Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 921,692 | 0 | T | G | 14.1% | 244.1 / 5.8 | 111 | V449G (GTG→GGG) | macB | macrolide ABC transporter peremase/ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/46); new base G (16/3); total (62/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.20e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAAACACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCC‑CATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGA‑AAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGC‑GTGTCTGGCTACCTTACAGCACGATGTCCGGGCGAGTTATGGGCCAGTCGTGGCTTAACTCCATTAC‑TGTCAGGGTGAAAGAAGGATTTGACAGCGCCGAGGCGGAACAGCAACTCACGCGTTTACTTTCACTGCGCCACGGAAAGAAGGATTTCTTTACCTGGAACATGGACGGCGTCTTGAAAACTGTTGAAAAGACCACACGTACTTTACAACTGTTTCTGAC > NC_000913/921459‑921923 | cGTGAGCGGCGATTATTTTAATGTCTATGGCATGACCTTCAGTGAAGGAACCACCTTTAATCAGGAGCAGCTGAACGGTCGTGCGCAGGTCGTGGTTCTCGACAGTAATACTCGCCGCCAGCTTTTCCCC‑CATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGA‑AAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGtgctg < 1:434336/238‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |