Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 173,223 | A→G | 8.3% | S588G (AGT→GGT) | fhuB → | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 173,223 | 0 | A | G | 8.3% | 290.0 / 3.6 | 112 | S588G (AGT→GGT) | fhuB | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/54); new base G (10/2); total (56/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.37e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GACCTGGATTTCCGGTTCGACCTACAACGCGACCGATGCGCAGGTCTGGCGCACCGGAATTGTGATGGTGATTTTGCTGGCGATTACCCCG‑CTGTGCCGCCGCT‑GGCTGACCATTTTACCGCTGGGTGGTGATACCGCCCGAGCCGTA‑GGAATGGCGCTGACGCCGACGCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGCGACGATGACTATTGGACCGTTGAGTTTTGTTGGTTTAATGGCACCGCATATTGCGCGGATGATGGGCTTTCGACGGACGATGCCACACATCGTAATTTCGGCGCTGGTGGGTGGTTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGGCTGCTGTCAACCTTTATCGGCGCGCCATATTTTATCTATTTGTTGAGAAAGCAGAGCCGTTAATTTTTCCATATAACGG > NC_000913/172988‑173460 | gACCTGGATTTCCGGTTCGACCTACAACGCGACCGATGCGCAGGTCTGGCGCACCGGAATTGTGATGGTGATTTTGCTGGCGATTACCCCG‑CTGTGCCGCCGCT‑GGCTGACCATTTTACCGCTGGGTGGTGATACCGCCCGAGCCGTA‑GGAATGGCGCTGACGCCGACCCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGCGACGATGACCATTGGGCCGTGGAGtt > 1:1319852/1‑239 (MQ=255) 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a‑GGAATGGCGCTGCCGCCGACGCGAATTGCGCTGCTTCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGCGACGTTGACTATTGGACCGTTGAGTTTTGTTGGTTTAATGGCACCGCATATTGCGCGGATGATGGGCTTTCGACGGACGATGCCACACATCGTAATTTCGGCGCTGGTGGGTGGTTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATc < 1:1158788/238‑1 (MQ=255) ggCGCTGACGCCGACGCGAATTGCGCTGCTGCTGTTAGCGGCTTGCCTGACGGCGACCGCGACGATGACTATTGGACCGTTGAGTTTTGTTGGTTTAATGGCACCGCATATTGCGCGGATGATGGGCTTTCGACGGACGATGCCACACATCGTAATTTCGGCGCTGGTGGGTGGTTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGGGTGGGCGGATGGGGCTGTTTCCATTCCAGATCCcggcgg > 1:184014/1‑239 (MQ=255) ggggcgtcggcggggatggcgcTGCTGCTGTTGGCGGGTTGCCTGACGGCGACCGCGACGATGGCTATTGGACCGTGGAGTTTTGGTGGTTTAATGGCACCGCATATTGCGCGGATGATGGGCTTTCGACGGACGATGCCACACATCGTAATTTCGGCGCTGGTGGGTGGTTTACTGCTGGTGTTCGCTGACTGGTGTGGGCGGATGGTGCTGTTTCCATTCCAGATCCCGGCGGGgc < 2:276151/220‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |