| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,076,757 | T→C | 11.4% | E233G (GAG→GGG) | yggP ← | putative Zn‑binding dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,076,757 | 0 | T | C | 11.4% | 261.4 / 3.2 | 104 | E233G (GAG→GGG) | yggP | putative Zn‑binding dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/37); new base C (5/9); total (56/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.53e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
ACGACGTGCGTGCTGTTGTAATGGACGTTGTAGAAATTAAACGGCACTTTGAAGTTTTTATCCGTCGGCCCGGCAAAGAAGTTCAGACAGCCATCTTCCGCCAGTAATT‑CATCAGCCATCTCAACGACAGCAGGCACCGCCGCATAAACAAAAATGTCATCGAA‑CCCGGCATCTCCTGTCAGCGCCCGCAGCATCTGGACAGGATCGCTCATCCCTTTGGTATTCACATACA‑CCAGCTCAATGCCTTTACTGGCCGCCAGTTCCACCGGCAGCAGCTTC‑TGTACCTGCGCCAGACGTTTGTCGTCGATATCGACCACCACCACCCGCGACGGTTGTATGCCGCCGTTAATGGCGTAATCGATAGCGCCAATGCCCATCGGACCTGCACACGCCAGCAGTGCAATATTGCCGCCAGG‑TTTGACGCCCATGCGATGCTCATAAACATATTGCGTGGTGTGATAATTGGCATGATAAGC > NC_000913/3076520‑3076995 | acgacgTGCGTGCTGTTGTAATGGACGTTGTAGAAATTAAACGGCACTTTGAAGTTTTTATCCGTCGGCCCGGCAAAGAAGTTCAGACAGCCATCTTCCGCCAGTAATT‑CATCAGCCATCTCAACGACAGCAGGCACCGCCGCATAAACAAAAATGTCATCGAA‑CCCGGCATCTCCTGTCAGCGCCCGCAGCATCTGGACAGGATCGCTCATCCCTTTGGTATTCACATACA‑CCAGCTc > 1:917417/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |