGAAGGTGGGCGTGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCTGCCGTAAA‑GTGTTGTTCGCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTa < 2:407996/223‑1 (MQ=255) tgTAAGG‑TGGAAGGTGGGGTGGGGGTTGTGTTGCGGGGGGGGACCGGCCGTAAA‑GTGTTGTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTAtg < 1:12015/227‑1 (MQ=255) tAAGC‑TGGAAGAGGAGCTGGGCGTGATGGTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTAtg < 2:407064/226‑1 (MQ=255) tAAGC‑TGGAAGACGAGCTGGGCGTGATGTTGGTGGAGGGGACGAGCCGTAAA‑GGGTTGTGCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTAtgc < 2:510971/227‑1 (MQ=255) gaaagtagaaatgggaggggggGTGATTGTGGTGGGGGGGCCCAGCCGTAAA‑GTTTTGTGCCCCCGGGCGGGAATTCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTAtgc < 1:495023/209‑1 (MQ=255) gAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGGGACGATGTCCGGACCGCTGCCCATTGGGTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAg > 2:271417/1‑228 (MQ=255) gAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCt > 2:623500/1‑197 (MQ=255) gCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTcc > 2:463532/1‑228 (MQ=255) tggggggagttttgggggAGGGGGCCAGCCGGAAA‑GTGTTGTTCCCCCGGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGGACCGGGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTGAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCaa < 1:463532/212‑1 (MQ=255) tggtgtgGCTGGCGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCt < 2:525658/223‑1 (MQ=255) tGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACg < 1:306891/128‑1 (MQ=255) gttgtggggggggcccAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGaaa < 1:319361/213‑1 (MQ=255) tGGGGCGGCCCAGCCGTAAA‑GTTTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTAt < 2:562265/227‑1 (MQ=255) ggggagggACCCGCCGGTAA‑GTGTTGGTCGACCAGGCGGGAATGCGGCTGGTGGAACAGGCGCGATCCGGGCTG‑CGTGGGGTGAAAGTGCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCATACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTAt < 2:310709/221‑1 (MQ=255) gggcggccgcgacGTAAA‑GTGTTGTTGCCAGAGGCGGGAGTGGCGCTGGTGGGACAGGCGCGGGCGGTGCTG‑CGGGAGGTGAAAGGCCTTAAATAGATGGCAAGCCAGCAGGGGGGGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCt < 1:484983/215‑1 (MQ=255) cGGGCCAGCCGTAAA‑GTGTTTTTCACCCGGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTTCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCa < 1:307769/227‑1 (MQ=255) ggACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGGCGATGTCCGGACCGGTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTGGGAACGTACCTGCTCTCGCATATTATCCCTATTCTGAACCAGACCTTTCCCAAGCTGGAAATGAACCTGCAt > 2:168679/1‑227 (MQ=255) aGCCGTAAA‑GTGTGTTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTTGTTCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGGCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCATGGCGATACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGTCCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGca < 2:481022/228‑1 (MQ=255) gcgtaaaa‑GTGTTGGTCCCCCAGGCGGGAATTCTGCTGGTGGATGAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGcac < 1:230743/223‑1 (MQ=255) ccGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGcac < 2:559386/227‑1 (MQ=255) aaa‑GTGTTGTTCACCCAGGGGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGGCGGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGAc < 2:490018/227‑1 (MQ=255) aaa‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGAc < 2:116499/227‑1 (MQ=255) | ATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATT‑CGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACACCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGC‑TGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAA‑GTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTG‑CGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGAC > NC_000913/4158428‑4158874 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |