Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 855,390 | 0 | T | G | 13.6% | 331.0 / 3.9 | 130 | T119P (ACC→CCC) | ldtB | L,D‑transpeptidase linking Lpp to murein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/68); new base G (23/2); total (60/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.38e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GGTGCCATGGATAGCATACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGACAGCCGGAAGCGGTTCGCCCGCAGCGCGGTACTCTGCGTGCATTTTGGCGGTCGGCGTC‑CAGGTCGGGCCTGCTTTTTT‑ACGCTCAACTTTGGTGGTCCAGTTGATAGGCGTATCTTTGCCTAACTGACCAATGCCGATCGGCAGCACGATAACGGTGTTGGTCCC‑TTTCGGATAGTAATAAAGACGCATCTCAGCACTGTTAATGACGATGCCTTCATGAACGGTATCCGGCAGGATCAGCTGCTGCGGAATGTTCAGTACAGTACCGCCTTTCGGCAGGAAGGTATCCACACCCGGGTTCGCTTCCATCATATTGGAAAGCCCCATCTGGTACTCGGCGGCAAAATACTCCAGCGGCTGAGTGTTACCTTCAGGAATGGTGATCACCTGAT > NC_000913/855157‑855626 | ggTGCCATGGATAGCATACAGGCGACCGATATAGAGTGCATACAGCCCCATCGGGTTATCCGGACCTGCCGGAACGACAGCCGGAAGCGGTTCGCCCGCAGCGCGGTACTCTGCGTGCATTTTGGCGGTCGGCGTC‑CAGGTCGGGCCTGCTTTTTT‑ACGCTCAACTTTGGTGGTCCAGTTGGTAGGGGGATCTTTGCCTAACTGACCAATGCCGGTCGGGAGAACGAAAAAGGGGGTgg > 2:370484/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |