| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 2 (0.020) | 111 (0.970) | 68/426 | NT | 98.2% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑483) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293268‑1293032‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATG < NC_000913/1979270‑1979033 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCCCAAGG > 1:1198556/1‑239AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGGCTTTTTTGGCTAATTTTATGAAAAGAAATTTATTGGCGGCAAAAGG > 2:20961/1‑239 TCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑G > 1:207745/1‑239 CCATGCTCTTATTGCGACGGTGCGTCTTTTCATCAATCGCTTAATAGGGAATCCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACGGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑G < 1:738958/238‑1 ATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAAAAATTTATTGTCGGAACAAGGG‑GATG > 2:648500/1‑239 ttcttttttttcgcaTGTTTTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGCCTGAAAGGTCGTCCGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGC < 2:1254007/224‑1 tttgGACTGTTTTTCTTTTCAGCATTCGCTTAATAGGGAATTCCCGTAAACACAACTAATACAGAAGGCTGAAAGGTCGGCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACT < 2:207745/235‑1 tggtcttttctttTTTTCATCATTTGCTTAATAGGGAATTCCCGGAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTCCGATAATCCCCCCATAAAAGGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTA < 2:1214239/226‑1 gacgctttttcaatttttcttATTCGCTTAAAGTGGAAATCTCGTAAACACAAATAATACAGAAGACGTAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCGCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTA < 2:502629/218‑1 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CATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAACTCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGAGATTTATTGACGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTCTTGATTTTGTGTATGAT > 1:50782/1‑239 CATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAATGTATttt > 1:193903/1‑236 CATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:1268942/228‑1 CATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:1268942/1‑228 CATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGG‑GATGCTGCCACCTTTCTAATTTAGTGTATGAT > 2:815980/1‑239 taATTCGCTTAAAAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAAAACAGAAGACTGAAAGGGCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAACCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 2:928671/237‑1 TTCGCTTAATAAGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCCCAAGGG‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGGGTATGATGGggg > 1:34849/1‑236 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atTAATACAGAGGATGTGAAGCTCGTCAGCCTACCATAATCTCCCGAGAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGGCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 2:360773/237‑1 GAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCCCAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTTTGGTTTGATGGTGTTTTTTGGGTGCTCCCGTGGGCTCTGTTTTTTTTAGCTt > 2:825104/1‑237 GAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGCTTTAGTGTATGATGGGGTTTTTTGGGGGCTCCAGGGGCTTCTGTTTTTATaaagtg > 2:932884/1‑232 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< 1:1135143/239‑1 aaaaggggtaAAATAGGGCTTTTTGCCGGGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATTTTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGGGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGGCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCG < 2:1090775/227‑1 CATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAA < 1:20961/239‑1 TCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGGGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGGGCGT‑AACGGCAAAACCACCGCCGGACCTCAACGCTATaccccgtcccttatacaca > 2:388090/1‑217 AATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATAGTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGGCATCAGCGCTATCTCTGCTCTCAC < 1:788877/221‑1 GGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 2:605685/1‑93 GGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATCTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:605685/93‑1 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCCCAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTAAGCTCCTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGCCATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTcccg > 1:1338194/1‑235 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTTCCGTAAAACATGGCctgaccct > 1:1090775/1‑231 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAG > 1:1251339/1‑239 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGGGGGTCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCCATCTCTGCTTTCACTGCCGTCAAACATGGCAACTcacg > 1:20223/1‑235 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC > 2:527057/1‑154 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT < 1:561200/110‑1 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:1330249/92‑1 GCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 2:1330249/1‑92 cttttTGCCGGGTTTTTTTGGGCTAATTTTTTGAAAAGATTTTTATTGGGGGCACAAGGT‑GTGGCTCCCAACTTACTGATTTAGTGTATGTTGGTTTTTTTGAGGTGCCCCAGGGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGCCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAG < 2:276561/233‑1 TATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT > 1:140924/1‑190 TATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCGGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACAT < 2:140924/190‑1 CGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTAC > 1:469130/1‑239 ctttttttttgtttttTTTTATGAAAAGTTTTTTGTTGGGGGCCAAGGGT‑GATGCGCCCAACTTTCTGATTAAGTGTATGATGGTGTTTTTGGGGTGCCCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCCCCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACAC < 2:20223/223‑1 CGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTTATTTAGTGTATGCTGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTGTCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAACGACGGGGGGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCCCCCCCGGACCTCATCCCTATCTCTGTTCTCACTGCCGTAAAAAACGGCCACTGCCGCTCCCTTTCA > 2:183429/1‑238 CGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCCCTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTAaa > 1:128186/1‑236 CGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACA > 1:623501/1‑238 CGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGG‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCCCCGCCGGACATCAGCGCTCTCTCTGCTCTCACTGCCGTAAACCATGGCACATGCAGTTCCCTTCCA > 1:1209080/1‑238 CTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < 2:1079681/133‑1 CTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGGTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT > 1:1079681/1‑133 TTTTTTGAAAAGTTTTTTTTTGGCGG‑ACAAAGTGGGTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAGGGTGTTTTTGGGTTGCTACAGGGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTCCAGCTACTGACGGGGTGGGGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGT < 2:544086/239‑1 tttAAAAGTTTTTTTTTGGGGGGAAAAGGT‑GGTGCTGCCAACTTTCCGGTTTAGTGTAGGAGTGTGTTTTTGGGGTGCCCCAGGGGCTTTGGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGC < 2:963109/236‑1 gGATTTTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGGGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTTGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGA < 1:303165/238‑1 attTTTATTGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTA < 1:510006/225‑1 TGGCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGA > 1:540914/1‑239 GCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGGCGCGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAACCACCGCCGGCCCTCACCGCTCTCTCTGCCTCCCCTGCCGTAAAACATGGCAACTGCCGTTCACTTACACCCCTTCTCAAACCCGTAAGCCCCAAAAAAAAATTTATA > 2:356302/1‑239 GCGGCACAAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGGCATCTGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGACACTGCCGTTCACTTACCCCGCTACTCAACCCGGGAAGCACCAAAAAATgcctctta > 2:510006/1‑231 tgagtgAGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACAC < 1:741422/193‑1 AGGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGAAGTTCACTTACACCCCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGCAAAACATTGATAAGGCCATt > 2:771599/1‑238 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293268‑1293032‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGT‑GATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT‑AACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATG < NC_000913/1979270‑1979033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |