Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 983,035 | 0 | T | G | 16.2% | 265.0 / 4.1 | 124 | intergenic (+141/‑40) | ldtD/ycbK | murein L,D‑transpeptidase/M15A protease‑related family periplasmic protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/46); new base G (22/4); total (74/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGACACTCAATAATCTTCATACCGGAGAGTCAATCAAAGCGGAGTTTTTCGATGGCAGAGGCTATATTCAGGAAGAA > NC_000913/982804‑983269 | tACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCAtata < 2:924238/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |