| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458787 = | 4 (0.050) | 83 (1.010) | 60/278 | 0.2 | 95.5% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTA > NC_000913/458645‑458926 | gccaaCCGTGGCTGATTGAGGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAAGAATTAGCAATGGCCATACAGTTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTgg < 1:14329/140‑1 (MQ=255)ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtagtaccacaacccttaagttagcgcttatg < 2:1084132‑M1/1‑1 (MQ=255)ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatg > 2:502072‑M1/143‑143 (MQ=255)ccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatg > 2:449079‑M1/143‑143 (MQ=255) cctggcctgacgtgccgaagtatccagttcttcggccttaccaatatgggccagaattgctgaccagtgatcgtgagagtaacacatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaatatcacaacccttaagttagcgcttatgg > 1:1113237‑M1/142‑143 (MQ=255) ccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatggg > 2:294274‑M1/141‑143 (MQ=255) ccggcagtacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagctatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagatagcgcttatggg < 1:1106728‑M1/3‑1 (MQ=255) cattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccggtatgggccagaattgctgaccagttatcgtgggagtaattcatcggcacgttaaagcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGaaa > 1:128890‑M1/137‑143 (MQ=255) attacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggggtga > 2:392584‑M1/136‑139 (MQ=255) attacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAAc > 1:702784‑M1/136‑143 (MQ=255) attacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAAc > 2:1341031‑M1/136‑143 (MQ=255) tacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttacatcatatcaggcgtaattccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACAt > 2:747055‑M1/134‑143 (MQ=255) tGCTGGTGTAGGGAAAGGCGGGAGCGCACCAGGCGTCGGGGGAATAAGTAACCATTCCCCTACAATTGGCTAACGAAAAAGGGGGGAGTTTACCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATGCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAt < 1:717180/143‑1 (MQ=255) tGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAT < 2:1229179‑M1/143‑1 (MQ=255) gtgagggaggccacgcccgaagcgcaacaGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCC < 2:321943‑M1/129‑1 (MQ=255) tgattgatGGAAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC < 2:117769‑M1/143‑1 (MQ=255) tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGCAACATACC > 1:903822‑M1/1‑143 (MQ=255) gtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATccc > 2:693190‑M1/131‑143 (MQ=255) tgccgaagtatgcagttcttcgggcttacaaagatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATcccc > 2:1154609‑M1/130‑143 (MQ=255) cgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCata < 1:116630‑M1/17‑1 (MQ=255) gaagaatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccataagttagcgcttatGGGAAAACAACCACatat < 1:66525‑M1/18‑1 (MQ=255) gggcAAGCGGGAAGCGCAACAGGCATCTGGAGAGTAATTAACCATTCCCATACACGTAGTTGTCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcg < 1:506987‑M1/142‑8 (MQ=255) agtatccagttctgcgggcttaccaataggggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATAc > 1:1036077‑M1/124‑143 (MQ=255) gtatccagttctgcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtcattcatcggcccgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACt > 1:1008043‑M1/123‑143 (MQ=255) atccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcaggttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGa < 1:1319574‑M1/23‑1 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttattgtgggcgcaaatcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGAc > 2:330114‑M1/120‑143 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtacttcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaatactacaacccttaagttagcgcttatGGGGAACCATCCCCATATCCTGAc < 1:1381101‑M1/24‑1 (MQ=255) tccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGAc < 1:40008‑M1/24‑1 (MQ=255) aaGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaa < 1:773385‑M1/143‑12 (MQ=255) gAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaag < 2:245302‑M1/143‑18 (MQ=255) cgcAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggtt < 2:1183071‑M1/143‑22 (MQ=255) gggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTaa > 1:962157‑M1/109‑143 (MQ=255) gggcttaccaagatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTaa > 1:972524‑M1/109‑143 (MQ=255) gggcgtaccaatagggggcagaagtgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTaa > 2:713399‑M1/109‑143 (MQ=255) ggccctacctatatgggccagaattgctcaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcttaataccacaacccttatgttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTaa > 2:572220‑M1/109‑143 (MQ=255) ggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt < 1:515519‑M1/36‑1 (MQ=255) ggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaatacatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt > 2:1210298‑M1/108‑143 (MQ=255) ggcttaagaagatgggccagaatggctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcagatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt > 2:354120‑M1/108‑143 (MQ=255) cgcttaccaatctgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGTGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt > 2:653595‑M1/108‑143 (MQ=255) gcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATa > 2:30298‑M1/107‑143 (MQ=255) aaCAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaa < 2:263390‑M1/143‑25 (MQ=255) taccagtgtgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaaccctgaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGAt > 1:1208747‑M1/104‑143 (MQ=255) caatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatctgcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGc > 1:861462‑M1/101‑143 (MQ=255) caatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGc < 2:1045445‑M1/43‑1 (MQ=255) caatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGc < 1:148218‑M1/43‑1 (MQ=255) aatatgggccagaattgctgacaagttatcgggagagtaattcatcggcgcgttaaatcagatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCg > 2:909292‑M1/100‑143 (MQ=255) cTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTATTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa < 2:534085‑M1/143‑34 (MQ=255) atgggccagaattgctgaccagttatcgtaagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGCCGTACATGTTAATAGATGGCGTGa < 2:1194373‑M1/47‑1 (MQ=255) tgggccaggacggctcaccagttatcgtgatagtaattcatcggcacgttaaagcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGaa > 1:1417257‑M1/96‑143 (MQ=255) ggTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAGCATCCCatacgcgctgactttagggttgaaccatctaaaga > 2:485000‑M1/1‑108 (MQ=255) aataatTTACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAATAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATTCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc < 1:162897‑M1/143‑40 (MQ=255) cagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGcaca < 1:336907‑M1/53‑1 (MQ=255) ataatTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATATCACCTTTAATTTTTCATCTATTGTCGGCGTTGAAGGTGGGGGAAACATCCCataagagctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcg > 2:356884‑M1/1‑103 (MQ=255) ttAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGCTTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTTTTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagactgcgccgc > 1:754844‑M1/1‑99 (MQ=255) ttgctgaccagttatcgggagagtacttcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCgt > 1:12051‑M1/86‑143 (MQ=255) gctgaccaggtatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCgtgt > 2:1354381‑M1/84‑143 (MQ=255) ctgtccagttatcgtgcgagtaattgatccgcacgtgaaatcatatccggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGTGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTc > 1:427386‑M1/83‑143 (MQ=255) ctgaccagttatcgtcagagtaattcatcggcgcgttcaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACCTCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTc > 2:101025‑M1/83‑143 (MQ=255) tCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgccgcctctgtgc > 2:316783‑M1/1‑91 (MQ=255) cccATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcc < 2:820417‑M1/143‑54 (MQ=255) cagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCCTCTg < 2:1218902‑M1/66‑1 (MQ=255) cagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTg < 2:514435‑M1/66‑1 (MQ=255) ccatcaagatagttaacgaAATGGGGGGGATTGTGTCTCCGCTTTAATTTGTCCTCTATGCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcct < 1:485759‑M1/134‑55 (MQ=255) tgtaaaattagtTGATCAGAAAGGGGGGATGTTATCTCTACGTTAATTTATCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctc < 1:951187‑M1/138‑56 (MQ=255) gttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacagcccttaagttagcgcttatGGGGAAACAGCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGAt > 2:699943‑M1/76‑143 (MQ=255) aTACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcg < 2:1418178‑M1/143‑57 (MQ=255) aCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtt > 1:224100‑M1/1‑85 (MQ=255) catTAGTTAAGCAAATAGGGGGGATGTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCGCTATTCTCAGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaa < 1:445973‑M1/142‑61 (MQ=255) aagttgctctccaaagagggggGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaa < 1:492386‑M1/133‑61 (MQ=255) gTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagagga > 2:1275164‑M1/1‑78 (MQ=255) aCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatccgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcg > 1:1051475‑M1/1‑74 (MQ=255) cAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgtctcgttaagacgatgcctc < 1:338567‑M1/143‑72 (MQ=255) cAAAAAGGGGGGATGTTATCTCCCATCCAATTGTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGCAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctc < 2:731742‑M1/143‑72 (MQ=255) catcagcacttaaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTaaa > 1:248267‑M1/58‑143 (MQ=255) ggggATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttctt < 1:694114‑M1/143‑80 (MQ=255) cgtgaaatcatatcaggcggaataccacaagcctaaagttagcgctgatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCAAAGTCGGGTCATCTGATTACCTGGCGTAAATTAAACTAagaga > 1:552042‑M1/50‑143 (MQ=255) gttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAACCATCCCCATTTACTGACGTACATGTGAATAGATGTCGTGAAGCACAGTCGTGTAATCTGATTAACTGGAGGAAAATAAACTAagagag < 2:741581‑M1/95‑1 (MQ=255) gATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaa < 2:206376‑M1/143‑83 (MQ=255) gATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTAGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaa > 2:1382259‑M1/1‑61 (MQ=255) ctaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAagagaga > 2:965985‑M1/48‑143 (MQ=255) atcatatcaggcgtaataccgcagcccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGctc > 1:165361‑M1/44‑143 (MQ=255) tcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTCCCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGctct < 2:809633‑M1/101‑1 (MQ=255) tatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATg < 2:156344‑M1/104‑1 (MQ=255) ccTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgta < 2:1119413‑M1/143‑95 (MQ=255) ccTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgtttggta > 1:466658‑M1/1‑49 (MQ=255) caggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAAt > 1:627329‑M1/37‑143 (MQ=255) aggcgtaataccacaacccttcagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCCCAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGTGAATTACACTAAGACAGAGCTCTATGAATc < 2:293617‑M1/108‑1 (MQ=255) tAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgatgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggct < 2:1442376‑M1/143‑99 (MQ=255) gtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGa > 2:158975‑M1/32‑143 (MQ=255) acaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTg < 2:242380‑M1/120‑1 (MQ=255) tATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgctcttcaattgcgttttctaggctgtcagggatcct > 1:247869‑M1/1‑33 (MQ=255) cGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtccca > 1:271607‑M1/1‑27 (MQ=255) gTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttcagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggctactgtcccacgaa > 1:871871‑M1/1‑23 (MQ=255) ttGAAGGTGGGCGAAACATCCCatactccctaacttaacggttgaaccatctgaagcttgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaat < 1:608382‑M1/143‑122 (MQ=255) tGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatg < 2:828113‑M1/143‑123 (MQ=255) gcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATcccc > 2:515519‑M1/7‑143 (MQ=255) aTGTCGGGTAAACATCCCataagcgctaacttaagggtagaaccatctgaagactgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggcc < 1:1238395‑M1/143‑126 (MQ=255) tgtgGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcgtcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggcca < 2:15233‑M1/143‑127 (MQ=255) gtgGGGGAAGCATCCCataggcgctgacttaagggttggaccatctgaagagtgcgacgcctcggtgcctcgtgaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccac < 1:638613‑M1/143‑128 (MQ=255) gtgGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcatcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccac < 1:816276‑M1/143‑128 (MQ=255) | GCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTA > NC_000913/458645‑458926 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |