| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,609,768 | T→G | 22.4% | G118G (GGT→GGG) | prfC → | peptide chain release factor RF‑3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,609,768 | 0 | T | G | 22.4% | 81.5 / 2.4 | 59 | G118G (GGT→GGG) | prfC | peptide chain release factor RF‑3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (18/23); new base G (12/3); total (33/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.22e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAAAGGCCGTGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTATCTC > NC_000913/4609552‑4609990 | aaaaGGCCGTGGGTCCAACCAGTCCGGTAAGGCGGGCTGGATGGAGGTGGAAAAGCAGCGTGGGATCGCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCg < 1:642081/228‑1 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGTTACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTCCCTGTTGGTTTTCGACGCCGCCAAGGGGGTGGAAGATCGTACCCCTaa > 1:119087/1‑228 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTCCTGCCTGATGGTTATCGACTCCGCAAAAGGGGTTGAGGATCGTAccccaca > 2:651544/1‑224 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTAACGGCGTTGGACGGCTGCCTGATGGTTACCGACCCCGCAAAAGGGGTTGAGAATCGTACCCGTaa > 1:651452/1‑228 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCCGACGGCGGTGGCATTCTGACGTGTGGTGATGGACGCTGCAAAAGGCGTTGCAGAGCgacccccg > 2:364884/1‑219 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGCACCCTGACGGCGGTGGACGGCTGCCTGATGGTTATCGACTCCGCACAAGGGTTTGCAGATCGTACCCGGaa > 2:83436/1‑228 (MQ=255) cACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGtt > 2:557843/1‑228 (MQ=255) aCTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGCGGACTGCTGCCTGCTGGTTATCGACGCCGCCAAAGGAGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTccgc > 2:343102/1‑227 (MQ=255) tggagatggaAAAGGGGGGGGGGTCCTCCATTTCTTCGCCTGGGATTCAGTTTCCGT‑TCACCGATTGCCGGGTTAACCGGCTCCACACCCCGGGGCACGAAGACTTCCCGGAAGTTACCTATCTTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGc < 1:557340/228‑1 (MQ=255) gagatggaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCGGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGcc < 2:32956/227‑1 (MQ=255) atggaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGTTGGTTATCGACGCCGCACAAGGTGGTGCAGATCGAACCCCTAAGCGGATGGAAGTTACCC‑TCAGcgcggaaaccccacac > 1:423108/1‑216 (MQ=255) gaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGCCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTTGGCGGGACACGCCGGTCCTc > 2:241131/1‑228 (MQ=255) aaaaGCAGCGTGGGATCCCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAGGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCa < 2:119087/228‑1 (MQ=255) aaaaGCAGCGTGGAATCTCCATTACTTCGTCTGGTATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTTGTTAACCTGCTAGACACCCCGGTGCACGAAGACTTCTCGGAAGATTCCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCa < 2:358794/228‑1 (MQ=255) gTGGGATCTCCATTACGACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATg < 2:382743/185‑1 (MQ=255) ggctctcCTTTACTTCGGTTGTGGTGCGTGTTCCGTATCC‑CGCTTCCCTGGTTACCCGGCTCGCCACCCCGGGGATCGAAGTTGTCTCGGACTATATCGATCGTACCTGTACTGCGTTTGACTGCTGCCTGATGGTGATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCTTAATCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCGCCTTTATGAAc < 1:435966/224‑1 (MQ=255) ctcCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGCCTGATGCCCGATTGTTATCGACTCCGCAAAAGGTGTTGACGAGCGCACCCGTAAGCTGACGGAAGTTACCAGTCTGCGCGCAACGCCCACTCTGCCCCTTCAGAACAAACt > 1:239820/1‑228 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cGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTCCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCACAACGCCAATCCCAACCATTATGAAAAAAATTGAcctgacaa > 1:11400/1‑222 (MQ=255) tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACACGTCTGCTCGACACGCCGATCCTCACCCTTATGAACAAACTTGACCGTGAGATc > 2:362558/1‑228 (MQ=255) tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGAAAGTTACCCGTCTGCCGGACCCGCCGTTCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATc > 2:468743/1‑228 (MQ=255) tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGGAGATCGTACCCCTAAGCTGATGGAAGTTACCCGCCTGCGCGCCCCCCCGAGCCCCACCTTTTTGAACAAACTTCACCGGGAAATc > 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aTTGCCTGGTTAACCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGTCTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAt < 2:423108/227‑1 (MQ=255) gTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGGCCTTCTCGATGAAGTTggg > 2:148189/1‑226 (MQ=255) ttACCCTGTTCGACCCCTCGGGGCACGAAGACTTCTGGGAAGATCCCTATCGTGCCCGGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGGCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTgaga < 1:412222/228‑1 (MQ=255) cccTGCCCGACACCCGGGGGCAGGAAGACTTCGCGGAAGATACCAGCCTTACCGTGAGGGCGGTGGCAGGCTGCCTGATGGTTAGCGAGGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGGCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCTACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACg < 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1:241131/222‑1 (MQ=255) aTCGATGCCGCAAAGGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGGTGAGGGAAGTTCCCCGTCTGGGCGGCCCGGCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGAc < 1:148189/228‑1 (MQ=255) aTCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGAGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCAGCTGTGCGCCGAGCACCTGGCTGATTGGCTGCGGCAAGCGTGTTAAAGCCCTTTa > 2:137793/1‑212 (MQ=255) tggACCCCTCAAAAGGTGTTGAAGATCTTCCCCGTAAGCGGATGAAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACCTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACg < 2:225100/226‑1 (MQ=255) gcctcAAAAGGTGTTGAAGCTCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAAc < 2:599114/227‑1 (MQ=255) cgcAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCTGTTACACCCTTTTTAAAAACGAAAccat > 1:442262/1‑226 (MQ=255) aaaGGTTGTGAAGTTCTTCCCCGTAAGGTTATGGAGATTCCCCGTCGGGCCACCCCGCCGCTCCCCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGAGGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTAtctc < 1:357315/228‑1 (MQ=255) | AAAAGGCCGTGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTATCTC > NC_000913/4609552‑4609990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |