Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,720,129 | 0 | C | T | 14.2% | 209.3 / 6.3 | 89 | S85F (TCT→TTT) | slyB | outer membrane lipoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/48); new base T (11/2); total (39/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.64e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGTTGTTTCAATGGTAGGTCTGTCTCTTGTCGGTTGTGTTAATAACGACACCCTGTCAGGGGATGTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTAT‑GGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTT‑GGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTTCTCTGG‑CTACTGCAGCAGGCGCTGTTGCA‑G‑GTGGCGTAGCTG‑GTCAGGGCGTA‑CAGAGTGCAATGAACAAAACGCAGGGTGT‑CGAGCTGGAAATTCGTAAAGA‑CGATGGTAAT‑ACCATCATGGTGGTACAGAAACAAGGCAACACTCGTTTCTCTC‑CGGGCCAACGTGTCGTACTGGCCAGCAATGGCAGTCAGGTGACCGTTTCTCCGCGCTAAATAAGTTTGCGTGTGGTC > NC_000913/1719892‑1720361 | tGGTTGTTTCAATGGTAGGTCTGTCTCTTGTCGGTTGTGTTAATAACGACACCCTGTCAGGGGATGTTTATACCGCTTCTGAAGCGAAACAAGTACAGAATGTCAGCTAT‑GGCACCATCGTTAACGTACGTCCGGTACAGATTCAGGGCGGTGATGATTCCAACGTTATCGGTGCAATTGGCGGTGCTGTTCTT‑GGTGGTTTCCTGGGGAATACTGTTGGTGGCGGAACCGGGCGTtct < 1:809502/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |