| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,184,542 | C→A | 100% | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,184,542 | 0 | C | A | 100.0% | 355.4 / ‑6.7 | 105 | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base A (57/45); total (58/47) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ACACGAGTTCGAGAAGAAACTCGAAGCGAAACGCCGCAAAATCACCCAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTATGCGTCTGGCTGAAAACCTGCGCAA > NC_000913/4184309‑4184776 | acccGAGTTCGAAAAGAAACTCGAAGGGAAACGCCGCAAAATCCCCCAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTgg < 1:487447/236‑1 (MQ=255) gggTTCGAGAAGAAACTCGAAGGGAAACGCCTCAAAATCACCCAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGt < 1:306883/237‑1 (MQ=255) gattCGAGAAGAAACTCGAAGCGAAACGCCGCAAAATCCCCCAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTa < 1:875181/237‑1 (MQ=255) gaagaaACTCGAAGCGAAACGCCGCAAAATCCCCCAGGGCGACGAGCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATAGCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTAACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGACCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGtct < 2:348914/238‑1 (MQ=255) accTCGAAGCGAAACCTCGCAAAATCACCCAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGAGCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTAt < 2:107497/236‑1 (MQ=255) aaCCCGAAGCGAAACGCCGCAAAATCCCCCAGGGCGACGATCTGGCCCCGGGCGTGTTGAAGATTTTTAAGGTATATCTGTCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTa < 2:784113/237‑1 (MQ=255) cGAAGCCAAACGCTGGAAAATCGCCCTGGGCGACGATCTGGAGCCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGACTGGTGACAAGGTGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACa < 1:735366/239‑1 (MQ=255) gAAGCGAAACGCCGCAAAATCACCCAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAGGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGTTAGACATCGAACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGGATGAACa > 1:551728/1‑238 (MQ=255) attcccccAGGGCGGCGATCTGACACCGGGCGTGCTGAAGATTTTTAAAGTATACCTGGCGGTGAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 2:134651/234‑1 (MQ=255) aaTCACCCAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCGGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 1:759405/239‑1 (MQ=255) aCCCAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGAATTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTCTGAACATCGGTCAGATCACCGAAA‑ccc > 1:397440/1‑238 (MQ=255) cccAGGGGTGCGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCAc < 2:224006/239‑1 (MQ=255) cccAGGGGGACGATCTGGCACCGGGTGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGGATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCAc < 1:793902/239‑1 (MQ=255) cccAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGCTGAAAACGGTCCGCCGGTAGAAATCGGACTGAACCAGCGGGGCGTCCCGGCTCGTATGAACATCGGCCAGACCCTCGACA‑CCCa > 1:558024/1‑238 (MQ=255) cAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCt < 1:14211/239‑1 (MQ=255) ggCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGGCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTggg > 1:224006/1‑239 (MQ=255) ggCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGGGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGGGTAATTTCTAAGATCAACACGATCGCAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTCCCGCCTCCTAGGAACATCGGCCAAACCCCCGAAA‑CCCACCTggg > 2:559196/1‑239 (MQ=255) tGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTAGCCCGGTAGCCATCGTACTGAACCAACTGGGCGGATCGTCCCGGATGAAAATCGGCCAAATCCCCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGcggga > 2:195269/1‑235 (MQ=255) gCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGCATGGCTGCGaa > 1:158646/1‑239 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTCGACATCGTACTGAACCAGCTTGGCGTACCGTCTCGGATGAACATCGGGCAGATCCTCTGAG‑CCCCCCTGGGGATGGCTCCgcagaggat > 1:685812/1‑231 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAGCCAGCTGGGCGTACCGTCTCCTATGAACAACGGTCAGATCCCCGAAA‑CCCACCTGGGGAAGGccggacaagggaa > 2:158958/1‑227 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTa > 1:168484/1‑238 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTAt > 1:575369/1‑239 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGGAt > 1:4325/1‑239 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTCCGAAAggaaa > 1:194164/1‑236 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGGCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGGATGGCTGCGAAAggga > 1:317676/1‑236 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGCCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTa > 1:775615/1‑238 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACAAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCCCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGGGCAAggga > 1:732648/1‑236 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGCGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTCCGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGACCTGAACCAGCTGGGCGCACCGTCCCCTAGGACCATCGGTCAAATCCCCCAAA‑CCCACCCGGGTCTGGACGCGAAAGGTAt > 2:655004/1‑239 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGATCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCTAATGAACATCGGTCAGATACCCCAAA‑CCCACCTGGGGAAGGTTGGGGAAggaaa > 2:369727/1‑236 (MQ=255) ggCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGAAAAGATGGCCGGTCGTCACGGTAACACGGGGGGAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGCAGACATCGCACGGAACCAGCTGGGGATACCGCCTCGTATGAAAACCGGTCAAACCCCCCAAC‑ACCCCCCGGGTTTGGCTCCGaaacagga > 2:786999/1‑234 (MQ=255) gTGCTGAAGATTGGTAAGGTAAATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCg < 1:358736/238‑1 (MQ=255) tGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGGATCGGc > 1:617982/1‑239 (MQ=255) tGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTATCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGAc < 1:195269/239‑1 (MQ=255) tatCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGGATCGGCGACAAGATCAACGCCAt > 1:162700/1‑236 (MQ=255) tCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAAAATCGGGCAGATCCTCGAAA‑CCCCCCTGGGGATGGCTGCGAAAGGAATCGGGGCAAAAAACAACGCCAAGCTGa > 2:524657/1‑239 (MQ=255) cGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGAATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAca > 1:203166/1‑238 (MQ=255) cGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCAAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCCGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGGGAAAGGTATAGGCGACAAGAGCCACGCCATGCTGAAAaag > 2:172036/1‑239 (MQ=255) ggTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGGATCGGCGACAAGATCAACGCCCTGCTGCAAcaca > 1:170715/1‑237 (MQ=255) ggTTAAACGCCGTATCCAGCCTGATGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACACGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGCTCGAAGAGATGCCTTACGATGAAAAAGGTACGCCGGTAGACATCGGACTGAAACAGCTGAGCGAAACGTCTCGTATGGACATCGGTCAGATCATCGAAA‑GCCACCCGGGCCTGGCGCCGAAAGGTATCAGCAACAAGAtaccaccaacacggaaaacac > 2:21284/1‑219 (MQ=255) ggTTAAACGCCGTACCCGGCCTGGTGAAAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcag < 2:701480/238‑1 (MQ=255) gCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGa > 1:878547/1‑152 (MQ=255) gCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGa < 2:878547/152‑1 (MQ=255) ccTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGCAA‑CCCCCCTGGGAATGCATGGGAAAGGGAGCGCCGACAAGAACAACGCCCAGCTGAAACAACAGAAAAAAGACGGGaaaat > 2:792559/1‑237 (MQ=255) gggtaCAAGGTGGCAAGTCTACACGGTAACCAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGAACGAAGATATGCCTGACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACAGCGGTCAGATCCGCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTgcg < 1:238577/235‑1 (MQ=255) ggTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAACAGGATCGGCGGCAAGATCAACGCCCTGCGTAAACAGCAGCAAGAAGTGCCGAAAcgcg > 1:439445/1‑235 (MQ=255) tGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGAATCGGCGGCAAGGTCAACGCCATCCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCCGGAAACTgccgg > 1:19095/1‑236 (MQ=255) gACAAGATTGCAGGTCGTCCCGGTAACAAGGGTGGAATTTCTAAGATCAACCCTATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGcgcg < 1:463490/238‑1 (MQ=255) aaaaGAGGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTTTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGaa < 2:600006/237‑1 (MQ=255) ggCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa > 1:556853/1‑146 (MQ=255) ggCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 2:556853/146‑1 (MQ=255) ggCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCCCGAAACTGCGCGAATTCATcc > 1:657449/1‑239 (MQ=255) gtcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCCCGTATGACAACCGGTCAGATCCGCGAAA‑CCCACCTGGGTACGGCTCCGGAAGGGATCGGCGACAAGCTCAACACCAAGCTGAACCAGCAGCCAGCAGTCGCGAAACTGGCCAAATTAAACCAgaggcag > 2:5936/1‑233 (MQ=255) gttaCAAGGGTTGAATTTTTAAGATCAACCCGGTCGAAGATATGGCTTACGGTGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGGACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAt < 2:194164/236‑1 (MQ=255) tAACAAGGGTTTAATTTCTAAGGTCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAt < 1:369727/238‑1 (MQ=255) tAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACACCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGGATCGGCGCCAAAGTCAACGCCATGCTCAACAAGCACCAAGAAGGCGCGAAACTGCCCCAATTAATCC‑CCGTGCGGTACGAT‑c > 2:822264/1‑239 (MQ=255) aaaaaGGGGTTAATTTTCAAGGCCAAACCGAACGAAAAAATGCCTTACGATGAAAACGGTACGGCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGGATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑Ct < 2:792932/236‑1 (MQ=255) gtAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGGATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAATCGCGAAACTGCCCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAC‑CTGGGCGCTg > 1:19390/1‑238 (MQ=255) gtAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGCATTGGCGACCAAAGCAACGCCATGCTGAAACACCAACAAAAAGTCCCGAAAATGCGCGACTTCATCCAccgggc‑gacaggactaggcccgga > 2:579051/1‑222 (MQ=255) tttCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGCCAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGt > 1:905607/1‑238 (MQ=255) cTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACCAGATCAACCCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCCCGAACCTGCGGGAATTCATCCACCGGGC‑GTACGCA‑CTGGGCGCTGACGTTCGt > 2:1287/1‑239 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCa < 1:196703/161‑1 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTCCGAT‑CTGGGGGCAGACGTCCgcc > 1:694675/1‑237 (MQ=255) tAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATAAACGCCa > 2:196703/1‑161 (MQ=255) aaCCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGGTCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGCCCCGGAACTGGCGGAATTCATCCACCGTGG‑CGACGAA‑CTGGGGGCGGCAGTTCGTCGAA‑AAGt > 2:611684/1‑239 (MQ=255) ccccccgtgAAAATATGCCTTACGATGAAACCGGTACGCCGGTAGGCATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCGCGTATGAACATCGGTAAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGtt < 2:483761/231‑1 (MQ=255) aCCCGATCGAAGAAATGCCTTACGATGAAAACGGGACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGGAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGtt < 1:786999/239‑1 (MQ=255) cccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTg < 1:1287/239‑1 (MQ=255) cccatgcaaGATATGCCTTTCGATGAAAACGGGTCGCCGGTAGGCATCGGACTGAACCAGCTGGGGGGACCGTCTCGTATGAACAACGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGa < 2:657242/232‑1 (MQ=255) gATCCAAAATATGCCTTAGGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACAGCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGGCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGAcc < 2:657449/239‑1 (MQ=255) aaTCGAAAATTGGCTTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACAACGGACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATTGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGAcc < 2:203166/238‑1 (MQ=255) tCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAC‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGAccgg > 1:642853/1‑237 (MQ=255) tCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCAGGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCAAAACTGCGGGAATTCACCCAGCGGGC‑G‑ACCATCCTGGCGGCGGACCGTCGCCAAA‑AAGTTGACCTg > 2:423870/1‑239 (MQ=255) tCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGGATCGGCGACAAGATCAACGCCAAGCTGAAACCGCAGCAAGAAGTCCCGAAACTTCGCGCATTCACCCCGCCGCC‑GTACAAC‑CTGGGGGCTGCCGTCCggccaaaaaatgaactg > 2:287172/1‑223 (MQ=255) tCGAAGATAGGCCTTAGGGTGAAACCGGTACGCCGGTAGACATCGTACGGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTg < 1:172036/239‑1 (MQ=255) gCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGACTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTCAGTACCtt > 1:402700/1‑238 (MQ=255) gCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACCAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCACCGTGC‑GTCCGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTTACCTGAGTACCTTc > 1:869523/1‑238 (MQ=255) ttccGATGAAAACGGTTCGCCGGTAGGCATCGTACAGAACCAACTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCg < 1:822264/236‑1 (MQ=255) tACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGa > 1:202459/1‑214 (MQ=255) tACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGa < 2:202459/214‑1 (MQ=255) tACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGa < 1:287172/239‑1 (MQ=255) tACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGa > 1:54347/1‑239 (MQ=255) cGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATg < 1:684899/239‑1 (MQ=255) cGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATg < 2:168484/239‑1 (MQ=255) ataaaaGGGTACGCCGTTCAACTCCGTACTGAACCAGCTGGGGGTACTGTCGCGTTAGAACACCGGTCAGATCCTCGAAA‑ACCACCTGGGTATGGCGTCGAAAGGTAACGGCGACAAGATCAACGCCATGGTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACATCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGGT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATgaag < 2:486375/237‑1 (MQ=255) aaaCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCCCGAATTCATCCCTCGGGC‑GTACGAC‑CTGGGGGCTGGCGTTCGT‑AGACAAATTGACCGCAGAACCTTCAGCGATGaagaag > 2:861394/1‑239 (MQ=255) tACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTAACTTCAGCGATGaagaaggtttgg > 1:435263/1‑233 (MQ=255) aCGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCCGAAACAGCCGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCCTCCACTGTGC‑GCACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCTACACA‑AAGTTGACCCGAGTACCCTccgtgggaaaaaagtaatagg > 2:272629/1‑219 (MQ=255) aCGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGAATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTCCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAC‑CTGGGCGCGGACGTTCGTCGGA‑AAGTTGACCTGGGTCCCTTCAGGGAGGAAAAAGTTATggg > 2:887758/1‑237 (MQ=255) cgtgtgagttCGTACTGGACCCGCTGGGGGTAGCGGCTCGGATGAACAGAGGTCAGACCCTCGAAA‑CCCACGTGGGTATGGGTGCGAAAGGTGTCGGCGACAAGATCAACGCCATGCGGAAACAGGAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAG‑CTGGGCACTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTATGCGTCt < 2:10179/229‑1 (MQ=255) caacGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGGCTCGGATGAACATCGGTCAGATCATCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTATGCGTCTGGCTGaaa < 1:861394/236‑1 (MQ=255) tCGTACTGAACCAGGTGGGCGTGCCGTCTCGTTTGAACACTGGTCAGGTCCCCGAAA‑CCCACCTGGGTAGGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTATGCGTCTGGCTGAAAAc < 2:317676/239‑1 (MQ=255) tCGTACTGAACCAACTGGGCGGACCGTCTCGTATGAACATCTGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCGGGGTAGGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTATGCGTCTGGCTGAAAAc < 1:465055/239‑1 (MQ=255) tCGTAATGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTATGCGTCTGGCTGAAAAc < 1:655004/239‑1 (MQ=255) tCGGACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTAAGGACATCGGTAAGCTCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCCACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTATGCGTCTGGCTGAAAAc < 1:408933/239‑1 (MQ=255) cGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGCAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGTTATCGGCGACAAGCTCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGCAGTCGCGCACCTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCTGCAGA‑AAGGTGACCGAAGAACCCTCCGCCAGGGCAAAGTTATGCGTCAGGACGaaaaaa > 2:642060/1‑237 (MQ=255) cGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGGGTACCTTAAGCGATGAAGAAGTTATGCGTTTGGCTGaaaa > 1:269161/1‑237 (MQ=255) cGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGGACCTTCAGCGGTGAAAAAGTTATGCGTCTGGCTGcaaa > 1:366133/1‑237 (MQ=255) tACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGGATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTATCGGTCTGGCTGAAAACCt > 1:883990/1‑238 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTTTGCGTCTGGCTGAAAACCTGCGCaa > 1:544143/1‑239 (MQ=255) | ACACGAGTTCGAGAAGAAACTCGAAGCGAAACGCCGCAAAATCACCCAGGGCGACGATCTGGCACCGGGCGTGCTGAAGATTGTTAAGGTATATCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAA‑CCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAGCGTGC‑GTACGAT‑CTGGGCGCTGACGTTCGTCAGA‑AAGTTGACCTGAGTACCTTCAGCGATGAAGAAGTTATGCGTCTGGCTGAAAACCTGCGCAA > NC_000913/4184309‑4184776 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |