| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,511,158 | A→C | 10.7% | V88G (GTG→GGG) | yhfY ← | PRD domain protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,511,158 | 0 | A | C | 10.7% | 277.8 / 4.2 | 107 | V88G (GTG→GGG) | yhfY | PRD domain protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/30); new base C (2/15); total (60/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.33e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
AGTGCGGCGGAAATCAGCGCCGGGTTCTGGCGTTTCAATGCTTCTACAAACATCTTGTTGCCTCGTTTCTGTTCCTTGAATTAAATATTCATTTTTTTGAATATTTAGGTTGTGCGACGTGGATTTGTCGGGAGCTTCAAACCTCTTCGTTAGCAGCCATCCATAATCCATAAAGGTTGGCCAGCAAATAGCCTTCTTCACACGGGTTAACTTCCAGTGCGAATTCCTTCAACAACACCTGAT‑GCAATTGCACAACGGCTTGCCAGTGGCTGGATTGCGCCAGTTCTGCCAGCAACTCGTTATCCAGCGGCTCTATTTCTTCACCACGGCGAC‑TGCGCATCAGTGCACTC‑GCCA‑TATGTGTCATCGCCATCGTTCCTTGCTCACTGCGCACCGGCAGATGGCACTCTGTTTCCAGTACGTTGACGACCTGCATCATGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCA > NC_000913/3510922‑3511396 | aGTGCGGCGGAAATCAGCGCCGGGTTCTGGCGTTTCAATGCTTCTACAAACATCTTGTTGCCTCGTTTCTGTTCCTTGAATTAAATATTCATTTTTTTGAATATTTAGGTTGTGCGACGTGGATTTGTCGGGAGCTTCAAACCTCTTCGTTAGCAGCCATCCATAATCCATAAAGGTTGGCCAGCAAATAGCCTTCTTCACACGGGTTAACTTCCAGTGCGAGTTCCTTCAacaaca > 1:569617/1‑237 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |