| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 4,609,768 | T→G | 14.5% | G118G (GGT→GGG) | prfC → | peptide chain release factor RF‑3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,609,768 | 0 | T | G | 14.5% | 284.0 / 3.3 | 141 | G118G (GGT→GGG) | prfC | peptide chain release factor RF‑3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (61/49); new base G (22/6); total (86/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.08e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TCAGACCGCCGGTACAGTAAAAGGCCGTGGTTCCAACCA‑GCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCT‑CCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCACGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACA‑CGCC‑GATCCTCA‑CCTTTATGAACAAAC‑TTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTATCTCTATCAGAGCGGTA > NC_000913/4609534‑4610003 | tCAGACCGCCGGTACAGTAAAAGGCCGTGGTTCCAACCA‑GCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCT‑CCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCACGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGCAACCCCGGGGCACGACGACTTCTCGGAAGATACCTACCGTACCCTGCCGCCGGTGGCCTGCTGCCCGTTGGTTATCCACGCAGCCAAAGGGGTTg > 2:891104/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |