Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,480,841 | G→C | 12.7% | R107G (CGT→GGT) | kefG ← | potassium‑efflux system ancillary protein for KefB, glutathione‑regulated |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,480,841 | 0 | G | C | 12.7% | 297.0 / 2.8 | 119 | R107G (CGT→GGT) | kefG | potassium‑efflux system ancillary protein for KefB, glutathione‑regulated |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (70/31); new base C (4/14); total (74/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.13e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCGGCCTCCTGGAGACAGCGGATTTGCCAGCCAGTCACCGTAGGCTCTGGCGTGGCTCGCCAGCTCCTGTGCGCTTTGCCGTCT‑CG‑CCCA‑GTAAATAATGATGGGACTTAA‑CCAA‑TGCATCCGGCACATGCCC‑GC‑CGCCAGT‑TCAAAGGGGCG‑CAGCACATCGCTCATCGGGTAGCGATT‑CAGCGCGTCATAACGGTAAGCACTTTCCGGCT‑CGCCGGTGGTAATCACGCTA‑CGCC‑AGTACTTTCCCGCCAGTTGGTTTCCTCCCGGCCCGCTGGCAAAACCACGACTTAATACCCGGTCCAGC‑CACTCTTTCAGTAGCGCCGGGCAGCTATAGGTATAAAGAGGATGCTGAAAGACAATCACCTCGTGCTCGCGCAGTAATGCCTGCTCACGGGGGATATCAATAAAAAAATCGGGATAGTGCGCGTAAAGGTCGTGCACGGTAACATTGCTGAGCTGCGTGGCCGGTTTA > NC_000913/3480608‑3481079 | gCGGCCTCCGGGAGACAGCGGATTTGCCAGCCAGTCACCGTAGGCTCTGGCGTGGCTCGCCAGCTCCTGTGCGCTTTGCCGTCT‑CG‑CCCA‑GTAAATAATGATGGGACTTAA‑CCAA‑TGCATCCGGCACATGCCC‑GC‑CGCCAGT‑TCAAAGGGGCG‑CAGCACATCGCTCATCGGGTAGCGATT‑CAGCGCGTCATAACGGTAAGCACTTTCCGGCT‑CGCCGGTGGTAATCACGCTA‑CGCC‑AGt < 1:682445/239‑1 (MQ=255) aGCGGATTTGCCAGCCAGTCACCGTAGGCTCTGGCGTGGCTCGCCAGCTCCTGTGCGCTTTGCCGTCT‑CG‑CCCA‑GTAAATAATGATGGGACTTAA‑CCAA‑TGCATCCGGCACATGCCC‑GC‑CGCCAGT‑TCAAAGGGGCG‑CAGCACATCGCTCATCGGGTAGCGATT‑CAGCGCGTCATAACGGTAAGACCTTTCCGGCT‑CGCCGGTGGTAATCACGCTA‑CGCC‑AGTACTTTCCCGCCAGTTg > 1:472438/1‑239 (MQ=255) aGCGGATTTGCCAGCCAGTCACCGTAGGCTCTGGCGTGGCTCGCCAGCTCCTGTGCGCTTTGCCGTCT‑CG‑CCCA‑GTAAATAATGATGGGACTTAA‑CCAA‑TGCATCCGGCACATGCCC‑GC‑CGCCAGT‑TCAAAGGGGCG‑CAGCACATCGCTCATCGGGTAGCGATT‑CAGCGCGGCATAACGGTAAGCACTTTCCGGCT‑CGCCGGGGGTAATCACGCTC‑CGCC‑AGGCCTTTCCCGCCAGTTg > 1:1188002/1‑239 (MQ=255) aGCGGATTTGCCAGCCAGTCACCGTAGGCTCTGGCGTGGCTCGCCAGCTCCTGTGCGCTTTGCCGTCT‑CG‑CCCA‑GGAAATAATGATGGGACTTAA‑CCAA‑TGCATCCGGCACATGCCC‑GC‑CGCCAGT‑TCAAAGGGGCG‑CAGCACATCGCTCATCGGGTAGCGATT‑CAGCGCGTCATAACGGTAAGCACTTTCCGGCC‑CCCCGGTGGCAACCACGCCA‑CCCC‑CAGACTTTCCCGCCCGTTg > 2:1195588/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |