Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,155,280 | 0 | A | G | 3.7% | 362.2 / 2.4 | 120 | E94G (GAA→GGA) | argC | N‑acetyl‑gamma‑glutamylphosphate reductase, NAD(P)‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (59/55); new base G (2/3); total (62/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.76e-01 |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AGCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGG‑CATCGTTGATCTGCCGTTGCAGCCGATGTCGGATATCAGCGAGTTTAGCCCAGGGGTGGACGTAGTGTTTCTCGCCACCGC‑CCATGAAGTTAGCCACGATTTAGCGCCGCAGTTTCTTGAAGCGGGCTGCGTGGTGTTCGACCTTTCCGGCGCGTTTCGTGTTAACGACGCCACCTTCTATGAAAAATATTACGGCTTTACCCAT‑CAATACCCGGAACTGTTGGAACAGGCAGCCTACGGTCTGGCGGAGTGGTGCGGTAATAAATTAAAAGAAGCGAATTTGATTGCGGTGCCGGGCTGTTATCCGACGGCGGCACAGCTGGCGCTGAAACCGTTGATTGATGCCGATCTTCT > NC_000913/4155046‑4155514 | agCTAGTGACCTATGTAAATCGCCATCCGCATATGAACATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGG‑CATCGTTGATCTGCCGTTGCAGCCGATGTCGGATATCAGCGAGTTTAGCCCAGGGGTGGACGTAGTGTTTCTCGCCACCGC‑CCATGAAGTTAGCCACGATTTAGCGCCGCCGTTTCTTGAACCg > 1:387286/1‑239 (MQ=255) 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cATAACCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGG‑CATCGTTGATCTGCCGTTGCAGCCGATGTCGGATATCAGCGAGTTTAGCCCAGGGGTGGACGTAGTGTTTCTCGCCACCGC‑CCATGAAGTTAGCCACGATTTAGCGCCGCAGTTTCTTGAAGCGGGCTGCGTGGTGTTCGACCTTTCCGGCGCGTTTCgtg > 1:227701/1‑239 (MQ=255) aaCCGCTTTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGG‑CATCGTTGATCTGCCGTTGCAGCCGATGTCGGATATCAGCGAGTTTAGCCCAGGGGTGGACGTAGTGTTTCTCGCCACCGC‑CCATGAAGTTAGCCACGGTTTGAGGCCGCCGTTTCTTGAAGCGGGCTGAGGGGGGGTCGACCTTTCCGGCGCGTTTCGTGttg > 2:366654/1‑238 (MQ=255) aaCCGCTGTGACTGTTTCAGCGCAAAGCAATGATGCGGGAAAGTTAATCTCCGATTTGCATCCGCAGCTAAAAGG‑CATCGTTGATCTGCCGTTGCAGCCGATGTCGGATATCAGCACGGTTAGCCCAGGGGTGGAGGAAGTGTTTCTCGCCACCAC‑CCATGAAATCAGCCACGATTTAGCGCCGCCGTTTCTTGAAGCGGGCTGCGTGGGGTTCGGCCTTTCCGGCCCGTTTCGTGTTa > 2:848800/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |