| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,853,014 | 0 | A | C | 10.1% | 389.9 / 2.9 | 174 | H294P (CAC→CCC) | hypD | hydrogenase maturation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (72/68); new base C (8/22); total (80/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.57e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CCAGCGATTTTCATCGTCCGCTGGTGGTTGCTGGATTCGAACCCCTTGATCTACTACAAGGCGTGGTCATGCTGGTGCAGCAGAAAATAGCGGCCCACAGCAAGGTAGAGAATCAGTATCGTCGAGTGGTACCGGATGCCGGTAACCTGCTGGCGCAACAGGCGATTGCCGATGTGTTCTGTGTCAACGGCGACAGCGAATGGCGCGGCTTAGGCGTGATTGAATCTTCTGGCGTGCACCTGACGCCGGATTATCAACGATTCGATGCCGAAGCACATTTCCGCCCGGCACCGCAGCAGGTCTGCGATGACCCGCGCGCGCGTTGTGGTGAGGTATTAACGGGCAAATGTAAGCCGCATCAATGCCCGCTGTTTGGTAACACCTGTAATCCTCAAACCGCGTTTGGTGC‑GCTGATGGTTTCCTCCGAAGGAGCGTGCGCCGCGTGGTATCAGTATCGTCAGCAGGAGAGTGAAGC > NC_000913/2852777‑2853251 | tCCGGTGGTGGTTGCGTGATTCAAACCCCTTGAGCATCTACAAGGCGGGGTCATGCTGGTGCAGCAGAAAATAGCGGCCCACAGCAAGGTAGAGAATCAGTATCGTCGAGTGGTACCGGATGCCGGTAACCTGCTGGCGCAACAGGCGATCGCCGATGTGTTCTGTGTCAACGGCGACAGCGAATGGCGCGGCTTAGGCGTGATTGAATCTTCTGGCGTGCACCTGACGCCGGATTATc < 2:218875/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |