Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,431,464 | A→T | 12.9% | I806F (ATT→TTT) | stfR → | Rac prophage, putative tail fiber protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,431,464 | 0 | A | T | 12.9% | 224.3 / 2.0 | 92 | I806F (ATT→TTT) | stfR | Rac prophage, putative tail fiber protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/26); new base T (2/11); total (54/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.29e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAGGTG‑ATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGC‑CAAGACGGGTTTC‑TGGTGTT‑GAGT‑TTGATGGTTCCAAAGATA‑TTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGATACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGCGACAGCTATATTCTGGTTAACTTCTATACCGGAGTCGGAAGTTGCCGGACCCTGCAGATGAAGGCGCATTACAGAAATGGTGGTCTGTTCTACCGTTCTTCAAGAGACGGTTATGG > NC_000913/1431228‑1431702 | gggAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAGGTG‑ATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGC‑CAAGACGGGTTTC‑TGGTGTT‑GGGT‑TTGATGGTTCCAAAGATA‑tt > 1:689418/1‑239 (MQ=255) tATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAGGTG‑ATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGC‑CAAGACGGGTTTC‑TGGTGTT‑GAGT‑TTGATGGTTCCAAAGATA‑TTCCttt > 1:354402/1‑239 (MQ=255) tATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAGGTG‑ATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGC‑CAAGACGGGTTTA‑TGTGGTT‑GAGG‑TTGATGGTTCCAAAGATA‑TTACttt > 2:670415/1‑239 (MQ=255) tGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAGGTG‑ATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGC‑CAAGACGGGTTTC‑TGGGGTT‑GAGT‑TTGATGGTTCCAAAAAAA‑TAACTATAAcc > 2:537585/1‑238 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |