| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1979489 | 0 (0.000) | 57 (0.620) | 40/430 | NT | 100% | intergenic (‑274/‑264) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein |
| ? | NC_000913 | = 2290111 | NA (NA) | intergenic (‑32/+1) | insH1/yejO | IS5 transposase and trans‑activator/pseudogene, autotransporter outer membrane homology,putative transport, Not classified, putative ATP‑binding component of a transport system | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAA‑CCCTGTTCTATGGCTCCAG‑ATGACAAACATGATCTCATATC‑AGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGCCACCAGAACAGATATTGCGGAACGACAAAGAGAAACAGAACCAGATTGATGCATTGAGCTTTCATCCTATGAAATTAATTGCTGTTAAAAGCATTGGGTACAGAAAATACCCATAGCTCCATACCCGGAGTCAGTTTTTAAAAACTGTTTAAAGAAATGCACAAGTATTGTGATTGATTTTTTAGTTGTTTTTCTTGATGAGAAGCTGATGCAAAATTCCG > NC_000913/2289875‑2290345 | gCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAA‑CCCTGTTCTATGGCTCCAG‑ATGACAAACATGATCTCATATC‑AGGGACTTGTTCGCACCTTCCAt < 1:924057/239‑1 (MQ=11) ggATAAGGGCGCCGGCCATTACCAGGCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAA‑CCCTGTTCTATGGCTCCAG‑ATGACAAACATGATCTCATATC‑AGGGACTTGTTCGCACCTTCCa < 1:245000/236‑1 (MQ=11) tAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAA‑CCCTGTTCTATGGCTCCAG‑ATGACAAACATGATCTCATATC‑AGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACg < 1:879248/238‑1 (MQ=32) ccccGGCCTTTTCCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAA‑CCCTGTTCTATGGCTCCAG‑ATGACAAACATGATCTCATATC‑AGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACGCTGTAGc < 2:989289/237‑1 (MQ=25) 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gCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACCCATGATGAA‑CCCTGTTCTATGGCTCCAG‑ATGCAAAACATAATCCCATATC‑AGGGACTTGTTCGGACCTTCCATAAccacaaaaccccacaaacagaaat > 2:368617/1‑216 (MQ=11) ccTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGCAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGCATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGACGACTCCTGATGAA‑CCCTGTTCTATGGCTCCAG‑ATGCCAAACATGATCTCATATC‑AGGGACTTGTTCGCACCTTCCCAAACCCTTGAGCCACCAAAACAGacaat > 2:374311/1‑235 (MQ=11) ccTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAA‑ACCTGTTCTATGGCTCCAG‑ATGACAAACATGATCTCATATC‑AAGGACTTGTTCGCACCTTCCATAACCCTTCAGCCACCACAACAgcaatt > 1:553733/1‑234 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |