Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,532,593 | 0 | C | A | 18.1% | 207.1 / 4.7 | 88 | intergenic (‑156/‑223) | yhgE/pck | DUF4153 family putative inner membrane protein/phosphoenolpyruvate carboxykinase [ATP] |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (49/21); new base A (2/16); total (51/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.13e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGGTAGCAAACCAGACCCTGAAGTAATCCGGTAGCAATCATCCCCCAGCGTGTTGCGGGTGAAAGTTCAACGTTATCCATGTTGGTTATCCAGAATCAAAAGGTGGGTTAATTATCGCATCCGGGCAGTAGTATTTTGCTTTTTTCAG‑AAAATAATCAAAAAAAGTTAGCGTGGTGAA‑TCGATACTTTACCGGTTGAATTTGCATCAATTTCATTC‑AGGAATGCGATT‑C‑CA‑CTCACAATATTCCCGCCATATAAACCAAGATTTAACCTTTTGAGAACATTTTCCACACCTAAAATGCTATTTCTGCGATAATAGCAACCGTTTCGTG‑ACAGGAATCACGGAGTTTTTTGTCAAATATGAATTTCTCCAGATACGTAAATCTATGAGCCTTGTCGCGGTTAACACCCCCAAAAAGACTTTACTATTCAGGCAATACATATTGGCTAAGGAGCAGTGAAATGCGCGTT > NC_000913/3532358‑3532824 | agGTAGCAAACCAGACCCTGAAGTAATCCGGTAGCAATCATCCCCCAGCGTGTTGCGGGTGAAAGTTCAACGTTATCCATGTTGGTTATCCAGAATCAAAAGGTGGGTTAATTATCGCATCCGGGCAGTAGTATTTTGCTTTTTTCAG‑AAAATAATCAAAAAAAGTTAGCGTGGTGAA‑TCGATACTTTACCGGTTGAATTTGCATCAATTTCATTC‑AGGAATGTGATT‑C‑CA‑CTcac < 1:888872/236‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |