Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,027,729 | 0 | A | G | 15.5% | 269.7 / 6.0 | 124 | E204G (GAG→GGG) | ghxQ | guanine/hypoxanthine permease, high affinity, guanine/hypoxanthine:H+ symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/64); new base G (18/4); total (56/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.00e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGG‑CCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGCGGGATCTTGTTGGTGATTATTGCAATTTCGATCATCGGCTTAATCTTTGACCCAGCGGTG‑AAATACCACGGTCTGGTGGCGATGCCAAGCCTGACTGGCGAAGATGGTAAGTCTCTGATTTTCAG‑CCTC‑GATATTATGGGTGCACTCCAGCCAACTGTACTTCCGAGTGTACTGGCATTGGTGATGACCGCAGTGTTCGACGCTACTGGC > NC_000913/3027492‑3027958 | tcctttgcccccccctttCCGTTACCGGTGGGGGTTCCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCCCGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGG‑CCTGgag < 2:1005859/224‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |