New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 4185313 | 133 (1.600) | intergenic (+41/‑36) | rpoB/rpoC | RNA polymerase, beta subunit/RNA polymerase, beta prime subunit |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCACCGTTAAGTCTGATGACGTGAACGGTCGTACCAAGATGTATAAAAACATCGTGGACGGCAACCATCAGATGGAGCCGGGCATGCCAGAATCCTTCAACGTATTGTTGAAAGAGATTCGTTCGCTGGGTATCAACATCGAACTGGAAGACGAGTAATTCTCGCTCAAACAGGTCACTGCTGTCGGGTTAAAACCCGGCAGCGGATTGTGCTAACTCCGACGGGAGCAAATCCGTGAAAGATTTATTAAAGTTTCTGAAAGCGCAGACTAAAACCGAAGAGTTTGATGCGATCAAAATTGCTCTGGCTTCGCCAGACATGATCCGTTCATGGTCTTTCGGTGAAGTTAAAAAGCCGGAAACCATCAACTACCGTACGTTCAAACCAGAACGTGACGGCCTTTTCTGCGCCCGTATCTTTGGGCCGGTAAAAGATTACGAGTGCCTGTGCGGTAAGTACAAGCGCCTGAA > NC_000913/4185018‑4185584 | cTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCACCGTTAAGTCTGATGACGTGAACGGTCGTACCAAGATGTATAAAAACATCGTGGACGGCAACCATCAGATGGAGCCGGGCATGCCAGAATCCTTCAACGTATTGTTGAAAGAGATTCGTTCGCTGGGTATCAACATCGAACTGGAAGACGAGTAATTCTCGCTCAAACAGGTCACTGCTGTCGGGTTaa > 2:418577/1‑289 (MQ=255) 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cGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCACCGTTAAGTCTGATGACGTGAACGGTCGTACCAAGATGTATAAAAACATCGTGGACGGCAACCATCAGATGGAGCCGGGCATGCCAGAATCCTTCAACGTATTGTTGAAAGAGATTCGTTCGCTGGGTATCAACATCGAACTGGAAGACGAGTAATTCTCGCTCAAACAGGTCACTGCTGTCGGGTTAAAACCCGGCAGCGGATTGTGc < 1:308572/289‑1 (MQ=255) aGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCACCGTTAAGTCTGATGACGTGAACGGTCGTACCACGATGTATAAAAACATCGTGGACGGCAACCATCAGATGGAGCCGGGCATGCGAGAATCCTTCAACGTACTGTTGAAAGAGATTCGTTCGCTGGGTATCAACATCGAACTGGAAGCCGAGTAATTCTCGCTCAAACAGGTCACTGCTGTCGGGTTAAACCACGGCAGCGGATGGTGCTAACTCCg > 1:432500/1‑289 (MQ=255) aGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCACCGTTAAGTCTGATGACGTGAACGGTCGTACCAAGATGTATAAAAACATCGTGGACGGCAACCATCAGATGGAGCCGGGCATGCCAGAATCCTTCAACGTATTGTTGAAAGAGATTCGTTCGCTGGGTATCAACATCGAACTGGAAGACGAGTAATTCTCGCTCAAACAGGTCACTGCTGTCGGGTTAAAACCCgg > 1:14216/1‑268 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
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read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |