Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,382,745 | A→G | 14.5% | G34G (GGA→GGG) | epmA → | Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,382,745 | 0 | A | G | 14.5% | 283.6 / 4.9 | 117 | G34G (GGA→GGG) | epmA | Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (23/70); new base G (19/2); total (44/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TTAATTTAATTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCT‑CGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAACGCGCGGCGATTATGGCGGAGATCCGTCGTTTCTTTGCCGATCGTGGAGTGCTGGAGGTGGAGACGCCTTGTATGAGCCAGGCGACGGTAA‑CCGATATTCA‑TTTG‑GTCCCGTTTGAGACAC‑GTTTCGTTGGCCCCGGGCATTCGCAGGGGATGAATCTCTGGTTAATGACCAGCCCGGAATACCATATGAAACGCCTG‑CTGGTTGCCGGTTGTGGGCCGGTATTCCAGCTGT‑GCCGCAGCTTCCGTAATGAAGAGATGGGGCGTTATCACAACCCTGAG > NC_000913/4382508‑4382976 | ttaatttaatTACTAAACCATCAGATCGTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATTTGTCT‑CGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAACGCGCGGCGATTATGGCGGAGATCCGTCGTTTCTTTGCCGATCGTGGa < 1:845301/238‑1 (MQ=255) atttaatttaTAAACCATTAGATCGTGCTTTTTTTAGGTCCGGCCCCCCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAATGTGGCC‑CGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGGCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAACGCGCGGCGATTATGGCGGAGATCCGTCGTTTCTTTGCCGATCGTGGAGTGc < 2:76651/239‑1 (MQ=255) atttaattTCTAAACCCTCAGATCTTGCTTTTTTTAGTCACTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCGTAAAAGTTGTCT‑CGCCGTCTCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAACGCGCGGCGATTATGGCGGAGATCCGTCGTTTCTTTGCCGATCGTGGAGTGc < 2:1024660/239‑1 (MQ=255) atttaattTCTAAACCATCAGATTGTGTTTTTTTTAGTCCCTGCCCACCGCTGTTTGATTCCTGCTTAAAATTTGGCT‑CGCCGTCGCGTTGCGAGTAGACTTCGTGCCCTTGTCAAAAACTGGAGATTTAACTATGAGCGAAACGGCATCCTGGCAGCCGAGCGCATCCATTCCTAACTTATTAAAACGCGCGGCGATTATGGCGGAGATCCGTCGTTTCTTTGCCGATCGTGGAGTGc < 2:1289691/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |