| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 526,982 | A→T | 6.5% | N1241I (AAT→ATT) | rhsD → | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain, putative neighboring cell growth inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 526,982 | 0 | A | T | 6.5% | 218.0 / 4.5 | 61 | N1241I (AAT→ATT) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain, putative neighboring cell growth inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (23/34); new base T (2/2); total (25/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
CCGGAATACACACCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAA > NC_000913/526696‑527229 | ccGGAATACACACCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGACTGGGGCAACCAGCTTAATGAGGACAACCCGCATCATGTGTATCAGCCCTACCGTCTGCCCGGGCCGCCGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAA‑CGTCACCGGTACTACGATCCGTTCCAGGGTCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGTTTGCAAGGGGGATGGAAttt > 1:192269/1‑289 (MQ=255) cGGAAGACACGCCTGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCAGTGCGAGCACCGGGGACTTCCGCGGGGGCTTATCAGCTAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGaagt < 1:618859/288‑3 (MQ=17) acacCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCGTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGt < 2:627906/289‑1 (MQ=255) cacCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTa > 2:731799/1‑289 (MQ=255) ggCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCt > 2:609467/1‑289 (MQ=255) gAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTaaa < 2:710402/289‑1 (MQ=255) aaaGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATc < 2:529901/289‑1 (MQ=255) tCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTacaa < 2:587929/289‑1 (MQ=255) aCTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGa < 2:457909/289‑1 (MQ=255) ccgCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGGGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGAc < 2:258068/287‑1 (MQ=255) tGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGAc > 1:557078/1‑288 (MQ=255) gCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGAc > 2:520991/1‑287 (MQ=255) cctggggCTGCAGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCAACGGTACTACGAGCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGa < 2:376964/286‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTg < 1:71373/288‑1 (MQ=255) tCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGc < 2:397522/289‑1 (MQ=255) tGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACgggg < 1:609467/288‑1 (MQ=255) gaATGGGGCAGCCGGCTTAATGAGGGAAACCCGAACCATGTGTATCAGCCGTACAGTCTGCGAGGGCGGCAGAATGATCAGGAATCAGGGCGGTACAATAACCGCGACCGTGACGACGTTGCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGTACCCTATGGGGTTGAAAGGGTGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGGTTATTGCAGGCTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCgtt < 1:67738/289‑1 (MQ=255) aTGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCtt < 1:745139/286‑1 (MQ=255) aTGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCtt > 2:745139/1‑286 (MQ=255) aTGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTc > 2:90543/1‑288 (MQ=255) gggCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACg < 1:731799/288‑1 (MQ=255) gggCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACg < 1:90543/288‑1 (MQ=255) gggCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGGCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACg < 1:531693/288‑1 (MQ=255) ggCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGta > 2:676475/1‑289 (MQ=255) aTCAGGCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtg < 1:40743/288‑1 (MQ=255) gCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACg < 2:712729/246‑1 (MQ=255) gCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACg > 1:712729/1‑246 (MQ=255) ccGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGATTTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCt < 2:185525/207‑1 (MQ=255) ccGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGATTTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCt > 1:185525/1‑207 (MQ=255) agcaTGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACg < 1:520991/287‑1 (MQ=255) agcaTGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAA‑CGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACTCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCa < 2:192269/288‑1 (MQ=255) tgatgaGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAAt > 2:331186/1‑289 (MQ=255) gatgaGGAAACGAGGCTGTACTATAACCGTCACCGGGACTACGATCGGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATa < 1:462745/289‑1 (MQ=255) aTCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTa < 1:331186/289‑1 (MQ=255) gCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGt > 1:274298/1‑220 (MQ=255) gCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGt < 2:274298/220‑1 (MQ=255) gCTGTACTATAAACGTCAACGGTACTAAGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGAACCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTaa < 1:149524/288‑1 (MQ=255) tACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACg < 1:463812/200‑1 (MQ=255) tACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACg > 2:463812/1‑200 (MQ=255) aCTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAAtt > 2:582258/1‑119 (MQ=255) aCTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAAtt < 1:582258/119‑1 (MQ=255) ataACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGa < 2:557078/289‑1 (MQ=255) taACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCa > 2:207521/1‑261 (MQ=255) taACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCa < 1:207521/261‑1 (MQ=255) taACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGaa < 1:676475/289‑1 (MQ=255) ccGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTGTATGTAATGAAATGGAAt > 2:442944/1‑287 (MQ=255) gTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGATTTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATAc > 1:77271/1‑287 (MQ=255) gTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACg < 2:595822/190‑1 (MQ=255) gTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACg > 1:595822/1‑190 (MQ=255) aCCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtg < 1:605839/225‑1 (MQ=255) aCCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGAtg > 2:605839/1‑225 (MQ=255) aCCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACg > 2:40870/1‑251 (MQ=255) aCCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACg < 1:40870/251‑1 (MQ=255) ctacGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGATTTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTc < 2:77271/289‑1 (MQ=255) cGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGa > 2:72199/1‑289 (MQ=255) gTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGaaaa > 1:273093/1‑289 (MQ=255) aGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGc > 2:64243/1‑103 (MQ=255) aGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGc < 1:64243/103‑1 (MQ=255) aGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACg > 2:7416/1‑212 (MQ=255) aGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACg < 1:7416/212‑1 (MQ=255) gACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGaa < 1:147861/240‑1 (MQ=255) gACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGaa > 2:147861/1‑240 (MQ=255) | CCGGAATACACACCGGCGCGAAAAGCTCATCTTTATCACTGCGACCACCGGGGACTGCCGCTGGCGCTTATCAGCGAAGACGGCAATACGGCGTGGAGCGCGGAATATGATGAATGGGGCAACCAGCTTAATGAGGAGAACCCGCATCATGTGTATCAGCCGTACCGTCTGCCAGGGCAGCAGCATGATGAGGAATCAGGGCTGTACTATAACCGTCACCGGTACTACGATCCGTTGCAGGGGCGGTATATTACTCAGGACCCGATGGGGTTGAAAGGGGGATGGAATTTATATCAGTATCCTTTAAATCCACTACAACAAATTGACCCTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAA > NC_000913/526696‑527229 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |