| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,472,791 | 0 | A | G | 17.6% | 179.3 / 5.6 | 86 | pseudogene (2275/3497 nt) | ydbA | pseudogene, autotransporter homolog, interrupted by IS2 and IS30 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/44); new base G (16/2); total (40/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.72e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGG‑CTATGTCGTCGGTACCAACGTTAACGGCAGCGCCGGGAAGCTGAAGGTTAACAATGCCAGCATGAACGGCGTGGAGATTAACACGGGC‑TTTACCGCTGGTACGGC‑AGACACCACTGTG‑AGTTTTGATAACG‑TAGTGGAAGGTAGCA‑ACCTGACCGACGCTGACGCCATCACCTCAACGTCC‑GTGGTATGGACTGCCAAAGGCAGCACCGATGCCAGCGGTAACGTTGACGTCACCATGAGCAAAAATGCCTACACCGATGTGGCAACAGATGCCTCGGTGAATGACATCGCGAAAGCACTGGATGCGG > NC_000913/1472555‑1473024 | gCAGGGCGACAGCATCAATGTTGAAGGTATGAACGGTAACAACGGTAATAGCAGCGAAGTGCATTATGGCGACTATACGTTGCCGGATGTGCCGAAGCCCAATACGGTTAGTGTAACGTCGGGAAGTGATGAGGCTGGTGGCAGCATGAACAACCTCAACGG‑CTATGTCGTCGGAACCAACGTTAACGGCAGCGCCGGGAAGCGCAAGGTTGACAATGCCGGCATGAACGGCGGGggga > 1:319305/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |