| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,616,373 | T→A | 4.2% | F94L (TTT→TTA) | bepA → | OM protein maintenance and assembly metalloprotease and chaperone, periplasmic |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,616,373 | 0 | T | A | 4.2% | 348.5 / 3.8 | 95 | F94L (TTT→TTA) | bepA | OM protein maintenance and assembly metalloprotease and chaperone, periplasmic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/40); new base A (2/2); total (52/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
AGGTTATGTTCAGGCAGTTGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCTGACCGGTACACTGGCGGGAAC > NC_000913/2616087‑2616657 | agGTTATGTTCAGGCAGTTGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCa > 2:87205/1‑289 (MQ=255)agGTTATGTTCAGGCAGTTGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTACa > 1:144759/1‑289 (MQ=255) aTGTTCAGGCAGTTGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATTCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGCACCCGTTTCAttttt > 1:65535/1‑289 (MQ=255) aTGTTCAGGCAGTTGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGCCACCGTTTCAttttt > 1:200955/1‑289 (MQ=255) gCAGTTGAAAAAGAACCGGGTTGCAACCCTCATGGCTGCTATGCCCATTGGTCAGGTAGCACCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGAt < 1:136798/288‑1 (MQ=255) aaaaaaCCTGGTTGCAACCAGTATGGCTGCTATGACCATGGGTCAGGTAGCCCCGGCGTGGGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTATCCATTGGACAGGAAATGCAGATGAGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAacgac < 1:564159/289‑1 (MQ=255) tGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTaa < 2:610039/289‑1 (MQ=255) tGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTaa < 2:593294/289‑1 (MQ=255) aCCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGGTTCATTTTTTTCTGATCATCAACGACGAAATTAACGCCtttt > 1:624485/1‑288 (MQ=255) tCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGcttt > 2:715049/1‑289 (MQ=255) cATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCCTGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTTTGATCACCCACGACGAAATTAACGCCTTTGctttt > 1:721867/1‑288 (MQ=255) tgctATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTggc > 2:161556/1‑289 (MQ=255) aTGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCa > 2:520451/1‑289 (MQ=255) ccATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACg < 2:254070/288‑1 (MQ=255) ccATGGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACg < 2:363500/288‑1 (MQ=255) cATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACgtg < 2:65535/289‑1 (MQ=255) tGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACgtggt > 1:570461/1‑288 (MQ=255) tCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGtgct < 1:131545/288‑1 (MQ=255) aGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCa < 2:396273/289‑1 (MQ=255) gTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCACTATCTTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTCCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCAc > 1:557132/1‑288 (MQ=255) tAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCAct < 2:718407/288‑1 (MQ=255) tAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTACATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCAct < 2:144759/288‑1 (MQ=255) cccGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACg > 2:491880/1‑272 (MQ=255) cccGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACg < 1:491880/272‑1 (MQ=255) cccGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGcc < 1:161556/289‑1 (MQ=255) ttGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTc > 2:227374/1‑289 (MQ=255) tatGGGAACCTACGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGc < 2:12611/288‑1 (MQ=255) cGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGgc > 1:303846/1‑288 (MQ=255) gCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACgtg > 2:223084/1‑218 (MQ=255) gCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACgtg < 1:223084/218‑1 (MQ=255) aCGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAAtc > 1:94793/1‑288 (MQ=255) ttCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCAc > 2:703958/1‑289 (MQ=255) aTTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTc > 2:189054/1‑288 (MQ=255) aTTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCa < 1:520451/289‑1 (MQ=255) aGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACg > 1:561570/1‑289 (MQ=255) gCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTg > 1:498413/1‑289 (MQ=255) gCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTg > 1:318321/1‑289 (MQ=255) gCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCTCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCgcgag < 2:721867/288‑1 (MQ=255) aCTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCACCGTCACCCAACGTCACCTGGCTCGAGCGAt > 1:460815/1‑289 (MQ=255) cTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGAt < 2:15820/288‑1 (MQ=255) tGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGAt < 1:703958/289‑1 (MQ=255) ccGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGc > 1:389717/1‑222 (MQ=255) ccGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGc < 2:389717/222‑1 (MQ=255) gCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCa > 2:289059/1‑248 (MQ=255) gCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCa < 1:289059/248‑1 (MQ=255) aCGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACg < 2:496922/161‑1 (MQ=255) aCGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACg > 1:496922/1‑161 (MQ=255) aGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGTGGATGCTTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGcgccg < 2:174653/288‑1 (MQ=255) aGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGcgccg < 2:561570/288‑1 (MQ=255) aGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGcgccg < 2:37578/288‑1 (MQ=255) cgcgcCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAAc < 2:568590/242‑1 (MQ=255) cgcgcCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAAc > 1:568590/1‑242 (MQ=255) cgcgcCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTg > 2:728133/1‑289 (MQ=255) gcgcCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGcgccgc < 2:570461/286‑1 (MQ=255) gACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGt < 1:728133/289‑1 (MQ=255) aCCCGCTTTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGtt < 2:300236/289‑1 (MQ=255) aCCCGCTGTTAACGTATGATATCAATTCGGTGGGGGTGCGGCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGAGCCCGTTTCCTTTTTTTCTGATCAACATCGCCGAACTTATCGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGtt < 2:362328/289‑1 (MQ=255) cGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCCGCAGCGCAGCGCGCACCTGCCCTGGGTCGGCGCGTTAgg > 1:11370/1‑289 (MQ=255) cGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAgcgcg > 1:722554/1‑263 (MQ=255) cGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAgcgcg < 2:722554/263‑1 (MQ=255) cGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAgg < 2:498413/289‑1 (MQ=255) aaTATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTCTTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGGTAGGTTCTAgttt > 2:517620/1‑286 (MQ=255) aaTATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTAAACTGGCTTCAGGTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTAACCTGGCGAGCGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCCCGCCGCTGACCGGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTAtttt > 1:515308/1‑286 (MQ=255) atatatTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATTGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCGGCCCTGGGTCGGCGCGTTAGGCTCTAtttt > 1:759933/1‑285 (MQ=255) tatTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCg < 2:94793/289‑1 (MQ=255) cGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTCTTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCCGCAGCGCCACGGGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTCGGTCTTAGTTTACTGGCTATGcccgg > 1:607181/1‑287 (MQ=255) cGCTGGGGATGCGGCTGGCTTCGCACACCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAAGTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGTGGCAACGAGGTGCTGCACTCTCCCCTTTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCATTTATGTCGCACGCAATCCCCCACCTCCACCTACGTCCACTGGCGCGACCGATTGAAGACCCGCAGCGCACCCCCCCGCTGCCCTGAGTCGGCCCGGTAGGTTCCATTGCACTGGCGGTgactcg > 1:569377/1‑284 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCt < 1:185148/85‑1 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCt > 2:185148/1‑85 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGCGCGATGGAAGATCAGCCGCCCAGCGGGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTCGGTTTTACTTTACTTGAGATGGCCAGt > 1:564334/1‑288 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCTATGGCCAGt > 1:752683/1‑288 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGt > 2:216102/1‑288 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGt > 1:251542/1‑288 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGt > 2:641430/1‑288 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGt > 1:676145/1‑288 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCAAGt > 1:17178/1‑288 (MQ=255) cTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTACATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGt > 2:129819/1‑288 (MQ=255) ggggATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCg < 2:752683/289‑1 (MQ=255) ggggATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTACATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCg < 1:129819/289‑1 (MQ=255) tttCGAATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATgg < 1:216102/288‑1 (MQ=255) cGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCGGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATAAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGTGATgggcgc > 2:577736/1‑285 (MQ=255) cGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAATTCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGTCCGTCCGCAGGCGGTGTTggcggc > 1:545443/1‑289 (MQ=255) aTGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCt < 2:460815/289‑1 (MQ=255) aaTTCGGTTAAGACACCGTTGCATGTTTTTCTGCTCACCAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGAGGCAACGGGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCTGACCg < 1:87205/289‑1 (MQ=255) tgTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCTGACCGGTaca < 2:624485/288‑1 (MQ=255) ggTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCTGACCGGTaca < 1:189054/289‑1 (MQ=255) acacCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGtt > 1:696136/1‑221 (MQ=255) acacCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGtt < 2:696136/221‑1 (MQ=255) acCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCTGACCGGTACACTGGCGGGa < 2:200955/289‑1 (MQ=255) cGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAACTTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAACGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCCCCCACGTTACCCAACGTCCCCTGGCGCGTGCCATGGAAGATCAGCAGCACAGCGCGCCGCTGACCTGCGTCGGCGCGTTCGGTTCTATTTTACTGGCGCTGGCACGCCCGCCGGCGGGGATGGAGGCGCTCACCGGTACACTGGCAGGaca > 1:468371/1‑287 (MQ=255) cGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAACGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCCGGCGTGGATGGCGGCGCTGACCGGTACACTGGCGGGGAc > 1:123727/1‑289 (MQ=255) cGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGTTGGCGGCGCTGACCGGTACACTGGCGGGAAc > 2:649775/1‑289 (MQ=255) cGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCTGACCGGTACACTGGCGGGAAc > 2:479661/1‑289 (MQ=255) cGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCTGACCGGTACACTGGCGGGAAc > 2:391550/1‑289 (MQ=255) gTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCTGACCGGTACACTGGCGGGAAc > 1:455571/1‑288 (MQ=255) | AGGTTATGTTCAGGCAGTTGAAAAAAAACCTGGTTGCAACCCTCATTGCTGCTATGACCATTGGTCAGGTAGCCCCGGCGTTTGCCGACAGCGCAGACACCTTGCCGGATATGGGAACCTCCGCAGGAAGCACGCTTTCCATTGGTCAGGAAATGCAGATGGGCGACTATTATGTCCGCCAGCTACGCGGCAGCGCGCCGTTAATTAATGACCCGCTGTTAACGCAATATATTAATTCGCTGGGGATGCGTCTGGTTTCGCATGCCAATTCGGTTAAGACACCGTTTCATTTTTTTCTGATCAACAACGACGAAATTAACGCCTTTGCTTTCTTTGGCGGCAACGTGGTGCTGCACTCTGCCCTGTTCCGTTATTCCGATAACGAAAGTCAACTGGCTTCAGTTATGGCGCACGAAATCTCCCACGTCACCCAACGTCACCTGGCGCGAGCGATGGAAGATCAGCAGCGCAGCGCGCCGCTGACCTGGGTCGGCGCGTTAGGTTCTATTTTACTGGCGATGGCCAGTCCGCAGGCGGGGATGGCGGCGCTGACCGGTACACTGGCGGGAAC > NC_000913/2616087‑2616657 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |