Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,158,652 | T→G | 12.1% | V55G (GTG→GGG) | oxyR → | oxidative and nitrosative stress transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,158,652 | 0 | T | G | 12.1% | 299.5 / 3.3 | 133 | V55G (GTG→GGG) | oxyR | oxidative and nitrosative stress transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/66); new base G (18/2); total (65/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
AATGCTTGATAGGGATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGG > NC_000913/4158414‑4158888 | aaTGCTTGATAGGGATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAgt > 1:858922/1‑239 (MQ=255) tGATAGGGATAATCGTTCA‑TGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTATCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATAACCTGGGCGGGAGGTTGCGGGGGCGGGCCAGCCGTAAAGGgttgtt > 1:284342/1‑238 (MQ=255) tAGGGATAATCGTTCATTGCTATTCTCCCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACTGGGGGGCATTGGCTGAACC‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCAc < 1:159514/239‑1 (MQ=255) aGGGATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTACCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGAGGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCGGAAAAGGGTTGTTGAcc > 1:381927/1‑239 (MQ=255) aTAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATGTTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACCCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGAGGGGCTGGGCGTGAGTTTGCTGGAGGGGACCAGCCGTAAAGGGGTGTTAACCCAgg > 2:58577/1‑239 (MQ=255) aTAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAgg > 1:705563/1‑239 (MQ=255) ttatgtttCTTTGTTTTTCTACTTACCGACATGAACTATGGTGGGGATGAAGGATGAAAAAGGAATATGCGTGATCTGGAGTACCTGGGGGCATGGGCTGAACC‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGc < 2:551544/233‑1 (MQ=255) tAATCTTTCATTGCTATCCTACCTATCGCCAGGAACTATCGTGGCGAGGGGGGTGGGATAATGAATATTGGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCGGAACC‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAgg < 1:768055/238‑1 (MQ=255) tCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGGGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGCGGCTTAGCGGGCCAATTCGTAAGCTGGAAGTTGAGCCGGCCGGGATGTTGCGGGGGCGGAGAAACGGAAAAGGGTGTGTCAACCAGGCggg > 2:456410/1‑239 (MQ=255) cATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGCAGATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGGAAAGGGTTGTTCACCCAGGGGGGaaggg > 2:638335/1‑236 (MQ=255) aTTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAAt > 1:329713/1‑236 (MQ=255) tGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGGGAGGTTGCGGGAGCGGCCCAGCCGGAAAGTTGTGTTCACCCAGCGGGGaagggggg > 2:616200/1‑233 (MQ=255) ttttCTACCTACCGCCATGATCTATGGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGGGGCATTGGCTGAACC‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCtgg < 1:148396/237‑1 (MQ=255) tCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACAAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCtggtgg > 1:766426/1‑239 (MQ=255) tcccTACCGCAAGGAACTATCGGGGGGATGGAGGATGGAAAATGAATATTCGTGACCTTGAGTCCTGGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGAt < 1:195444/237‑1 (MQ=255) agaaccgggCCAGGAACTTTCGGGGCGATGGAGGATGGATAAGGAATATTCGGGATCTGGATTACCTGGGGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGAt < 1:140255/231‑1 (MQ=255) ccTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGGGTGAGGTTGCTGGAGCGGACCACCCGTAAAGAGGTGTTCACCCAAGGGGGAAagcagggggggggaca > 2:12619/1‑226 (MQ=255) aTCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCC‑GCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGGAAGCTTGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGTCCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGTGAGTGCTGCCGGGGGacaaggag > 1:793584/1‑232 (MQ=255) cGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTAACCCAGGCGGGAATGCGGCTGGGGGATCAggggg > 2:746253/1‑236 (MQ=255) catgaacttgcgggcgcaggggggatggaaAAGGAATGTTCGGGATCTTGGGTCCCGGGTGGGTTTGGCTGAACC‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTa < 1:58577/217‑1 (MQ=255) tGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCGGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGCGGAcc > 1:46786/1‑239 (MQ=255) tGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATTGTGCTGGGGGAGCAgggggggaac > 2:259545/1‑231 (MQ=255) tGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTAcc > 1:615849/1‑239 (MQ=255) tCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTTGAAGAAGAGCTGGCAGTGATGTTGCTGGAGCGGCCCAGCCGGAAAGGGTGTGTGACCCAGGCGGGAATGCTGCGGGGGGAACaaggggggaaccgggggg > 2:779540/1‑222 (MQ=255) tCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGTTGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGGTCGGGCGCGTACCGggctgc > 1:361219/1‑239 (MQ=255) tGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTAACCCAGGCGGGAAGGGTCCTGGTGGAtacagggggaaccgggcggggtg > 2:391066/1‑217 (MQ=255) gCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATTAGGGGCGTACCGGGCTTCGGGAg > 1:790121/1‑239 (MQ=255) gCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAg > 1:535794/1‑239 (MQ=255) ggaggaTGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGGGGGAGGTGaa > 1:275385/1‑239 (MQ=255) gaggaTGGATAATGAATATTCGTGATCTGGAGTCCCTGGTGGCTTGGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGaa < 1:616200/238‑1 (MQ=255) gatggatAATGAATATTCGTTATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGGGAAAGt > 1:220206/1‑238 (MQ=255) atAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGGGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTAACCCAGGCGGGAATGGTGCGGGGGGATCAGGGCGGAACCGTGGTGGGGGAGGGGAAAGGCCTTaa > 2:901560/1‑239 (MQ=255) ttCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGGGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCa > 1:152154/1‑239 (MQ=255) ttCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTCCGTGAGGGGAAAGGCCTTAAAGAGATGGCa > 1:440499/1‑239 (MQ=255) tttgttttttgggtccTGGGGGCTGTGGGTGACCACCCGCCATTTTCGGGGGGCGGGAGATTCCTGCCACGTTAGCCCGCCGGCGGTTGGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCaa < 2:152154/225‑1 (MQ=255) aTCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGCTGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGGAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCCGGCGGATCCGGCGCGTACCGTGCTGCGGGGGGGGCAAGCCCTTAAAGAAAGGGCAAGCcag > 2:568330/1‑239 (MQ=255) aTCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGTAATGCTGCTGGGGGATAAGGCGCGTAACGTGCTGCGTGAGGGGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCca > 1:266035/1‑238 (MQ=255) aTCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGGCCGTACCGGGGTGCGGGGGGGGAAAGTCCTTAAAAGAATGGCAAGCca > 1:557171/1‑238 (MQ=255) aTCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGGGAAAGGCCTTAAAGGAAGGGCAAGCcag > 2:812468/1‑239 (MQ=255) ttgtGAGTCCCTGGGGGCATTGGTTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCcag < 1:397851/235‑1 (MQ=255) cTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGGGCGGTGAAAGTCTTTAAAGAGATGGCAAGCcacac > 1:276862/1‑236 (MQ=255) tGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGCTGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGCTCAGGCGCGTACGGTGTGGCGTGAGGGAAAAGGCGTTaaaagagggggagacccccggg > 2:174317/1‑220 (MQ=255) tggttgCATTGGCTGATCC‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCGAGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCGGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACg < 1:163429/239‑1 (MQ=255) tggtgcttttggttaacccccGCCTTTGCCGGCGTGCGGCCGTTTCCGGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGGGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACg < 2:46786/220‑1 (MQ=255) ggtggCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAAGCGCGGACCGTGCTGCGTGGGGTGAAAGGCCTTAAAGATGTGGCAAGCAAGCGGGGGGAGACgg > 2:775876/1‑238 (MQ=255) ggtggCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGGTCAGGCGGGGACCGTGCTGCGGGGGGGGAAAGGCCTTAAAGGGATGGGAACCCAACAggggggagaag > 2:557816/1‑231 (MQ=255) ttGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCAAGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGACTGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGGACCGTGCTGCGTGAGGGGGAAGGCCTTAAAGGGGAGGCAGGCCAGCAGGGCGAGACGAGGTCCg > 1:224688/1‑238 (MQ=255) tGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGGGGATCAGGCGCGTACCGGGCTGCGTGAGGGGAAAGGCCTTAAAGAGAGGGCAAACCAGCGGGGCGAGAGGATggcggg > 2:469636/1‑233 (MQ=255) ggcgaacccccGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGAc < 1:253311/230‑1 (MQ=255) ggacca‑cCGCCATTTTCGGCGTGCGGTAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCg < 1:859154/234‑1 (MQ=255) gAACC‑CCGCCATTTTCGGCGGGCGGCCGATTCCTGCCAAGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCt < 1:557816/239‑1 (MQ=255) cGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAAATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGCCGATTTCCGGACCGCTggccat > 1:189684/1‑234 (MQ=255) tttttCGGGGGGCGGAAGTTTCCTGCCCCGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGAAAATTCGTAAGCTGGAAGATGGGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGt < 1:203012/238‑1 (MQ=255) gtgggggatgttccgtccgtgTTACCCCGCCGGCGGTTGGGGGGAAAATTCGTAAGCTGGAAGGTGAGGTGGGGGTGATGTTGCTGGGGGGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTcc < 2:280999/218‑1 (MQ=255) gggtggCAGATGCCGGGCACGTTAGCCGGGGGAGGATTGGGGGGAAAATGCGAAGGGTGGAGAATGAGCTGGGCGGGAGGGGGGGGGAGCGGACAAGCCGGAAAGTGTGGTGCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTcc < 2:615849/234‑1 (MQ=255) gTGGGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGTTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGAGGGGCTGGGCGTGAGTTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTcc < 1:456410/238‑1 (MQ=255) gTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTccc > 1:742780/1‑239 (MQ=255) gTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTcc < 1:746253/238‑1 (MQ=255) gTGCGGCAGATTCCGGGCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTcc < 1:840711/238‑1 (MQ=255) cGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGtgtt > 1:91267/1‑106 (MQ=255) gctgtttCCTGCCACTTTGGCCGGCGGATGTTTGGCGGGCAAATTCGGAGGCTGGAAGATGAGCTGGGGGGGATGTTGATGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGt < 2:220206/234‑1 (MQ=255) cAGTTTCCTCCCACGTTATCCAGCCGACTCTTAGCGGGAAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGGGATTTGGCGGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTTGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGt < 2:597619/238‑1 (MQ=255) ttccctcccatgtggcccggccGACGCTTGGGGGGCAAATGAGTAAGCGGGAAGATGAGCGGGGGGTGGTGTTGCGGGGGGGGCCCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTgg < 2:402156/219‑1 (MQ=255) ttCCTGGCACGTTAGCCGGCCGGCGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGGTATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGa < 1:174317/238‑1 (MQ=255) ttCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGa < 1:827756/238‑1 (MQ=255) tcccgccccagTTGGCCAGCGGGCGGTTGGGGGGAAAATTCGTAAGCTGGAAGATGGGCGGGGCGTGGTGGTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGa < 2:707739/228‑1 (MQ=255) ccACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGACTGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGTGGGGGAAGTCCTTAAAGAGAAGGGAACCCGGCAGGGGGAGACGCTGTCCGGAGCCCGGAACCATGGCTTGTATTCCACAGTTTGACCgagcc > 2:796434/1‑235 (MQ=255) cACGTTAGCCAGCCGCCGTTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGGTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTAcc < 1:638335/238‑1 (MQ=255) ccGTTTGCCAGCCGGCGTTTGGCGGGAAAATTCGTAAGGTGGAAGGTGGGCGGGGGGTGATGGTGCTGGGGCGGGCCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTg < 2:858922/238‑1 (MQ=255) cGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGGCCGGCCCGCCGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGGACCGGc > 2:365373/1‑239 (MQ=255) ggccgcccggggtttaggggcaaaaTTGGAAAGCGGGAAGAGGGGGTGTGGGGGTGGTCGCGGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTAcc < 2:788031/217‑1 (MQ=255) gccggcgggcgtttAGGGGGCAAATTCGTAAGCGGGAAGATGGGCTGGGCGTGAGGTTGCTGGAGGGGCCCAGCCGTAAAGTGTTGGTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 2:807255/227‑1 (MQ=255) gccaggccgctgtttgggggCAAATTCGTAAGGGGAAAAGTGAGGGGGGCGGGATGGTGTGGGGGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAGGAGATGGAAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 2:404610/222‑1 (MQ=255) ccctgccGGCGGTTGGGGGGCAATTGCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGAGGTTGCTGGGGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCg < 2:183459/235‑1 (MQ=255) cgggcggttggggggAAAATTCGTACGCTGGAGGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGGGGACCAGGCGTAAAGTGTTGGTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGGTTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCatat < 2:557171/227‑1 (MQ=255) cGAGGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCatat < 1:775876/238‑1 (MQ=255) gtttAGCGGGGAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATcc < 1:320235/237‑1 (MQ=255) gCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCatat < 1:729808/234‑1 (MQ=255) cTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGGGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCAACATGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGAAACCGCTACGGCCTCTTATc > 1:218935/1‑237 (MQ=255) gaggtgaaaTTCGAAAGTGGGAAGATGCGTTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAACGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTAtg < 1:812996/233‑1 (MQ=255) gggCAATTGTGTAAGCTGGAATGTTGGCTGGGTGGGATGTTGCGGGGGCGGACCGGCCGTAAAGGTTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCGGGTGGAACAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAATCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTAtgc < 2:266035/238‑1 (MQ=255) ggcgaaaTGCGTAAGCTGGAAGATGAGCGTGGCTTGATGTTCCTGGAGCTGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTAtgc < 1:546431/234‑1 (MQ=255) ggAAGATGAGCGGGGGGTGTGGTTGCTGGAGCGGGCCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCaa < 1:391066/239‑1 (MQ=255) tttataagggacgggtttttGCGGGGGCGGCCCGGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCt < 2:249596/221‑1 (MQ=255) aGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCCGGGCGAGACGATGTCCGGACACCTGCACATTGGTTTGGTTCCCACATTTGGACCGGACCTGCTACCCCCAATTATCCCCTTTTTGCCCCAACCCTTTCCACACCTGGaa > 2:712198/1‑239 (MQ=255) cGTGTTGTTGCTGGGGCGGCCCGGCCTGAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTAt < 2:157103/238‑1 (MQ=255) cGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGGGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCAATTTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAACGCTGCAAATGTa > 1:820457/1‑237 (MQ=255) gATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGGCCCGTGCTGCGTGAGGGGAAAGTCCTTAAAGCGATGGCAATCCAACAGGGCGAGACGATGTCCGGGCCGCTTCACATTGGTTTGATTCCCACCGTTGGACCGTACCTGCTACCGCACATTATCCCTATGCTCACCCCAACCTTTCCCAGACGGGAACTGTAACTGc > 2:143772/1‑239 (MQ=255) gTTGCTGGATCGGACCAGTCGTAAATTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGGTCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGGGACGATGTCCGGACCGGTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATg < 1:779540/239‑1 (MQ=255) gggggggtccAGGCGTAAAGTGGTGTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGcac < 2:275385/231‑1 (MQ=255) aGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATcctgtctcttttaca > 1:249596/1‑225 (MQ=255) cGGCCCAGCCTTAAGGTGTTTTTCCCCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGGGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGAc < 2:742780/239‑1 (MQ=255) ggccAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGAcc < 1:498337/236‑1 (MQ=255) ccctgCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGGGGGAATTGTGCTGGTGGATCAGGCGGTTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCCGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATGCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACcca < 2:753333/235‑1 (MQ=255) ccAGGCGTAAAGTGTTGGTCCCCCAGGGGGGAATGCTGATGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTTGGTGGGGTGAAAGGCCTTAAAGATATGGGAAGCCAGCAGGGCGGTGCGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACcca < 2:224688/238‑1 (MQ=255) cAGCCGTAAAGGGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACccacc < 1:712198/239‑1 (MQ=255) aaGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGGGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGAGGGCCGGACCGCTGCCCATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCAACCGCCTATTATCCCTATGCCGCACCAGACCCTTCCAAAACTGGAAAAGAGAATGCATTAAAAACAGACCAACCAATTACTg > 2:123228/1‑239 (MQ=255) aGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGGTGCGGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGGTAGGTGAAAGGCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCAAATTGGTTTGCTTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTgg < 1:435786/239‑1 (MQ=255) aGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTgg < 1:47188/239‑1 (MQ=255) aGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCGGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTgg < 1:796434/239‑1 (MQ=255) | AATGCTTGATAGGGATAATCGTTCATTGCTATTCTACCTATCGCCATGAACTATCGTGGCGATGGAGGATGGATAATGAATATTCGTGATCTTGAGTACCTGGTGGCATTGGCTGAACA‑CCGCCATTTTCGGCGTGCGGCAGATTCCTGCCACGTTAGCCAGCCGACGCTTAGCGGGCAAATTCGTAAGCTGGAAGATGAGCTGGGCGTGATGTTGCTGGAGCGGACCAGCCGTAAAGTGTTGTTCACCCAGGCGGGAATGCTGCTGGTGGATCAGGCGCGTACCGTGCTGCGTGAGGTGAAAGTCCTTAAAGAGATGGCAAGCCAGCAGGGCGAGACGATGTCCGGACCGCTGCACATTGGTTTGATTCCCACAGTTGGACCGTACCTGCTACCGCATATTATCCCTATGCTGCACCAGACCTTTCCAAAGCTGGAAATGTATCTGCATGAAGCACAGACCCACCAGTTACTGG > NC_000913/4158414‑4158888 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |